Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489928
• Subject: XM_017001783.2
• Aligned Length: 2952
• Identities: 2760
• Gaps: 192

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGTCCAACCCCGAACGGGGGGAGATTCTGCTCACGGAACTGCAGGGGGATTCCCGAAGTCTTCCGTTTTC  74

Query   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGAGAATGTGAGTGCTGTTCAAAAATTAGACTTTTCAGATACAATGGTGCAGCAGAAATTGGATGATATCAAGG  148

Query  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ATCGAATTAAGAGAGAAATAAGGAAAGAACTGAAAATCAAAGAAGGAGCTGAAAATCTGAGGAAAGTCACAACA  222

Query  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATAAAAAAAGTTTGGCTTATGTAGACAACATTTTGAAAAAATCAAATAAAAAATTAGAAGAACTACATCACAA  296

Query  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCTGCAGGAATTAAATGCACATATTGTTGTATCAGATCCAGAAGATATTACAGATTGCCCAAGGACTCCAGATA  370

Query  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTCCAAATAATGACCCTCGTTGTTCTACTAGCAACAATAGATTGAAGGCCTTACAAAAACAATTGGATATAGAA  444

Query  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CTTAAAGTAAAACAAGGTGCAGAGAATATGATACAGATGTATTCAAATGGATCTTCAAAGGATCGGAAACTCCA  518

Query  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGTACAGCTCAGCAACTGCTCCAGGACAGCAAGACAAAAATAGAAGTCATACGAATGCAGATTCTTCAGGCAG  592

Query  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCCAGACTAATGAATTGGCTTTTGATAATGCAAAACCTGTGATAAGTCCTCTTGAACTTCGGATGGAAGAATTA  666

Query  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGGCATCATTTTAGGATAGAGTTTGCAGTAGCAGAAGGTGCAAAGAATGTAATGAAATTACTTGGCTCAGGAAA  740

Query  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  AGTAACAGACAGAAAAGCACTTTCAGAAGCTCAAGCAAGATTTAATGAATCAAGTCAGAAGTTGGACCTTTTAA  814

Query  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTATTCATTAGAGCAAAGATTAAACGAAGTCCCCAAGAATCATCCCAAAAGCAGGATTATTATTGAAGAACTT  888

Query  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCACTTGTTGCTGCATCACCAACACTAAGTCCACGTCAAAGTATGATATCTACGCAAAATCAATATAGTACACT  962

Query  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  ATCCAAACCAGCAGCACTAACAGGTACTTTGGAAGTTCGTCTTATGGGCTGCCAAGATATCCTAGAGAATGTCC  1036

Query 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTGGACGGTCAAAAGCAACATCAGTTGCACTGCCTGGTTGGAGTCCAAGTGAAACCAGATCATCTTTCATGAGC  1110

Query 1111  AGAACGAGTAAAAGTAAAAGCGGAAGTAGTCGAAATCTTCTAAAAACCGATGACTTGTCCAATGATGTCTGTGC  1184
            ||||||||||||                                                ||||||||||||||
Sbjct 1111  AGAACGAGTAAA------------------------------------------------AATGATGTCTGTGC  1136

Query 1185  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  TGTTTTGAAGCTCGATAATACTGTGGTTGGCCAAACTAGCTGGAAACCCATTTCCAATCAGTCATGGGACCAGA  1210

Query 1259  AGTTTACACTGGAACTGGACAGGTCACGTGAACTGGAAATTTCAGTTTATTGGCGTGATTGGCGGTCTCTGTGT  1332
            ||||||||||||||||||||||                                                    
Sbjct 1211  AGTTTACACTGGAACTGGACAG----------------------------------------------------  1232

Query 1333  GCTGTAAAATTTCTGAGGTTAGAAGATTTTTTAGACAACCAACGGCATGGCATGTGTCTCTATTTGGAACCACA  1406
                                                                                      
Sbjct 1233  --------------------------------------------------------------------------  1232

Query 1407  GGGTACTTTATTTGCAGAGGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1480
                              ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1233  ------------------GGTTACCTTTTTTAATCCAGTTATTGAAAGAAGACCAAAACTTCAAAGACAAAAGA  1288

