Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491277
• Subject: NR_047584.1
• Aligned Length: 4133
• Identities: 2585
• Gaps: 1547

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  TGCAGAGCACAGAGAAAGGACATCTGCGAGGAAAGTTCCCTGATGGCTGTCAACAAAGTGCCACGTCTCTATGG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CTGTGAACGCTGAGCACACGATTTTATCGCGCCTATCATATCTTGGTGCATAAACGCACCTCACCTCGGTCAAC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CCTTGCTCCGTCTTATGAGACAGGCTTTATTATCCGCATTTTATATGAGGGGAAACTGACGGTGGAGAGAGAAT  222

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  223  TATCTTGCTCAAGGCGACACAGCAGAGCCCACAGGTGGCAGAATCCCACCCGAGCCCGCTTCGACCCGCGGGGT  296

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  297  GGAAACCACGGGCGCCCGCCCGGCTGCGCTTCCAGAGCTGAACTGAGAAGCGAGTCCTCTCCGCCCTGCGGCCA  370

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  371  CCGCCCAGCCCCGACCCCCGCCCCGGCCCGATCCTCACTCGCCGCCAGCTCCCCGCGCCCACCCCGGAGTTGGT  444

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  445  GGCGCAGAGGCGGGAGGCGGAGGCGGGAGGGCGGGCGCTGGCACCGGGAACGCCCGAGCGCCGGCAGAGAGCGC  518

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  519  GGAGAGCGCGACACGTGCGGCCCAGAGCACCGGGGCCACCCGGTCCCCGCAGGCCCGGGACCGCGCCCGCTGGC  592

Query    1  ------------------------------------------------ATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTC  26
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCGACACGTGGAAGAATACGGAGTTCTATACCAGAGTTGATTGTTGATGGCACATACTTTTAGAGGATGCTC  666

Query   27  ATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAATAGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGA  100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATTGGCATTTATGTTTATAATCACGTGGCTGTTGATTAAAGCAAAAATAGATGCGTGCAAGAGAGGCGATGTGA  740

Query  101  CTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTACATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGC  174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTGTGAAGCCTTCCCATGTAATTTTACTTGGATCCACTGTCAATATTACATGCTCTTTGAAGCCCAGACAAGGC  814

Query  175  TGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGACAGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCA  248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGCTTTCACTATTCCAGACGTAACAAGTTAATCCTGTACAAGTTTGACAGAAGAATCAATTTTCACCATGGCCA  888

Query  249  CTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTTTGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATA  322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTCCCTCAATTCTCAAGTCACAGGTCTTCCCCTTGGTACAACCTTGTTTGTCTGCAAACTGGCCTGTATCAATA  962

Query  323  GTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTCCAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGC  396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTGATGAAATTCAAATATGTGGAGCAGAGATCTTCGTTGGTGTTGCTCCAGAACAGCCTCAAAATTTATCCTGC  1036

Query  397  ATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGACGAGACACCCACTTATACACTGAGTA  470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATACAGAAGGGAGAACAGGGGACTGTGGCCTGCACCTGGGAAAGAGGACGAGACACCCACTTATACACTGAGTA  1110

Query  471  TACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATGTAAAGACATTTATTGTGACTATTTGG  544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  TACTCTACAGCTAAGTGGACCAAAAAATTTAACCTGGCAGAAGCAATGTAAAGACATTTATTGTGACTATTTGG  1184

Query  545  ACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAGCCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTT  618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  ACTTTGGAATCAACCTCACCCCTGAATCACCTGAATCCAATTTCACAGCCAAGGTTACTGCTGTCAATAGTCTT  1258

Query  619  GGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTGAGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAG  692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGAAGCTCCTCTTCACTTCCATCCACATTCACATTCTTGGACATAGTGAGGCCTCTTCCTCCGTGGGACATTAG  1332

Query  693  AATCAAATTTCAAAAGGCTTCCGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAGAGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATC  766
            |||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AATCAAATTTCAAAAGGCTTCTGTGAGCAGATGTACCCTTTATTGGAGAGATGAGGGACTGGTACTGCTTAATC  1406

Query  767  GACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATGTTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGAT  840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GACTCAGATATCGGCCCAGTAACAGCAGGCTCTGGAATATGGTTAATGTTACAAAGGCCAAAGGAAGACATGAT  1480

Query  841  TTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCTAAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTG  914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTGCTGGATCTGAAACCATTTACAGAATATGAATTTCAGATTTCCTCTAAGCTACATCTTTATAAGGGAAGTTG  1554

