Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489818
• Subject: NM_010157.3
• Aligned Length: 1656
• Identities: 1352
• Gaps: 75

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGGATATAAAAAACTC  17
                                                                     |||||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGTCCATCTGTGCCTCTTCTCACAAGGATTTTTCTCAGCTGAGACCTACGCAAGACATGGAGATCAAAAACTC  74

Query   18  ACCATCTAGCCTTAATTCTCCTTCCTCCTACAACTGCAGTCAATCCATCTTACCCCTGGAGCACGGCTCCATAT  91
            ||||||.|||||||.|||.|||.|.||.||.|||||.||.||.||||||.|||||.|||||||.||..||||.|
Sbjct   75  ACCATCAAGCCTTACTTCCCCTGCTTCTTATAACTGTAGCCAGTCCATCCTACCCTTGGAGCATGGTCCCATCT  148

Query   92  ACATACCTTCCTCCTATGTAGACAGCCACCATGAATATCCAGCCATGACATTCTATAGCCCTGCTGTGATGAAT  165
            |.||.|||||||||||||||||.||||..||.|||||..||||||||||||||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  149  ATATCCCTTCCTCCTATGTAGAGAGCCGTCACGAATACTCAGCCATGACATTCTACAGTCCTGCTGTGATGAAC  222

Query  166  TACAGCATTCCCAGCAATGTCAC---TAACTTGGAAGGTGGGCCTGGTCGGCAGACCACAAGCCCAAATGTGTT  236
            |||||..|||||||||   .|||   ||||.|||||||||||||||.|||.|||||..||||||||||||||.|
Sbjct  223  TACAGTGTTCCCAGCA---GCACCGGTAACCTGGAAGGTGGGCCTGTTCGCCAGACTGCAAGCCCAAATGTGCT  293

Query  237  GTGGCCAACACCTGGGCACCTTTCTCCTTTAGTGGTCCATC----GCCAGTTATCACATCTGTATGCGGAACCT  306
            .||||||||..||||.|||||.||||||||||    |||.|    ||||.|.|||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct  294  ATGGCCAACTTCTGGACACCTCTCTCCTTTAG----CCACCCACTGCCAATCATCGCTTCTCTATGCAGAACCT  363

Query  307  CAAAAGAGTCCCTGGTGTGAAGCAAGATCGCTAGAACACACCTTACCTGTAAACAGAGAGACACTGAAAAGGAA  380
            |||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct  364  CAAAAGAGTCCTTGGTGTGAAGCAAGATCACTAGAACACACCTTGCCTGTAAACAGAGAGACCCTGAAGAGGAA  437

Query  381  GGTTAGTGGGAACCGTTGCGCCAGCCCTGTTACTGGTCCAGGTTCAAAGAGGGATGCTCACTTCTGCGCTGTCT  454
            |.||.|.||||.|.||||.|||||||||||||||.|||||.|..|.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  438  GCTTGGCGGGAGCGGTTGTGCCAGCCCTGTTACTAGTCCAAGCGCCAAGAGGGATGCTCACTTCTGCGCCGTCT  511

Query  455  GCAGCGATTACGCATCGGGATATCACTATGGAGTCTGGTCGTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTTTAAAAGAAGC  528
            ||||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  512  GCAGTGATTATGCATCTGGGTATCATTACGGTGTCTGGTCCTGTGAAGGATGTAAGGCCTTTTTTAAAAGAAGC  585

Query  529  ATTCAAGGACATAATGATTATATTTGTCCAGCTACAAATCAGTGTACAATCGATAAAAACCGGCGCAAGAGCTG  602
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||
Sbjct  586  ATTCAAGGACATAATGACTATATCTGTCCAGCCACGAATCAGTGTACCATAGACAAGAACCGGCGTAAAAGCTG  659

Query  603  CCAGGCCTGCCGACTTCGGAAGTGTTACGAAGTGGGAATGGTGAAGTGTGGCTCCCGGAGAGAGAGATGTGGGT  676
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||.|||||||.||.|||||||
Sbjct  660  CCAGGCCTGCCGACTTCGCAAGTGTTACGAAGTAGGAATGGTCAAGTGTGGATCCAGGAGAGAAAGGTGTGGGT  733

Query  677  ACCGCCTTGTGCGGAGACAGAGAAGTGCCGACGAGCAGCTGCACTGTGCCGG--CAAGGCCAAGAGAAGTGGCG  748
            ||||..|.||.||.|||||||||||||||..|||||||.||||  .||||.|  |||.||||||||||...|.|
Sbjct  734  ACCGAATAGTACGAAGACAGAGAAGTGCCAGCGAGCAGGTGCA--TTGCCTGAACAAAGCCAAGAGAACCAGTG  805

