Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489921
• Subject: NM_024662.3
• Aligned Length: 3075
• Identities: 3073
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCATCGGAAAAAGGTGGATAACCGAATCCGGATTCTCATTGAGAATGGAGTAGCTGAGCGGCAAAGATCTCT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCATCGGAAAAAGGTGGATAACCGAATCCGGATTCTCATTGAGAATGGAGTAGCTGAGCGGCAAAGATCTCT  74

Query   75  CTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTAATACTTCATCACATGTTATCCAAAGCAACTGTGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CTTTGTTGTAGTTGGGGATCGAGGAAAAGATCAGGTGGTAATACTTCATCACATGTTATCCAAAGCAACTGTGA  148

Query  149  AGGCTCGGCCTTCAGTGCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGGTTTAGCAGTCACCGGAAGAAAAGAATGCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGCTCGGCCTTCAGTGCTGTGGTGTTATAAGAAAGAGCTGGGGTTTAGCAGTCACCGGAAGAAAAGAATGCGA  222

Query  223  CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGCTGCAGAAGAAAATAAAGAATGGAACACTGAACATAAAGCAGGACGACCCCTTTGAACTCTTCATAGCAGC  296

Query  297  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAAACATTCGCTACTGCTACTACAACGAGACCCACAAGATCCTGGGCAATACCTTCGGCATGTGTGTGCTGC  370

Query  371  AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGATTTTGAAGCCTTAACTCCAAACTTGCTGGCCAGGACTGTAGAAACAGTGGAAGGTGGTGGGCTAGTGGTC  444

Query  445  ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATCCTCCTACGGACCATGAACTCACTCAAGCAATTGTACACAGTGACTATGGATGTGCATTCCAGGTACAGAAC  518

Query  519  TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAGGCCCATCAGGATGTGGTGGGAAGATTTAATGAAAGGTTTATTCTGTCTCTGGCCTCTTGTAAGAAGTGTC  592

Query  593  TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCGTCATTGATGACCAGCTCAACATCCTGCCCATCTCCTCCCACGTTGCCACCATGGAGGCCCTGCCTCCCCAG  666

Query  667  ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ACTCCGGATGAGAGTCTTGGTCCTTCTGATCTGGAGCTGAGGGAGTTGAAGGAGAGCTTGCAGGACACCCAGCC  740

Query  741  TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGTGGGTGTGTTGGTGGACTGCTGTAAGACTCTAGACCAGGCCAAAGCTGTCTTGAAATTTATCGAGGGCATCT  814

Query  815  CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CTGAAAAGACCCTGAGGAGTACTGTTGCACTCACAGCTGCTCGAGGACGGGGAAAATCTGCAGCCCTGGGATTG  888

Query  889  GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGATTGCTGGGGCGGTGGCATTTGGGTACTCCAATATCTTTGTTACCTCCCCAAGCCCTGATAACCTCCATAC  962

Query  963  TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCTGTTTGAATTTGTATTTAAAGGATTTGATGCTCTGCAATATCAGGAACATCTGGATTATGAGATTATCCAGT  1036

Query 1037  CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCTAAATCCTGAATTTAACAAAGCAGTGATCAGAGTGAATGTATTTCGAGAACACAGGCAGACTATTCAGTAT  1110

Query 1111  ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  ATACATCCTGCAGATGCTGTGAAGCTGGGCCAGGCTGAACTAGTTGTGATTGATGAAGCTGCCGCCATCCCCCT  1184

Query 1185  CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCCCTTGGTGAAGAGCCTACTTGGCCCCTACCTTGTTTTCATGGCATCCACCATCAATGGCTATGAGGGCACTG  1258

Query 1259  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GCCGGTCACTGTCCCTCAAGCTAATTCAGCAGCTCCGTCAACAGAGCGCCCAGAGCCAGGTCAGCACCACTGCT  1332

Query 1333  GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGCATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGAATAAGACCACGACGACAGCCAGATTGGCATCAGCGCGGACACTGTATGAGGTTTCCCTCCAGGAGTCAAT  1406

Query 1407  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGATACGCCCCTGGGGATGCAGTGGAGAAGTGGCTGAATGACTTGCTGTGCCTGGATTGCCTCAACATCACTC  1480

