Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000489946
• Subject: XM_006518105.3
• Aligned Length: 711
• Identities: 605
• Gaps: 27

Alignment

Query   1  ---------------------------ATGACTGACCCAGTCACATTAAATGTAGGTGGACACTTGTATACAAC  47
                                      ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   1  ATGGATAATGGGGACTGGGGCTATATGATGAGTGACCCAGTCACATTAAATGTAGGTGGACACTTGTACACGAC  74

Query  48  GTCTCTCACCACATTGACGCGTTACCCGGATTCCATGCTTGGAGCTATGTTTGGGGGGGACTTCCCCACAGCTC  121
           .||.||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  75  ATCGCTTACCACGTTGACACGCTACCCGGATTCTATGCTTGGAGCTATGTTTGGGGGTGACTTCCCCACAGCCC  148

Query 122  GAGACCCTCAAGGCAATTACTTTATTGATCGAGATGGACCTCTTTTCCGATATGTCCTCAACTTCTTAAGAACT  195
           ||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||.||.|.|||
Sbjct 149  GAGACCCTCAAGGCAATTACTTCATTGATCGAGACGGACCGCTCTTCCGCTATGTCCTTAACTTCCTACGGACT  222

Query 196  TCAGAATTGACCTTACCGTTGGATTTTAAGGAATTTGATCTGCTTCGGAAAGAAGCAGATTTTTACCAGATTGA  269
           ||||||.||||..|.||..||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||
Sbjct 223  TCAGAACTGACACTCCCCCTGGACTTTAAGGAGTTTGATCTGCTTCGGAAAGAGGCTGATTTCTACCAGATCGA  296

Query 270  GCCCTTGATTCAGTGTCTCAATGATCCTAAGCCTTTGTATCCCATGGATACTTTTGAAGAAGTTGTGGAGCTGT  343
           .|||||||||||||||||||||||.||.|.||||.|||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297  ACCCTTGATTCAGTGTCTCAATGACCCCAGGCCTCTGTATCCTATGGATACTTTTGAAGAAGTCGTAGAGCTGT  370

Query 344  CTAGTACTCGGAAGCTTTCTAAGTACTCCAACCCAGTGGCTGTCATCATAACGCAACTAACCATCACCACTAAG  417
           ||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||..|||||||||||||.|||
Sbjct 371  CTAGCACTCGGAAGCTTTCTAAATATTCCAATCCGGTGGCCGTCATCATCACCCAGTTAACCATCACCACAAAG  444

Query 418  GTCCATTCCTTACTAGAAGGCATCTCAAATTATTTTACCAAGTGGAATAAGCACATGATGGACACCAGAGACTG  491
           |||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GTCCACTCCTTACTCGAAGGCATCTCAAACTATTTCACCAAGTGGAATAAGCACATGATGGACACCAGAGACTG  518

Query 492  CCAGGTTTCCTTTACTTTTGGACCCTGTGATTATCACCAGGAAGTTTCTCTTAGGGTCCACCTGATGGAATACA  565
           ||||||.|||||.||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||||.||||||||.||||
Sbjct 519  CCAGGTCTCCTTCACCTTTGGACCGTGCGATTACCACCAGGAAGTCTCTCTCCGGGTCCATCTGATGGAGTACA  592

Query 566  TTACAAAACAAGGTTTCACGATCCGCAACACCCGGGTGCATCACATGAGTGAGCGGGCCAATGAAAACACAGTG  639
           |.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 593  TCACGAAGCAAGGTTTCACGATCCGCAATACTCGGGTGCATCACATGAGCGAGCGGGCCAATGAGAACACAGTA  666

Query 640  GAGCACAACTGGACTTTCTGTAGGCTAGCCCGGAAGACAGACGAC  684
           |||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 667  GAGCACAACTGGACTTTCTGTAGACTGGCCCGCAAGACGGACGAC  711