Query  749  GCCACGCGCCCCGAGTGCGGGAGCTGCTGCTGGACGCCCTGAGCCCCGAGCAGCTAGTGCTCACCCTCCTGGAG  822
            |.|||.|.|||||.|||..||||||.||||||.||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  806  GGCACACACCCCGGGTGAAGGAGCTACTGCTGAACTCTCTGAGTCCCGAGCAGCTGGTGCTCACCCTGCTGGAA  879

Query  823  GCTGAGCCGCCCCATGTGCTGATCAGCCGCCCCAGTGCGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATGTCCCTGAC  896
            ||||||||.|||.|||||||..|.|||||.|||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  880  GCTGAGCCACCCAATGTGCTAGTGAGCCGTCCCAGCATGCCCTTCACCGAGGCCTCCATGATGATGTCCCTCAC  953

Query  897  CAAGTTGGCCGACAAGGAGTTGGTACACATGATCAGCTGGGCCAAGAAGATTCCCGGCTTTGTGGAGCTCAGCC  970
            .|||.||||.||||||||..||||.||||||||..|||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  954  GAAGCTGGCTGACAAGGAACTGGTGCACATGATTGGCTGGGCCAAGAAAATCCCTGGCTTTGTGGAGCTCAGCC  1027

Query  971  TGTTCGACCAAGTGCGGCTCTTGGAGAGCTGTTGGATGGAGGTGTTAATGATGGGGCTGATGTGGCGCTCAATT  1044
            ||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1028  TGTTGGACCAAGTCCGCCTCTTGGAAAGCTGCTGGATGGAGGTGCTGATGGTGGGGCTGATGTGGCGCTCCATC  1101

Query 1045  GACCACCCCGGCAAGCTCATCTTTGCTCCAGATCTTGTTCTGGACAGGGATGAGGGGAAATGCGTAGAAGGAAT  1118
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct 1102  GACCACCCCGGCAAGCTCATCTTTGCTCCAGACCTCGTTCTGGACAGGGATGAGGGGAAGTGCGTGGAAGGGAT  1175

Query 1119  TCTGGAAATCTTTGACATGCTCCTGGCAACTACTTCAAGGTTTCGAGAGTTAAAACTCCAACACAAAGAATATC  1192
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||..||.||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1176  TCTGGAAATCTTTGACATGCTCCTGGCGACGACGGCACGGTTCCGTGAGTTAAAACTGCAGCACAAAGAATATC  1249

Query 1193  TCTGTGTCAAGGCCATGATCCTGCTCAATTCCAGTATGTACCCTCTGGTCACAGCGACCCAGGATGCTGACAGC  1266
            |.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||..|||..||.||.|.||||||.||.||.||.
Sbjct 1250  TGTGTGTGAAGGCCATGATTCTCCTCAACTCCAGTATGTACCCCTTGGCTACCGCAAGCCAGGAAGCAGAGAGT  1323

Query 1267  AGCCGGAAGCTGGCTCACTTGCTGAACGCCGTGACCGATGCTTTGGTTTGGGTGATTGCCAAGAGCGGCATCTC  1340
            ||||||||||||.|.|||.|..|||||||.|||||.|||||..||||.|||||||||.|.|||||.||.|||||
Sbjct 1324  AGCCGGAAGCTGACACACCTATTGAACGCAGTGACAGATGCCCTGGTCTGGGTGATTTCGAAGAGTGGAATCTC  1397

Query 1341  CTCCCAGCAGCAATCCATGCGCCTGGCTAACCTCCTGATGCTCCTGTCCCACGTCAGGCATGCGAGTAACAAGG  1414
            .|||||||||||.||..|.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||||||||....||||||||||
Sbjct 1398  TTCCCAGCAGCAGTCAGTCCGTCTGGCCAACCTCCTGATGCTTCTTTCTCATGTCAGGCACATCAGTAACAAGG  1471

Query 1415  GCATGGAACATCTGCTCAACATGAAGTGCAAAAATGTGGTCCCAGTGTATGACCTGCTGCTGGAGATGCTGAAT  1488
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  GCATGGAACATCTGCTCAGCATGAAGTGCAAAAATGTGGTCCCGGTGTACGACCTGCTGCTGGAGATGCTGAAT  1545

Query 1489  GCCCACGTGCTTCGCGGGTGCAAGTCCTCCATCACGGGGTCCGAGTGCAGCCCGGCAGAGGACAGTAAAAGCAA  1562
            ||.|||..||||||.||||.|||||||||.|||.|||||||.||||||.||.||.|||||||||||||.|||||
Sbjct 1546  GCTCACACGCTTCGAGGGTACAAGTCCTCAATCTCGGGGTCTGAGTGCTGCTCGACAGAGGACAGTAAGAGCAA  1619

Query 1563  AGAGGGCTCCCAGAACCCACAGTCTCAG  1590
            |||||||||||||||||..|||||.|||
Sbjct 1620  AGAGGGCTCCCAGAACCTCCAGTCACAG  1647