Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489864
• Subject: NM_010141.4
• Aligned Length: 2995
• Identities: 2720
• Gaps: 13

Alignment

Query    1  ATGGTTTTTCAAACTCGGTACCCTTCATGGATTATTTTATGCTACATCTGGCTGCTCCGCTTTGCACACACAGG  74
            ||||||.||||||||||||.||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGTTGTTCAAACTCGGTTCCCTTCGTGGATTATTTTGTGTTACATCTGGCTGCTTGGCTTTGCACACACGGG  74

Query   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTACTGCTGGATTCTAAAGCACAACAAACAGAGTTGGAGTGGATTTCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct   75  GGAGGCGCAGGCTGCGAAGGAAGTACTATTACTGGACTCGAAAGCACAACAAACAGAATTGGAATGGATTTCCT  148

Query  149  CTCCACCCAATGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTATACCCCGATACGAACATACCAGGTGTGC  222
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  149  CTCCACCCAGTGGGTGGGAAGAAATTAGTGGTTTGGATGAGAACTACACTCCGATAAGAACATACCAGGTGTGC  222

Query  223  CAAGTCATGGAGCCCAACCAAAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCCAAAGGCAATGCACAAAGGATTTT  296
            ||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGTCATGGAGCCCAACCAGAACAACTGGCTGCGGACTAACTGGATTTCTAAAGGCAACGCACAAAGGATTTT  296

Query  297  TGTAGAATTGAAATTCACCCTGAGGGATTGTAACAGTCTTCCTGGAGTACTGGGAACTTGCAAGGAAACATTTA  370
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  297  TGTAGAATTGAAATTCACCTTGAGGGATTGTAATAGTCTTCCCGGAGTCCTGGGAACTTGCAAGGAAACGTTTA  370

Query  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTATGACACTGGCAGGAATATAAGAGAAAACCTCTATGTAAAAATAGACACC  444
            |||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct  371  ATTTGTACTATTATGAAACAGACTACGACACCGGCAGGAATATACGAGAAAACCTTTATGTTAAAATAGACACC  444

Query  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTTACCCAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTTAACACTGAGGTGAGAGA  518
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  ATTGCTGCAGATGAAAGTTTCACACAAGGTGACCTTGGTGAAAGAAAGATGAAGCTGAACACTGAGGTGAGAGA  518

Query  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCTTTGGTTTCTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  519  GATTGGACCTTTGTCCAAAAAGGGATTCTATCTTGCCTTTCAGGATGTAGGGGCTTGCATAGCATTGGTTTCTG  592

Query  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTATTGAGAACTTAGCTATCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  593  TCAAAGTGTACTACAAGAAGTGCTGGTCCATTGTTGAGAACTTAGCTGTCTTTCCAGATACAGTGACTGGTTCG  666

Query  667  GAATTTTCCTCTTTAGTCGAGGTTCGAGGGACATGTGTCAGCAGTGCAGAGGAAGAAGCGGAAAACGCCCCCAG  740
            |||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|||||||
Sbjct  667  GAATTTTCCTCCTTAGTCGAGGTCCGTGGGACATGTGTCAGCAGTGCCGAGGAAGAGGCAGAAAATTCCCCCAG  740

Query  741  GATGCACTGCAGTGCAGAAGGAGAATGGTTAGTGCCCATTGGAAAATGTATCTGCAAAGCAGGCTACCAGCAAA  814
            .|||||.|||||||||||||||||.|||.||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  741  AATGCATTGCAGTGCAGAAGGAGAGTGGCTAGTACCCATTGGAAAATGCATCTGCAAAGCAGGCTATCAGCAAA  814

Query  815  AAGGAGACACTTGTGAACCCTGTGGCCGTGGGTTCTACAAGTCTTCCTCTCAAGATCTTCAGTGCTCTCGTTGT  888
            ||||.||||||||.||||||||||||||..||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||
Sbjct  815  AAGGGGACACTTGCGAACCCTGTGGCCGCAGGTTCTACAAATCTTCCTCTCAGGATCTCCAGTGTTCTCGTTGT  888

Query  889  CCAACTCACAGTTTTTCTGATAAAGAAGGCTCCTCCAGATGTGAATGTGAAGATGGGTATTACAGGGCTCCATC  962
            |||||.|||||.||.|||||...||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||
Sbjct  889  CCAACCCACAGCTTCTCTGACCGAGAAGGATCATCCAGGTGTGAATGTGAAGATGGGTACTACAGAGCTCCTTC  962

Query  963  TGACCCACCATACGTTGCATGCACAAGGCCTCCATCTGCACCACAGAACCTCATTTTCAACATCAACCAAACCA  1036
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  963  TGATCCACCATACGTTGCATGCACGAGGCCTCCCTCTGCACCACAGAACCTTATTTTCAATATCAATCAAACGA  1036

