Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491255
• Subject: XM_011516909.1
• Aligned Length: 1740
• Identities: 1539
• Gaps: 201

Alignment

Query    1  ATGTGGCGACCGGTGCAGCTCTGTCATTTCCACTCTGCTCTGCTGCACAGAAGGCAGAAGCCCTGGCCGTCCCC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGCTGTGTTCTTCAGGAGAAACGTCAGGGGCCTTCCTCCAAGGTTCTCCAGCCCCACACCCCTGTGGAGGAAGG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGCTCTCCACCGCGGTAGTGGGGGCGCCCCTGCTCCTCGGAGCCCGCTATGTCATGGCAGAGGCACGGGAGAAG  222
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGGCAGAGGCACGGGAGAAG  21

Query  223  AGGAGGATGCGGCTCGTGGTGGATGGCATGGGGCGCTTTGGCAGGTCTCTGAAGGTCGGCCTGCAGATCTCCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  AGGAGGATGCGGCTCGTGGTGGATGGCATGGGGCGCTTTGGCAGGTCTCTGAAGGTCGGCCTGCAGATCTCCCT  95

Query  297  GGACTACTGGTGGTGCACCAATGTTGTCCTTCGAGGGGTGGAAGAGAACAGCCCAGGCTACTTGGAGGTGATGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  GGACTACTGGTGGTGCACCAATGTTGTCCTTCGAGGGGTGGAAGAGAACAGCCCAGGCTACTTGGAGGTGATGT  169

Query  371  CTGCGTGTCACCAGCGGGCGGCTGATGCCCTGGTGGCAGGGGCCATCAGCAACGGGGGCCTCTACGTGAAGCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  CTGCGTGTCACCAGCGGGCGGCTGATGCCCTGGTGGCAGGGGCCATCAGCAACGGGGGCCTCTACGTGAAGCTG  243

Query  445  GGCCAGGGGCTGTGCTCCTTCAACCACCTGCTTCCCCCCGAGTATACCCGGACCCTGCGCGTGCTAGAGGACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  GGCCAGGGGCTGTGCTCCTTCAACCACCTGCTTCCCCCCGAGTATACCCGGACCCTGCGCGTGCTAGAGGACAG  317

Query  519  GGCCCTCAAGCGGGGCTTCCAGGAGGTGGATGAGTTGTTCCTTGAGGACTTCCAGGCCCTCCCCCACGAGCTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  GGCCCTCAAGCGGGGCTTCCAGGAGGTGGATGAGTTGTTCCTTGAGGACTTCCAGGCCCTCCCCCACGAGCTCT  391

Query  593  TCCAGGAGTTTGACTACCAGCCAATTGCTGCCGCCAGCCTGGCACAGGTGCACAGAGCCAAGCTGCACGATGGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TCCAGGAGTTTGACTACCAGCCAATTGCTGCCGCCAGCCTGGCACAGGTGCACAGAGCCAAGCTGCACGATGGC  465

Query  667  ACCAGCGTGGCTGTGAAGGTGCAGTACATCGACCTGCGGGACCGCTTTGATGGGGACATCCACACCCTGGAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  ACCAGCGTGGCTGTGAAGGTGCAGTACATCGACCTGCGGGACCGCTTTGATGGGGACATCCACACCCTGGAGCT  539

Query  741  CCTGCTGCGGCTCGTTGAGGTCATGCACCCCAGCTTTGGCTTCAGCTGGGTCCTCCAGGACCTGAAGGGGACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CCTGCTGCGGCTCGTTGAGGTCATGCACCCCAGCTTTGGCTTCAGCTGGGTCCTCCAGGACCTGAAGGGGACCC  613

Query  815  TGGCCCAGGAGCTGGACTTCGAGAATGAGGGCCGCAACGCAGAGCGCTGTGCGCGGGAGCTGGCGCACTTCCCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  TGGCCCAGGAGCTGGACTTCGAGAATGAGGGCCGCAACGCAGAGCGCTGTGCGCGGGAGCTGGCGCACTTCCCC  687

