Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489928
• Subject: NM_001320707.1
• Aligned Length: 2952
• Identities: 2808
• Gaps: 144

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74

Query   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148

Query  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222

Query  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296

Query  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370

Query  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444

Query  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518

Query  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592

Query  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666

Query  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740

Query  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814

Query  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888

Query  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962

Query  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036

Query 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110

Query 1111  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  1184

Query 1185  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1258

Query 1259  AGTTTACACTGGAACTGGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGGTCTCTGTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 1259  AGTTTACACTGGAACTGGACAG----------------------------------------------------  1280

Query 1333  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAACGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  1406
                                                                                      
Sbjct 1281  --------------------------------------------------------------------------  1280

Query 1407  GGGTACTTTATTTGCAGAGGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1480
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1281  ------------------GGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1336

Query 1481  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1410

Query 1555  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1484

Query 1629  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1558

Query 1703  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1632

Query 1777  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1706

Query 1851  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1780

Query 1925  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1854

Query 1999  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  1928

Query 2073  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  2002

Query 2147  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  2076

Query 2221  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  2150

Query 2295  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  2224

Query 2369  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2225  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  2298

Query 2443  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2299  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2372

Query 2517  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2373  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2446

Query 2591  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2447  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2520

Query 2665  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2521  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2594

Query 2739  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2595  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2668

Query 2813  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2669  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2742

Query 2887  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2743  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2808