Query 1481  GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GGATAGTCTCAGGCTGCCCCTTGCCTGAAGCTTGTGAACTGTACTATGTTAATAGAGATACCCTCTTTTGCTAC  1554

Query 1555  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CACAAGGCCTCTGAAGTTTTCCTCCAACGGCTTATGGCCCTCTACGTGGCTTCTCACTACAAGAACTCTCCCAA  1628

Query 1629  TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCTGTGCCCCCCACCCAGA  1702
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGATCTCCAGATGCTCTCCGATGCACCTGCTCACCATCTCTTCTGCCTTCTGCCTCCCGTGCCCCCCACCCAGA  1702

Query 1703  ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGCCCTTCCAGAAGTGCTTGCTGTTATCCAGGTGTGCCTTGAAGGGGAGATTTCTCGCCAGTCCATCTTGAAC  1776

Query 1777  AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  AGTCTGTCTCGAGGCAAGAAGGCTTCAGGGGACCTGATTCCATGGACAGTGTCAGAACAGTTCCAAGATCCAGA  1850

Query 1851  CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CTTTGGTGGTCTGTCTGGTGGAAGGGTCGTTCGCATTGCTGTTCACCCAGATTATCAAGGGATGGGCTATGGCA  1924

Query 1925  GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCCGTGCTCTGCAGCTGCTGCAGATGTACTATGAAGGCAGGTTTCCTTGTCTGGAGGAAAAGGTCCTTGAGACA  1998

Query 1999  CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CCACAGGAAATTCACACCGTAAGCAGCGAGGCTGTCAGCTTGTTGGAAGAGGTCATCACTCCCCGGAAGGACCT  2072

Query 2073  GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GCCTCCTTTACTCCTCAAATTGAATGAGAGGCCTGCCGAACGCCTGGATTACCTGGGTGTTTCCTATGGCTTGA  2146

Query 2147  CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  CCCCCAGGCTCCTCAAGTTCTGGAAACGAGCTGGATTTGTTCCTGTTTATCTGAGACAGACCCCGAATGACCTG  2220

Query 2221  ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  ACCGGAGAGCACTCGTGCATCATGCTGAAGACGCTCACTGATGAGGATGAGGCTGACCAGGGAGGCTGGCTTGC  2294

Query 2295  AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGCCTTCTGGAAAGATTTCCGACGGCGGTTCCTAGCCTTGCTCTCCTACCAGTTCAGTACCTTCTCTCCTTCCC  2368

Query 2369  TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  TGGCTCTGAACATCATTCAGAACAGGAACATGGGGAAGCCAGCCCAGCCTGCCCTGAGCCGGGAGGAGCTGGAA  2442

Query 2443  GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GCACTCTTCCTCCCCTATGACCTGAAGCGGCTGGAGATGTATTCACGGAATATGGTGGACTATCACCTCATCAT  2516

Query 2517  GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  GGACATGATCCCGGCCATCTCTCGCATCTATTTCCTGAACCAGCTGGGGGACCTGGCCCTGTCTGCGGCTCAGT  2590

Query 2591  CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  CGGCTCTTCTCTTGGGGATTGGCCTGCAGCATAAGTCTGTGGACCAGCTGGAAAAGGAGATTGAGCTGCCCTCG  2664

Query 2665  GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GGCCAGTTGATGGGACTTTTCAACCGGATCATCCGCAAAGTTGTGAAGCTATTTAATGAAGTTCAGGAAAAGGC  2738

Query 2739  CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CATTGAGGAGCAGATGGTGGCAGCGAAGGATGTGGTCATGGAGCCCACGATGAAGACCCTCAGTGACGACCTAG  2812

Query 2813  ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATGAAGCAGCAAAGGAATTTCAGGAGAAACACAAGAAGGAAGTAGGGAAGCTGAAGAGCATGGACCTCTCTGAA  2886

Query 2887  TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  TACATAATCCGTGGGGACGATGAAGAGTGGAATGAAGTTTTGAACAAAGCTGGGCCGAACGCCTCGATCATCAG  2960

Query 2961  CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  CCTGAAAAGTGACAAGAAAAGGAAGTTAGAGGCCAAACAAGAACCCAAACAGAGCAAGAAGTTGAAGAACAGAG  3034

Query 3035  AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA  3075
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AGACAAAGAACAAAAAAGATATGAAACTGAAGCGGAAGAAA  3075