Query  915  GAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCCTACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACA  988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGTGATTGGAGTGAATCATTGAGAGCACAAACACCAGAAGAAGAGCCTACTGGGATGTTAGATGTCTGGTACA  1628

Query  989  TGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGAAGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGA  1062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGAAACGGCACATTGACTACAGTAGACAACAGATTTCTCTTTTCTGGAAGAATCTGAGTGTCTCAGAGGCAAGA  1702

Query 1063  GGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGGAAAGCCATGACACAGAACATCACAGG  1136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GGAAAAATTCTCCACTATCAGGTGACCTTGCAGGAGCTGACAGGAGGGAAAGCCATGACACAGAACATCACAGG  1776

Query 1137  ACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGTGGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAG  1210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  ACACACCTCCTGGACCACAGTCATTCCTAGAACCGGAAATTGGGCTGTGGCTGTGTCTGCAGCAAATTCAAAAG  1850

Query 1211  GCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAGGGTTGCTGGCTCCTCGCCAGGTCTCT  1284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  GCAGTTCTCTGCCCACTCGTATTAACATAATGAACCTGTGTGAGGCAGGGTTGCTGGCTCCTCGCCAGGTCTCT  1924

Query 1285  GCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCCAGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGA  1358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GCAAACTCAGAGGGCATGGACAACATTCTGGTGACTTGGCAGCCTCCCAGGAAAGATCCCTCTGCTGTTCAGGA  1998

Query 1359  GTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGTCCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGAC  1432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTACGTGGTGGAATGGAGAGAGCTCCATCCAGGGGGTGACACACAGGTCCCTCTAAACTGGCTACGGAGTCGAC  2072

Query 1433  CCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCTGTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTC  1506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  CCTACAATGTGTCTGCTCTGATTTCAGAGAACATAAAATCCTACATCTGTTATGAAATCCGTGTGTATGCACTC  2146

Query 1507  TCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCACAAAGCACCACTGAGTGGCCCCCACAT  1580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  TCAGGGGATCAAGGAGGATGCAGCTCCATCCTGGGTAACTCTAAGCACAAAGCACCACTGAGTGGCCCCCACAT  2220

Query 1581  TAATGCCATCACAGAGGAAAAGGGGAGCATTTTAATTTCATGGAACAGCATTCCAGTCCAGGAGCAAATGGGCT  1654
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  TAATGCCATCACAGAGGAAAAGGGGAGCATTTTAATTTCATGGAACAGCATTCCAGTCCAGGAGCAAATGGGCT  2294

Query 1655  GCCTCCTCCATTATAGGATATACTGGAAGGAACGGGACTCCAACTCCCAGCCTCAGCTCTGTGAAATTCCCTAC  1728
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  GCCTCCTCCATTATAGGATATACTGGAAGGAACGGGACTCCAACTCCCAGCCTCAGCTCTGTGAAATTCCCTAC  2368

Query 1729  AGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTGACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCT  1802
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AGAGTCTCCCAAAATTCACATCCAATAAACAGCCTGCAGCCCCGAGTGACATATGTCCTGTGGATGACAGCTCT  2442

Query 1803  GACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCTGCAAGGTAAAGCCAATTGGATGGCGT  1876
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GACAGCTGCTGGTGAAAGTTCCCACGGAAATGAGAGGGAATTTTGTCTGCAAGGTAAAGCCAATTGGATGGCGT  2516

Query 1877  TTGTGGCACCAAGCATTTGCATTGCTATCATCATGGTGGGCATTTTCTCAACGCATTACTTCCAGCAAAA----  1946
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
Sbjct 2517  TTGTGGCACCAAGCATTTGCATTGCTATCATCATGGTGGGCATTTTCTCAACGCATTACTTCCAGCAAAAAGAC  2590

Query 1947  --------------------------------------------------------------------------  1946
                                                                                      
Sbjct 2591  AGGGTTTCATCATGTTGGCCAGACTGGTCCCGAACTCCTGACCTCAAGTGATCCACCTGCCTCAGCCTCCCAAA  2664

Query 1947  ---------------GGTGTTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATTCCAGATC  2005
                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  GTGCTGGGATTACAGGGTGTTTGTTCTCCTAGCAGCCCTCAGACCTCAGTGGTGTAGCAGAGAAATTCCAGATC  2738

