Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489921
• Subject: NM_001144030.2
• Aligned Length: 3075
• Identities: 2857
• Gaps: 216

Alignment

Query    1  ATGCATCGGAAAAAGGTGGATAACCGAATCCGGATTCTCATTGAGAATGGAGTAGCTGAGCGGCAAAGATCTCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTAATACTTCATCACATGTTATCCAAAGCAACTGTGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGCTCGGCCTTCAGTGCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGGTTTAGCAGTCACCGGAAGAAAAGAATGCGA  222
                                                                                ||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------ATGCGA  6

Query  223  CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    7  CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC  80

Query  297  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   81  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC  154

Query  371  AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  155  AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC  228

Query  445  ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  229  ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC  302

Query  519  TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  303  TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  376

Query  593  TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  377  TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG  450

Query  667  ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  451  ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC  524

Query  741  TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  525  TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT  598

Query  815  CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG  672

Query  889  GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  673  GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC  746

Query  963  TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT  820

Query 1037  CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT  894

Query 1111  ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT  968

Query 1185  CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG  1042

Query 1259  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1116

Query 1333  GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGCATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGTATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT  1190

Query 1407  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1191  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC  1264

Query 1481  GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1265  GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1338

Query 1555  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1339  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA  1412

Query 1629  TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCTGTGCCCCCCACCCAGA  1702
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1413  TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCCGTGCCCCCCACCCAGA  1486

Query 1703  ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1487  ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC  1560

Query 1777  AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1561  AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA  1634

Query 1851  CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1635  CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA  1708

Query 1925  GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1709  GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA  1782

Query 1999  CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1783  CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT  1856

Query 2073  GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1857  GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA  1930

Query 2147  CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1931  CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG  2004

Query 2221  ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2005  ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC  2078

Query 2295  AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2079  AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC  2152

Query 2369  TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2153  TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA  2226

Query 2443  GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2227  GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT  2300

Query 2517  GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2301  GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT  2374

Query 2591  CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2375  CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG  2448

Query 2665  GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2449  GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC  2522

Query 2739  CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2523  CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG  2596

Query 2813  ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2597  ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA  2670

Query 2887  TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2671  TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG  2744

Query 2961  CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2745  CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG  2818

Query 3035  AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA  3075
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2819  AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA  2859