Query 1037  CAGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCTGCAGACAATGGGGGAAGAAACGATGTGACCTACAGAATATTGTGTAAG  1110
            |.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||
Sbjct 1037  CTGTAAGTTTGGAATGGAGTCCTCCGGCTGACAACGGGGGAAGAAACGATGTCACCTACAGAATACTGTGTAAG  1110

Query 1111  CGGTGCAGTTGGGAGCAGGGCGAATGTGTTCCCTGTGGGAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACTGGATT  1184
            ||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1111  CGGTGCAGTTGGGAACAGGGAGAATGTGTGCCATGCGGAAGTAACATTGGATACATGCCCCAGCAGACGGGATT  1184

Query 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTGCTAGCCCACGCTAATTATACTTTTGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAGGATAACTATGTCACTGTCATGGACCTACTTGCCCATGCAAATTACACTTTCGAAGTTGAAGCTGTAAATG  1258

Query 1259  GAGTTTCTGACTTAAGCCGATCCCAGAGGCTCTTTGCTGCTGTCAGTATCACCACTGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332
            |||||||.|||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GAGTTTCGGACTTAAGCAGATCCCAGAGGCTCTTCGCTGCTGTTAGCATCACCACCGGTCAAGCAGCTCCCTCG  1332

Query 1333  CAAGTGAGCGGAGTAATGAAGGAGAGAGTACTGCAGCGGAGTGTCGAGCTTTCCTGGCAGGAACCAGAGCATCC  1406
            ||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1333  CAAGTGAGTGGAGTCATGAAGGAGCGAGTACTGCAGCGGAGTGTGCAGCTTTCCTGGCAGGAGCCGGAGCATCC  1406

Query 1407  CAATGGAGTCATCACAGAATATGAAATCAAGTATTACGAGAAAGATCAAAGGGAACGGACCTACTCAACAGTAA  1480
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||.||||.|||||||||.|.|
Sbjct 1407  CAATGGAGTCATCACGGAATATGAAATCAAGTATTATGAGAAAGATCAACGGGAAAGGACGTACTCAACACTCA  1480

Query 1481  AAACCAAGTCTACTTCAGCCTCCATTAATAATCTGAAACCAGGAACAGTGTATGTTTTCCAGATTCGGGCTTTT  1554
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||..|.
Sbjct 1481  AAACCAAGTCCACCTCCGCCTCCATTAATAATCTGAAACCGGGAACAGTGTACGTCTTTCAGATCCGGGCGGTC  1554

Query 1555  ACTGCTGCTGGTTATGGAAATTACAGTCCCAGACTTGATGTTGCTACACTAGAGGAAGCTACAGGTAAAATGTT  1628
            ||||||||.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1555  ACTGCTGCCGGTTATGGAAACTACAGCCCTAGGCTTGATGTTGCCACACTTGAGGAAGCTTCAGGTAAAATGTT  1628

Query 1629  TGAAGCTACAGCTGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTTATTATCATTGCTGTGGTTGCTGTAGCTGGGACCATCA  1702
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1629  TGAAGCGACAGCAGTCTCCAGTGAACAGAATCCTGTCATCATAATTGCTGTAGTGGCTGTAGCAGGGACCATCA  1702

Query 1703  TTTTGGTGTTCATGGTCTTTGGCTTCATCATTGGGAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAAGCTGACCAAGAAGGC  1776
            |.||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 1703  TCTTGGTGTTCATGGTGTTCGGCTTCATCATTGGAAGAAGGCACTGTGGTTATAGCAAGGCTGACCAAGAAGGG  1776

Query 1777  GATGAAGAGCTTTACTTTCATT------------GCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGACCC  1838
            ||||||||.||.||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GATGAAGAACTCTACTTTCATTTTAAATTTCCAGGCACCAAAACCTACATTGACCCTGAAACCTATGAGGACCC  1850

Query 1839  AAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAG  1912
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AAATAGAGCTGTCCATCAATTCGCCAAGGAGCTAGATGCCTCCTGTATTAAAATTGAGCGTGTGATTGGTGCAG  1924

Query 1913  GAGAATTCGGTGAAGTCTGCAGTGGCCGTTTGAAACTTCCAGGGAAAAGAGATGTTGCAGTAGCCATAAAAACC  1986
            |||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1925  GAGAATTTGGAGAAGTTTGCAGTGGTCGTTTGAAACTTCCGGGGAAGAGAGATGTTGCAGTGGCCATAAAAACC  1998

Query 1987  CTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAACAAAGGAGAGACTTTTTGTGTGAAGCAAGCATCATGGGGCAGTTTGACCA  2060
            |||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1999  CTGAAAGTTGGTTACACAGAAAAGCAAAGGAGGGACTTTTTATGCGAAGCAAGCATCATGGGGCAATTTGACCA  2072

