Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489928
• Subject: NM_178654.4
• Aligned Length: 2955
• Identities: 2671
• Gaps: 9

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74
            |||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|.||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAACCCCGACCGGGGGGAGATCCTCCTCACCGAGCTGCAGGGAGATTCCCGGACTCTTCCATTTTC  74

Query   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAGAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAACAGAAATTGGACGACATCAAGG  148

Query  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  ATCGAATAAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAACCTGAGGAAAGTTACAACA  222

Query  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296
            |||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  223  GATAAGAAAAATTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAATTACATCACAA  296

Query  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370
            |||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.||....||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  297  GCTACAAGAATTAAATGCACACATCGTTGTATCGGATCCAGAGGACTCCACAGATTGTCCGAGGACTCCAGATA  370

Query  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444
            |||||||||.||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||.|||||||||||
Sbjct  371  CTCCAAATAGTGACTCTCGTAGTTCTACTAGCAACAATAGACTGATGGCCTTACAGAAACAACTGGATATAGAA  444

Query  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518
            |||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAAAGTAAAGCAGGGTGCAGAGAACATGATACAGATGTACTCAAATGGCTCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518

Query  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592
            |||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TGGTACAGCGCAGCAACTGCTACAGGATAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATCCGGATGCAGATTCTTCAGGCCG  592

Query  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666
            |||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGACCAATGAGCTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGCCCTCTTGAGCTTCGGATGGAAGAATTA  666

Query  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740
            ||.||||||||||.||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct  667  AGACATCATTTTAAGATAGAATTTGCAGTAGCCGAAGGTGCAAAGAATGTCATGAAGTTACTTGGCTCAGGAAA  740

Query  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814
            ||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTAACAGACAGAAAAGCGCTTTCAGAAGCACAAGCGAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814

Query  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888
            ||||||||.||||||||||.|||||.||..||||||.||||||.|||||||||||..|..|.|||||.||.|||
Sbjct  815  AGTATTCACTAGAGCAAAGGTTAAATGAGCTCCCCAGGAATCACCCCAAAAGCAGTGTCGTCATTGAGGAGCTT  888

Query  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962
            |||||.||   |||.||||||||.||.||||||||.||.||.|||.|.||.|||||.||.||.|||||.|||||
Sbjct  889  TCACTGGT---TGCGTCACCAACCCTGAGTCCACGGCAGAGCATGCTGTCCACGCAGAACCAGTATAGCACACT  959

Query  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036
            .|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  960  GTCCAAGCCAGCGGCGCTAACCGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGGTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTAC  1033

Query 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|.||||||.|||||.||||||
Sbjct 1034  CTGGACGGTCAAAAGCAACGTCGGTAGCACTACCTGGGTGGAGTCCAAGTGACAACAGATCGTCTTTTATGAGC  1107

Query 1111  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  1184
            |||||.||.||.||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1108  AGAACCAGCAAGAGTAAAAGTGGGAGTAGTCGCAACCTCCTGAAAACGGATGACTTGTCCAATGATGTTTGTGC  1181

Query 1185  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1258
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1182  TGTTTTGAAGCTAGATAATACTGTGGTTGGTCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCAAATCAGTCGTGGGACCAGA  1255

Query 1259  AGTTTACACTGGAACTGGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGGTCTCTGTGT  1332
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  AGTTTACACTGGAACTAGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGATCTCTGTGT  1329

Query 1333  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAACGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  1406
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAGCGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  1403

Query 1407  GGGTACTTTATTTGCAGAGGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1480
            |||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1404  GGGTACTTTGTTTGCAGAGGTTACTTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGACGACCAAAACTCCAAAGACAAAAGA  1477

Query 1481  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1554
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  AAATTTTTTCAAAACAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAGATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1551

Query 1555  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1628
            ||.|||||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||.|.||
Sbjct 1552  AGACTAGTGAGACGAGCTATTCCCACAGTAAATCATTCTGGCACATTCAGCCCTCAGACTCCTGTGCCTGCAAC  1625

