Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491277
• Subject: NR_047583.1
• Aligned Length: 4040
• Identities: 2335
• Gaps: 1704

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TGCAGAGCACAGAGAAAGGACATCTGCGAGGAAAGTTCCCTGATGGCTGTCAACAAAGTGCCACGTCTCTATGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGTGAACGCTGAGCACACGATTTTATCGCGCCTATCATATCTTGGTGCATAAACGCACCTCACCTCGGTCAAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCTTGCTCCGTCTTATGAGACAGGCTTTATTATCCGCATTTTATATGAGGGGAAACTGACGGTGGAGAGAGAAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TATCTTGCTCAAGGCGACACAGCAGAGCCCACAGGTGGCAGAATCCCACCCGAGCCCGCTTCGACCCGCGGGGT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GGAAACCACGGGCGCCCGCCCGGCTGCGCTTCCAGAGCTGAACTGAGAAGCGAGTCCTCTCCGCCCTGCGGCCA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CCGCCCAGCCCCGACCCCCGCCCCGGCCCGATCCTCACTCGCCGCCAGCTCCCCGCGCCCACCCCGGAGTTGGT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  GGCGCAGAGGCGGGAGGCGGAGGCGGGAGGGCGGGCGCTGGCACCGGGAACGCCCGAGCGCCGGCAGAGAGCGC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  GGAGAGCGCGACACGTGCGGCCCAGAGCACCGGGGCCACCCGGTCCCCGCAGGCCCGGGACCGCGCCCGCTGGC  592

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTC  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCGACACGTGGAAGAATACGGAGTTCTATACCAGAGTTGATTGTTGATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTC  666

Query   27  ATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAATAGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGA  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAATAGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGA  740

Query  101  CTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTACATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGC  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTACATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGC  814

Query  175  TGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGACAGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGACAGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCA  888

Query  249  CTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTTTGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATA  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTTTGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATA  962

Query  323  GTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTCCAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTCCAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGC  1036

Query  397  ATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGACGAGACACCCACTTATACACTGAGTA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGACGAGACACCCACTTATACACTGAGTA  1110

Query  471  TACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATGTAAAGACATTTATTGTGACTATTTGG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATGTAAAGACATTTATTGTGACTATTTGG  1184

Query  545  ACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAGCCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAGCCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTT  1258

Query  619  GGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTGAGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAG  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTGAGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAG  1332

Query  693  AATCAAATTTCAAAAGGCTTCCGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAGAGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATC  766
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATCAAATTTCAAAAGGCTTCTGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAGAGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATC  1406

Query  767  GACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATGTTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGAT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATGTTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGAT  1480

Query  841  TTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCTAAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCTAAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTG  1554

Query  915  GAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCCTACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCCTACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACA  1628

Query  989  TGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGAAGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGAAGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGA  1702

Query 1063  GGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGGAAAGCCATGACACAGAACATCACAGG  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGGAAAGCCATGACACAGAACATCACAGG  1776

Query 1137  ACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGTGGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGTGGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAG  1850

Query 1211  GCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAGGGTTGCTGGCTCCTCGCCAGGTCTCT  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAGGGTTGCTGGCTCCTCGCCAGGTCTCT  1924

Query 1285  GCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCCAGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCCAGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGA  1998

Query 1359  GTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGTCCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGAC  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGTCCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGAC  2072

Query 1433  CCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCTGTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTC  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCTGTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTC  2146

Query 1507  TCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCACAAAGCACCACTGAGTGGCCCCCACAT  1580
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 2147  TCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCACAAA-----------------------  2197

Query 1581  TAATGCCATCACAGAGGAAAAGGGGAGCATTTTAATTTCATGGAACAGCATTCCAGTCCAGGAGCAAATGGGCT  1654
                                                                                      
Sbjct 2198  --------------------------------------------------------------------------  2197

Query 1655  GCCTCCTCCATTATAGGATATACTGGAAGGAACGGGACTCCAACTCCCAGCCTCAGCTCTGTGAAATTCCCTAC  1728
                                                                          ||||||||||||
Sbjct 2198  --------------------------------------------------------------GAAATTCCCTAC  2209