Query 1481  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1289  AAATTTTTTCAAAGCAACAAGGCAAAACATTTCTCAGAGCTCCTCAAATGAATATTAATATTGCCACTTGGGGA  1362

Query 1555  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1363  AGGCTAGTAAGAAGAGCTATTCCTACAGTAAATCATTCTGGCACCTTCAGCCCTCAAGCTCCTGTGCCTACTAC  1436

Query 1629  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1437  AGTGCCAGTGGTTGATGTACGCATCCCTCAACTAGCACCTCCAGCTAGTGATTCTACAGTAACCAAATTGGACT  1510

Query 1703  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1511  TTGATCTTGAGCCTGAACCTCCTCCAGCCCCACCACGAGCTTCTTCTCTTGGAGAAATAGATGAATCTTCTGAA  1584

Query 1777  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1585  TTAAGAGTTTTGGATATACCAGGACAGGATTCAGAGACTGTTTTTGATATTCAGAATGACAGAAATAGTATACT  1658

Query 1851  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1659  TCCAAAATCTCAATCTGAATACAAGCCTGATACTCCTCAGTCAGGCCTAGAATATAGTGGTATTCAAGAACTTG  1732

Query 1925  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1733  AGGACAGAAGATCTCAGCAAAGGTTTCAGTTTAATCTACAAGATTTCAGGTGTTGTGCTGTCTTGGGAAGAGGA  1806

Query 1999  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1807  CATTTTGGAAAGGTGCTTTTAGCTGAATATAAAAACACAAATGAGATGTTTGCTATAAAAGCCTTAAAGAAAGG  1880

Query 2073  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1881  AGATATTGTGGCTCGAGATGAAGTAGACAGCCTGATGTGTGAAAAAAGAATTTTTGAAACTGTGAATAGTGTAA  1954

Query 2147  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1955  GGCATCCCTTTTTGGTGAACCTTTTTGCATGTTTCCAAACCAAAGAGCATGTTTGCTTTGTAATGGAATATGCT  2028

Query 2221  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2029  GCCGGTGGGGACCTAATGATGCACATTCATACTGATGTCTTTTCTGAACCAAGAGCTGTATTTTATGCTGCTTG  2102

Query 2295  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2103  TGTAGTTCTTGGGTTGCAGTATTTACATGAACACAAAATTGTTTATAGAGATTTGAAATTGGATAACTTATTGC  2176

Query 2369  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2177  TAGATACAGAGGGCTTTGTGAAAATTGCTGATTTTGGTCTTTGCAAAGAAGGAATGGGATATGGAGATAGAACA  2250

Query 2443  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2251  AGCACATTTTGTGGCACTCCTGAATTTCTTGCCCCAGAAGTATTAACAGAAACTTCTTATACAAGGGCTGTAGA  2324

Query 2517  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2325  TTGGTGGGGCCTTGGCGTGCTTATATATGAAATGCTTGTTGGTGAGTCTCCCTTTCCTGGTGATGATGAAGAGG  2398

Query 2591  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2664
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2399  AAGTTTTTGACAGTATTGTAAATGATGAAGTAAGGTATCCAAGGTTCTTATCTACAGAAGCCATTTCTATAATG  2472

Query 2665  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2738
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2473  AGAAGGCTGTTAAGAAGAAATCCTGAACGGCGCCTTGGGGCTAGCGAGAAAGATGCAGAGGATGTAAAAAAGCA  2546

Query 2739  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2812
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2547  CCCATTTTTCCGGCTAATTGATTGGAGCGCTCTGATGGACAAAAAAGTAAAGCCACCATTTATACCTACCATAA  2620

Query 2813  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2621  GAGGACGAGAAGATGTTAGTAATTTTGATGATGAATTTACCTCAGAAGCACCTATTCTGACTCCACCTCGAGAA  2694

Query 2887  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2695  CCAAGGATACTTTCGGAAGAGGAGCAGGAAATGTTCAGAGATTTTGACTACATTGCTGATTGGTGT  2760