Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489912
• Subject: XM_006509033.1
• Aligned Length: 928
• Identities: 596
• Gaps: 197

Alignment

Query   1  ATGGACGAGAAGGTGTTCACCAAGGAGCTGGACCAGTGGATCGAGCAGCTGAACGAGTGCAAGCAGCTGTCCGA  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  GTCCCAGGTCAAGAGCCTCTGCGAGAAGGCTAAAGAAATCCTGACAAAAGAATCCAACGTGCAAGAGGTTCGAT  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GTCCAGTTACTGTCTGTGGAGATGTGCATGGGCAATTTCATGATCTCATGGAACTGTTTAGAATTGGTGGCAAA  222
                                                          |||||.||.||.|||||||||||.|||
Sbjct   1  -----------------------------------------------ATGGAGCTCTTCAGAATTGGTGGGAAA  27

Query 223  TCACCAGATACAAATTACTTGTTTATGGGAGATTATGTTGACAGAGGATATTATTCAGTTGAAACAGTTACACT  296
           |||||||||||.||.|||.|.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.||.||.||.||
Sbjct  28  TCACCAGATACGAACTACCTATTCATGGGGGACTATGTAGACAGAGGGTACTACTCTGTGGAGACTGTGACTCT  101

Query 297  GCTTGTAGCTCTTAAGGTTCGTTACCGTGAACGCATCACCATTCTTCGAGGGAATCATGAGAGCAGACAGATCA  370
           .||||||||..|.|||||.||.||.|..||.||||||||.||..|.|||||.|||||.||.|||.|.|||||||
Sbjct 102  TCTTGTAGCATTAAAGGTGCGCTATCCAGAGCGCATCACAATATTGCGAGGAAATCACGAAAGCCGGCAGATCA  175

Query 371  CACAAGTTTATGGTTTCTATGATGAATGTTTAAGAAAATATGGAAATGCAAATGTTTGGAAATATTTTACAGAT  444
           |||||||.|||||.||.||||||||.||..||.|.||.|||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 176  CACAAGTGTATGGCTTTTATGATGAGTGCCTACGGAAGTATGGAAATGCCAACGTGTGGAAATACTTTACAGAT  249

Query 445  CTTTTTGACTATCTTCCTCTCACTGCCTTGGTGGATGGGCAGATCTTCTGTCTACATGGTGGTCTCTCGCCATC  518
           ||.|||||.||||||||.||.||.||.||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||.|||||
Sbjct 250  CTCTTTGATTATCTTCCACTTACAGCTTTAGTAGATGGACAGATATTCTGCCTCCACGGTGGCCTGTCTCCATC  323

Query 519  TATAGATACACTGGATCATATCAGAGCACTTGATCGCCTACAAGAAGTTCCCCATGAGGGTCCAATGTGTGACT  592
           .||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||.|.|||||||||||.||||||||.|||||||||||..
Sbjct 324  CATAGATACACTGGACCACATAAGAGCCCTGGATCGCTTGCAAGAAGTTCCACATGAGGGCCCAATGTGTGATC  397

Query 593  TGCTGTGGTCAGATCCAGATGACCGTGGTGGTTGGGGTATATCTCCTCGAGGAGCTGGTTACACCTTTGGGCAA  666
           |..|.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 398  TCTTATGGTCAGATCCGGATGACCGTGGCGGCTGGGGCATTTCTCCACGTGGTGCTGGCTACACATTTGGACAA  471

Query 667  GATATTTCTGAGACATTTAATCATGCCAATGGCCTCACGTTGGTGTCTAGAGCTCACCAGCTAGTGATGGAGGG  740
           ||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||..||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 472  GACATTTCTGAAACATTTAACCATGCCAACGGTCTCACACTGGTGTCTCGTGCTCACCAGCTTGTAATGGAAGG  545

Query 741  ATATAACTGGTGCCATGACCGGAATGTAGTAACGATTTTCAGTGCTCCAAACTATTGTTATCGTTGTGGTAACC  814
           ||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.||.||||||||.||||
Sbjct 546  ATATAACTGGTGCCATGATCGGAATGTGGTCACCATTTTTAGTGCGCCCAATTACTGCTACCGTTGTGGGAACC  619

Query 815  AAGCTGCAATCATGGAACTTGACGATACTCTAAAATACTC-TTTCTTGCAGTTTGACCCAGCACCTCGTAGAGG  887
           |.|||||.|||||||||.|.||.||.|||.|||||||.|| |||||| |||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 620  AGGCTGCTATCATGGAATTAGATGACACTTTAAAATATTCATTTCTT-CAGTTTGACCCAGCACCTCGTCGTGG  692

Query 888  CGAGCCACATGTTACTCGTCGTACCCCAGACTACTTCCTG  927
           .|||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 693  AGAGCCTCATGTGACCCGGCGCACCCCAGACTACTTCCTG  732