Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489928
• Subject: NM_001320708.2
• Aligned Length: 2952
• Identities: 2481
• Gaps: 471

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------ATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  47

Query  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   48  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  121

Query  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  122  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  195

Query  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  196  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  269

Query  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  270  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  343

Query  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  344  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  417

Query  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  491

Query  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  492  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  565

Query 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  566  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  639

Query 1111  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  640  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  713

Query 1185  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  714  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  787

Query 1259  AGTTTACACTGGAACTGGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGGTCTCTGTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  788  AGTTTACACTGGAACTGGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGGTCTCTGTGT  861

Query 1333  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAACGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  862  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAACGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  935

Query 1407  GGGTACTTTATTTGCAGAGGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  936  GGGTACTTTATTTGCAGAGGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1009

Query 1481  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1010  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1083

Query 1555  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1084  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1157

Query 1629  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1158  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1231

Query 1703  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1232  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1305

Query 1777  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1306  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1379

Query 1851  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1380  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1453

Query 1925  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1454  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1527

Query 1999  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1528  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  1601

Query 2073  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1602  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  1675

Query 2147  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1676  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  1749

Query 2221  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1750  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  1823

Query 2295  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1824  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  1897

Query 2369  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1898  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  1971

Query 2443  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1972  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2045

Query 2517  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2046  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2119

Query 2591  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2120  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2193

Query 2665  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2194  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2267

Query 2739  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2268  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2341

Query 2813  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2342  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2415

Query 2887  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2416  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2481