Query 1629  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1702
            |||||||||.|||||.|.||||||.|||.|.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  AGTGCCAGTCGTTGACGCACGCATTCCTGATCTAGCACCTCCGGCCAGTGACTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1699

Query 1703  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1776
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|.||||||||||||||||
Sbjct 1700  TTGATCTTGAACCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCTCGTGCTTCTTCCCTTGGAGAGACAGATGAATCTTCTGAA  1773

Query 1777  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1850
            ||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||.||||||||..|||||.|||||||||||||||...|.|.
Sbjct 1774  TTGAGAGTTTTGGATATACCTGGACAGGGTTCAGAAACTGTTTTCAATATTGAGAATGACAGAAATAACCTGCG  1847

Query 1851  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGA-TACTCCTCAGTCAGGCCTAGAA--TATAGTGGTATTCAAGAAC  1921
            |||||||||..||||||||||..|| |||| .|.||||.|.|||||  |.|||  |...|.|||.||..|||.|
Sbjct 1848  TCCAAAATCCAAATCTGAATATGAG-CTGAGCATTCCTGACTCAGG--TCGAAGCTGCTGGGGTGTTGGAGAGC  1918

Query 1922  TTGAGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGA  1995
            ||||.||||..|||.|||||||.|||||||||||.|.||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1919  TTGATGACAAGAGAGCTCAGCAGAGGTTTCAGTTCAGTCTACAGGACTTCAGGTGCTGTGCTGTCTTGGGGAGA  1992

Query 1996  GGACATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAA  2069
            |||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||.||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1993  GGACACTTTGGAAAGGTGCTGTTGGCGGAATATAAACACACAAATGAAATGTTTGCAATAAAAGCCTTAAAGAA  2066

Query 2070  AGGAGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTG  2143
            ||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2067  AGGAGACATTGTGGCACGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAGACTGTGAATAGTG  2140

Query 2144  TAAGGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATAT  2217
            |.|||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.|||
Sbjct 2141  TCAGGCACCCGTTTCTAGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACAAAAGAACATGTTTGCTTCGTGATGGAGTAT  2214

Query 2218  GCTGCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGC  2291
            |||||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2215  GCTGCAGGTGGTGACCTGATGATGCACATCCATACTGATGTCTTCTCTGAACCCAGAGCTGTATTTTATGCAGC  2288

Query 2292  TTGTGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTAT  2365
            .||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2289  ATGTGTAGTTCTTGGGTTGCAATACTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAGTTGGATAACTTGT  2362

Query 2366  TGCTAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGA  2439
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 2363  TGCTAGATACAGAAGGCTTTGTGAAAATTGCTGACTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGGTATGGAGATAGG  2436

Query 2440  ACAAGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGT  2513
            |||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||..||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 2437  ACAAGCACATTTTGTGGTACTCCTGAGTTTCTTGCCCCAGAAGTCCTAACAGAAACATCGTACACAAGGGCTGT  2510

Query 2514  AGATTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAG  2587
            ||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2511  AGATTGGTGGGGCCTTGGTGTACTTATATATGAGATGCTCGTCGGCGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAG  2584

Query 2588  AGGAAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATA  2661
            |.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 2585  AAGAGGTTTTTGACAGTATTGTAAATGACGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCCATA  2658

Query 2662  ATGAGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAA  2735
            ||||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||.||.|||.|.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 2659  ATGAGAAGGCTGCTAAGGAGAAATCCTGAGCGGCGCCTGGGAGCTGGTGAGAAGGATGCAGAGGATGTCAAGAA  2732

Query 2736  GCACCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCA  2809
            ||||||.|||||||||||||..||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2733  GCACCCGTTTTTCCGGCTAACCGACTGGAGTGCTCTAATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTGTACCTACCA  2806

Query 2810  TAAGAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGA  2883
            |.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2807  TTAGAGGACGGGAAGATGTTAGTAACTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGA  2880

Query 2884  GAACCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2952
            ||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||||||...||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2881  GAACCAAGGATACTCTTGGAAGAGGAGCAGGAGATGTTCCACGATTTTGACTACGTTGCTGATTGGTGT  2949