Query  889  TACGTCGTGGTGCCCCGCGTGCACTGGGACAAGTCCAGCAAGCGCGTGCTCACTGCCGACTTCTGCGCCGGCTG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  TACGTCGTGGTGCCCCGCGTGCACTGGGACAAGTCCAGCAAGCGCGTGCTCACTGCCGACTTCTGCGCCGGCTG  761

Query  963  CAAGGTCAACGATGTGGAGGCCATCAGGAGCCAGGGGCTGGCAGTGCATGACATAGCAGAAAAGCTCATCAAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  CAAGGTCAACGATGTGGAGGCCATCAGGAGCCAGGGGCTGGCAGTGCATGACATAGCAGAAAAGCTCATCAAGG  835

Query 1037  CCTTTGCTGAGCAGATATTTTACACCGGCTTCATCCACTCGGACCCACATCCTGGCAACGTTCTGGTGCGGAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  CCTTTGCTGAGCAGATATTTTACACCGGCTTCATCCACTCGGACCCACATCCTGGCAACGTTCTGGTGCGGAAA  909

Query 1111  GGCCCGGACGGGAAAGCGGAGCTGGTGCTGCTGGACCACGGGCTCTACCAGTTCCTGGAGGAGAAGGACCGCGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  GGCCCGGACGGGAAAGCGGAGCTGGTGCTGCTGGACCACGGGCTCTACCAGTTCCTGGAGGAGAAGGACCGCGC  983

Query 1185  AGCCCTCTGCCAGCTGTGGCGGGCCATCATCCTGCGGGACGACGCCGCCATGAGGGCGCACGCAGCCGCACTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  AGCCCTCTGCCAGCTGTGGCGGGCCATCATCCTGCGGGACGACGCCGCCATGAGGGCGCACGCAGCCGCACTGG  1057

Query 1259  GGGTGCAAGACTACCTCCTGTTCGCCGAGATGCTCATGCAGCGCCCCGTGCGCCTGGGGCAGCTGTGGGGCTCG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  GGGTGCAAGACTACCTCCTGTTCGCCGAGATGCTCATGCAGCGCCCCGTGCGCCTGGGGCAGCTGTGGGGCTCG  1131

Query 1333  CACCTACTGAGCCGCGAAGAGGCGGCCTACATGGTGGACATGGCCCGCGAGCGCTTCGAGGCCGTCATGGCGGT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  CACCTACTGAGCCGCGAAGAGGCGGCCTACATGGTGGACATGGCCCGCGAGCGCTTCGAGGCCGTCATGGCGGT  1205

Query 1407  GCTCAGGGAGCTGCCGCGGCCCATGCTGCTGGTGCTGCGCAACATCAACACCGTGCGCGCTATCAACGTGGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  GCTCAGGGAGCTGCCGCGGCCCATGCTGCTGGTGCTGCGCAACATCAACACCGTGCGCGCTATCAACGTGGCCC  1279

Query 1481  TCGGCGCCCCCGTGGACCGCTACTTCCTTATGGCTAAAAGGGCTGTCCGGGGCTGGAGCCGCCTGGCGGGCGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1280  TCGGCGCCCCCGTGGACCGCTACTTCCTTATGGCTAAAAGGGCTGTCCGGGGCTGGAGCCGCCTGGCGGGCGCC  1353

Query 1555  ACGTATCGGGGTGTCTACGGCACCAGCCTCCTGCGCCACGCCAAGGTCGTCTGGGAGATGCTCAAGTTTGAAGT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354  ACGTATCGGGGTGTCTACGGCACCAGCCTCCTGCGCCACGCCAAGGTCGTCTGGGAGATGCTCAAGTTTGAAGT  1427

Query 1629  GGCGCTCAGGCTGGAGACCTTGGCCATGCGGCTGACCGCCCTCCTGGCTCGTGCTCTGGTCCACCTGAGCCTCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428  GGCGCTCAGGCTGGAGACCTTGGCCATGCGGCTGACCGCCCTCCTGGCTCGTGCTCTGGTCCACCTGAGCCTCG  1501

Query 1703  TGCCCCCAGCGGAGGAGCTCTACCAGTACCTGGAGACC  1740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1502  TGCCCCCAGCGGAGGAGCTCTACCAGTACCTGGAGACC  1539