Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491254
• Subject: XM_011527856.3
• Aligned Length: 2169
• Identities: 2163
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGCGGAGAGCGGCCCTGGGACGAGATTGAGAAATCTGCCAGTAATGGGGGATGGACTAGAAACTTCCCA  74

Query   75  AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AATGTCTACAACACAGGCCCAGGCCCAACCCCAGCCAGCCAACGCAGCCAGCACCAACCCCCCGCCCCCAGAGA  148

Query  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCTCCAACCCTAACAAGCCCAAGAGGCAGACCAACCAACTGCAATACCTGCTCAGAGTGGTGCTCAAGACACTA  222

Query  223  TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGAAACACCAGTTTGCATGGCCTTTCCAGCAGCCTGTGGATGCCGTCAAGCTGAACCTCCCTGATTACTATAA  296

Query  297  GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCATTAAAACGCCTATGGATATGGGAACAATAAAGAAGCGCTTGGAAAACAACTATTACTGGAATGCTCAGG  370

Query  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AATGTATCCAGGACTTCAACACTATGTTTACAAATTGTTACATCTACAACAAGCCTGGAGATGACATAGTCTTA  444

Query  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ATGGCAGAAGCTCTGGAAAAGCTCTTCTTGCAAAAAATAAATGAGCTACCCACAGAAGAAACCGAGATCATGAT  518

Query  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGTCCAGGCAAAAGGAAGAGGACGTGGGAGGAAAGAAACAGGGACAGCAAAACCTGGCGTTTCCACGGTACCAA  592

Query  593  ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAATCCTCCTCCTGTGCAGGCCACGCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACACAACTCAAGCATCGACTCCTCCGCAGACCCAGACCCCTCAGCCGAATCCTCCTCCTGTGCAGGCCACGCCT  666

Query  667  CACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCCACT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CACCCCTTCCCTGCCGTCACCCCGGACCTCATCGTCCAGACCCCTGTCATGACAGTGGTGCCTCCCCAGCCACT  740

Query  741  GCAGACGCCCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCAACCCGCTTCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCCAC  814
            ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCAGACG-CCCCCGCCAGTGCCCCCCCAGCCACAACCCCCACCCGCTCCAGCTCCCCAGCCCGTACAGAGCCAC  813

Query  815  CCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACCAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  CCACCCATCATCGCGGCCACCCCACAGCCTGTGAAGACAAAGAAGGGAGTGAAGAGGAAAGCAGACACCACCAC  887

Query  889  CCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  CCCCACCACCATTGACCCCATTCACGAGCCACCCTCGCTGCCCCCGGAGCCCAAGACCACCAAGCTGGGCCAGC  961

Query  963  GGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCACCAGAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  GGCGGGAGAGCAGCCGGCCTGTGAAACCTCCAAAGAAGGACGTGCCCGACTCTCAGCAGCACCCAGCACCAGAG  1035

Query 1037  AAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCACGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  AAGAGCAGCAAGGTCTCGGAGCAGCTCAAGTGCTGCAGCGGCATCCTCAAGGAGATGTTTGCCAAGAAGCACGC  1109

Query 1111  CGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCATCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  CGCCTACGCCTGGCCCTTCTACAAGCCTGTGGACGTGGAGGCACTGGGCCTACACGACTACTGTGACATCATCA  1183

Query 1185  AGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTGGT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  AGCACCCCATGGACATGAGCACAATCAAGTCTAAACTGGAGGCCCGTGAGTACCGTGATGCTCAGGAGTTTGGT  1257

Query 1259  GCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATGGCCCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GCTGACGTCCGATTGATGTTCTCCAACTGCTATAAGTACAACCCTCCTGACCATGAGGTGGTGGCCATGGCCCG  1331

Query 1333  CAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGTGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  CAAGCTCCAGGATGTGTTCGAAATGCGCTTTGCCAAGATGCCGGACGAGCCTGAGGAGCCAGTGGTGGCCGTGT  1405

Query 1407  CCTCCCCCGGCAGTGCTCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCATCCCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCT  1480
            ||| ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  CCT-CCCCGGCAGTGCCCCCTCCCACCAAGGTTGTGGCCCCGCCCTCAT-CCAGCGACAGCAGCAGCGATAGCT  1477

Query 1481  CCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  CCTCGGACAGTGACAGTTCGACTGATGACTCTGAGGAGGAGCGAGCCCAGCGGCTGGCTGAGCTCCAGGAGCAG  1551

Query 1555  CTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAAGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552  CTCAAAGCCGTGCACGAGCAGCTTGCAGCCCTCTCTCAGCCCCAGCAGAACAAACCAAAGAAAAAGGAGAAAGA  1625

Query 1629  CAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCAAGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626  CAAGAAGGAAAAGAAAAAAGAAAAGCACAAAAGGAAAGAGGAAGTGGAAGAGAATAAAAAAAGCAAAGCCAAGG  1699

Query 1703  AACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700  AACCTCCTCCTAAAAAGACGAAGAAAAATAATAGCAGCAACAGCAATGTGAGCAAGAAGGAGCCAGCGCCCATG  1773

Query 1777  AAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774  AAGAGCAAGCCCCCTCCCACGTATGAGTCGGAGGAAGAGGACAAGTGCAAGCCTATGTCCTATGAGGAGAAGCG  1847

Query 1851  GCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGGG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848  GCAGCTCAGCTTGGACATCAACAAGCTCCCCGGCGAGAAGCTGGGCCGCGTGGTGCACATCATCCAGTCACGGG  1921

Query 1925  AGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTGCGT  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922  AGCCCTCCCTGAAGAATTCCAACCCCGACGAGATTGAAATCGACTTTGAGACCCTGAAGCCGTCCACACTGCGT  1995

Query 1999  GAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996  GAGCTGGAGCGCTATGTCACCTCCTGTTTGCGGAAGAAAAGGAAACCTCAAGCTGAGAAAGTTGATGTGATTGC  2069

Query 2073  CGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070  CGGCTCCTCCAAGATGAAGGGCTTCTCGTCCTCAGAGTCGGAGAGCTCCAGTGAGTCCAGCTCCTCTGACAGCG  2143

Query 2147  AAGACTCCGAAACAGGTCCTGCC  2169
            |||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144  AAGACTCCGAAACAGGTCCTGCC  2166