Query 1729  AGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTGACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCT  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2210  AGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTGACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCT  2283

Query 1803  GACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCTGCAAGGTAAAGCCAATTGGATGGCGT  1876
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
Sbjct 2284  GACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCTGCAAG---------------------  2336

Query 1877  TTGTGGCACCAAGCATTTGCATTGCTATCATCATGGTGGGCATTTTCTCAACGCATTACTTCCAGCAAAAGGTG  1950
                                                                                  ||||
Sbjct 2337  ----------------------------------------------------------------------GGTG  2340

Query 1951  TTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATTCCAGATCCAGCAAATAGCACTTGCGC  2024
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2341  TTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATTCCAGATCCAGCAAATAGCACTTGCGC  2414

Query 2025  TAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAGGCTCCTGATAGACTGGCCCACGCCTG  2098
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2415  TAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAGGCTCCTGATAGACTGGCCCACGCCTG  2488

Query 2099  AAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCCCAGTTTTCAGACATCCCCCCTGCTCC  2172
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2489  AAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCCCAGTTTTCAGACATCCCCCCTGCTCC  2562

Query 2173  AACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAGAAAGACATGATGCACAGTGCCTCAAG  2246
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2563  AACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAGAAAGACATGATGCACAGTGCCTCAAG  2636

Query 2247  CCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGATCTGTACAAGGTGCTGGAGAGCAGGG  2320
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2637  CCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGATCTGTACAAGGTGCTGGAGAGCAGGG  2710

Query 2321  GCTCCGACCCAAAGCCCGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCCCAGCAGGTGACCTTCCCACCCATGAT  2394
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2711  GCTCCGACCCAAAGCCCGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCCCAGCAGGTGACCTTCCCACCCATGAT  2784

Query 2395  GGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCTCTCGCTGACTCTCTGGAAGAACTGGA  2468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2785  GGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCTCTCGCTGACTCTCTGGAAGAACTGGA  2858

Query 2469  GCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCCACTCACCTTCTCCTGTGGTGATAAGC  2542
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2859  GCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCCACTCACCTTCTCCTGTGGTGATAAGC  2932

Query 2543  TGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTC------------------------------  2586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct 2933  TGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTCTGAGTGGTGAGGCTTCAAGCCTTAAAGTCA  3006

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3007  GTGTGCCCTCAACCAGCACAGCCTGCCCCAATTCCCCCAGCCCCTGCTCCAGCAGCTGTCATCTCTGGGTGCCA  3080

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3081  CCATCGGTCTGGCTGCAGCTAGAGGACAGGCAAGCCAGCTCTGGGGGAGTCTTAGGAACTGGGAGTTGGTCTTC  3154

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3155  ACTCAGATGCCTCATCTTGCCTTTCCCAGGGCCTTAAAATTACATCCTTCACTGTGTGGACCTAGAGACTCCAA  3228

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3229  CTTGAATTCCTAGTAACTTTCTTGGTATGCTGGCCAGAAAGGGAAATGAGGAGGAGAGTAGAAACCACAGCTCT  3302

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3303  TAGTAGTAATGGCATACAGTCTAGAGGACCATTCATGCAATGACTATTTCTAAAGCACCTGCTACACAGCAGGC  3376

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3377  TGTACACAGCAGATCAGTACTGTTCAACAGAACTTCCTGAGATGATGGAAATGTTCTACCTCTGCACTCACTGT  3450

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3451  CCAGTACATTAGACACTAGGCACATTGGCTGTTAATCACTTGGAATGTGTTTAGCTTGACTGAGGAATTAAATT  3524

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3525  TTGATTGTAAATTTAAATCGCCACACATGGCTAGTGGCTACTGTATTGGAGTGCACAGCTCTAGATGGCTCCTA  3598

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3599  GATTATTGAGAGCCTTCAAAACAAATCAACCTAGTTCTATAGATGAAGACATAAAAGACACTGGTAAACACCAA  3672

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3673  GGTAAAAGGGCCCCCAAGGTGGTCATGACTGGTCTCATTTGCAGAAGTCTAAGAATGTACCTTTTTCTGGCCGG  3746

Query 2587  --------------------------------------------  2586
                                                        
Sbjct 3747  GCGTGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA  3790