Query 2061  CCCAAATGTTGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAACCAGTCATGATAGTAATAGAGTTCATGGAAA  2134
            |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2073  CCCAAATGTCGTCCATTTGGAAGGGGTTGTTACAAGAGGGAAGCCTGTCATGATTGTGATAGAGTTCATGGAGA  2146

Query 2135  ATGGAGCCCTAGATGCATTTCTCAGGAAACATGATGGGCAATTTACAGTCATTCAGTTAGTAGGAATGCTGAGA  2208
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||.|||||
Sbjct 2147  ATGGAGCCCTGGATGCATTTCTCAGGAAACACGATGGGCAGTTTACAGTCATTCAGTTGGTAGGAATGTTGAGA  2220

Query 2209  GGAATTGCTGCTGGAATGAGATATTTGGCTGATATGGGATATGTTCACAGGGACCTTGCAGCTCGCAATATTCT  2282
            ||.|||||.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 2221  GGTATTGCCGCTGGGATGCGATACTTGGCTGATATGGGATACGTTCACAGGGACCTTGCAGCGCGCAACATCCT  2294

Query 2283  TGTCAACAGCAATCTCGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTGTCCCGAGTTATAGAGGATGATCCAGAAGCTG  2356
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2295  TGTCAACAGCAATCTTGTTTGTAAAGTGTCAGATTTTGGCCTTTCCCGGGTTATAGAGGATGATCCCGAAGCTG  2368

Query 2357  TCTATACAACTACTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACAGCACCCGAAGCCATCCAGTACCGGAAATTCACA  2430
            ||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 2369  TCTACACCACGACTGGTGGAAAAATTCCAGTAAGGTGGACTGCACCGGAAGCCATTCAATACCGGAAGTTCACC  2442

Query 2431  TCAGCCAGTGATGTATGGAGCTATGGAATAGTCATGTGGGAAGTTATGTCTTATGGAGAAAGACCTTATTGGGA  2504
            ||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 2443  TCAGCCAGCGATGTGTGGAGCTATGGGATTGTCATGTGGGAAGTGATGTCTTATGGAGAAAGACCTTACTGGGA  2516

Query 2505  CATGTCAAATCAAGATGTTATAAAAGCAATAGAAGAAGGTTATCGTTTACCAGCACCCATGGACTGCCCAGCTG  2578
            ||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 2517  CATGTCAAATCAAGATGTCATTAAAGCGATAGAAGAAGGTTATCGTTTGCCGGCGCCCATGGATTGCCCAGCTG  2590

Query 2579  GCCTTCACCAGCTAATGTTGGATTGTTGGCAAAAGGAGCGTGCTGAAAGGCCAAAATTTGAACAGATAGTTGGA  2652
            |.|||||||||||||||.|||||||||||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2591  GTCTTCACCAGCTAATGCTGGATTGTTGGCAGAAAGATCGGGCGGAAAGGCCAAAGTTTGAGCAGATAGTCGGA  2664

Query 2653  ATTCTAGACAAAATGATTCGAAACCCAAATAGTCTGAAAACTCCCCTGGGAACTTGTAGTAGGCCAATAAGCCC  2726
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||.||..|||||||
Sbjct 2665  ATTCTAGACAAAATGATTCGAAACCCAAGTAGTCTGAAAACACCCCTGGGAACTTGTAGTAGACCCTTAAGCCC  2738

Query 2727  TCTTCTGGATTAAAACACTCCTGATTTCACTACCTTTTGTTCAGTTGGAGAATGGCTACAAGCTATTAAGATGG  2800
            |||||||||..|.|.|||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||||.||||
Sbjct 2739  TCTTCTGGACCAGAGCACTCCTGACTTCACTGCCTTCTGTTCAGTTGGAGAATGGTTGCAAGCTATTAAAATGG  2812

Query 2801  AAAGATATAAAGATAATTTCACGGCAGCTGGCTACAATTCCCTTGAATCAGTAGCCAGGATGACTATTGAGGAT  2874
            ||||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 2813  AAAGGTATAAGGACAACTTCACAGCAGCGGGTTACAACTCACTCGAGTCAGTGGCCAGGATGACTATCGATGAT  2886

Query 2875  GTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGTCATCAAAAGAAAATCATGAGCAGCATTCAGACTATGAGAGCACA  2948
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||.|.|||||
Sbjct 2887  GTGATGAGTTTAGGGATCACACTGGTTGGCCATCAAAAGAAGATCATGAGCAGCATCCAGACTATGCGGGCACA  2960

Query 2949  AATGCTACATTTACATGGAACTGGCATTCAAGTGG  2983
            ||||.|.||||||||.|||||.|||||.|||||| 
Sbjct 2961  AATGTTGCATTTACACGGAACAGGCATCCAAGTG-  2994