Query 2006  CAGCAAATAGCACTTGCGCTAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAGGCTCCTG  2079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  CAGCAAATAGCACTTGCGCTAAGAAATATCCCATTGCAGAGGAGAAGACACAGCTGCCCTTGGACAGGCTCCTG  2812

Query 2080  ATAGACTGGCCCACGCCTGAAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCCCAGTTTT  2153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  ATAGACTGGCCCACGCCTGAAGATCCTGAACCGCTGGTCATCAGTGAAGTCCTTCATCAAGTGACCCCAGTTTT  2886

Query 2154  CAGACATCCCCCCTGCTCCAACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAGAAAGACA  2227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887  CAGACATCCCCCCTGCTCCAACTGGCCACAAAGGGAAAAAGGAATCCAAGGTCATCAGGCCTCTGAGAAAGACA  2960

Query 2228  TGATGCACAGTGCCTCAAGCCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGATCTGTAC  2301
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TGATGCACAGTGCCTCAAGCCCACCACCTCCAAGAGCTCTCCAAGCTGAGAGCAGACAACTGGTGGATCTGTAC  3034

Query 2302  AAGGTGCTGGAGAGCAGGGGCTCCGACCCAAAGCCCGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCCCAGCAGG  2375
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  AAGGTGCTGGAGAGCAGGGGCTCCGACCCAAAGCCCGAAAACCCAGCCTGTCCCTGGACGGTGCTCCCAGCAGG  3108

Query 2376  TGACCTTCCCACCCATGATGGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCTCTCGCTG  2449
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  TGACCTTCCCACCCATGATGGCTACTTACCCTCCAACATAGATGACCTCCCCTCACATGAGGCACCTCTCGCTG  3182

Query 2450  ACTCTCTGGAAGAACTGGAGCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCCACTCACC  2523
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  ACTCTCTGGAAGAACTGGAGCCTCAGCACATCTCCCTTTCTGTTTTCCCCTCAAGTTCTCTTCACCCACTCACC  3256

Query 2524  TTCTCCTGTGGTGATAAGCTGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTC-----------  2586
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||           
Sbjct 3257  TTCTCCTGTGGTGATAAGCTGACTCTGGATCAGTTAAAGATGAGGTGTGACTCCCTCATGCTCTGAGTGGTGAG  3330

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3331  GCTTCAAGCCTTAAAGTCAGTGTGCCCTCAACCAGCACAGCCTGCCCCAATTCCCCCAGCCCCTGCTCCAGCAG  3404

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3405  CTGTCATCTCTGGGTGCCACCATCGGTCTGGCTGCAGCTAGAGGACAGGCAAGCCAGCTCTGGGGGAGTCTTAG  3478

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3479  GAACTGGGAGTTGGTCTTCACTCAGATGCCTCATCTTGCCTTTCCCAGGGCCTTAAAATTACATCCTTCACTGT  3552

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3553  GTGGACCTAGAGACTCCAACTTGAATTCCTAGTAACTTTCTTGGTATGCTGGCCAGAAAGGGAAATGAGGAGGA  3626

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3627  GAGTAGAAACCACAGCTCTTAGTAGTAATGGCATACAGTCTAGAGGACCATTCATGCAATGACTATTTCTAAAG  3700

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3701  CACCTGCTACACAGCAGGCTGTACACAGCAGATCAGTACTGTTCAACAGAACTTCCTGAGATGATGGAAATGTT  3774

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3775  CTACCTCTGCACTCACTGTCCAGTACATTAGACACTAGGCACATTGGCTGTTAATCACTTGGAATGTGTTTAGC  3848

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3849  TTGACTGAGGAATTAAATTTTGATTGTAAATTTAAATCGCCACACATGGCTAGTGGCTACTGTATTGGAGTGCA  3922

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3923  CAGCTCTAGATGGCTCCTAGATTATTGAGAGCCTTCAAAACAAATCAACCTAGTTCTATAGATGAAGACATAAA  3996

Query 2587  --------------------------------------------------------------------------  2586
                                                                                      
Sbjct 3997  AGACACTGGTAAACACCAAGGTAAAAGGGCCCCCAAGGTGGTCATGACTGGTCTCATTTGCAGAAGTCTAAGAA  4070

Query 2587  ---------------------------------------------------------------  2586
                                                                           
Sbjct 4071  TGTACCTTTTTCTGGCCGGGCGTGGTAGCTCATGCCTGTAATCCCAGCACTTTGGGAGGCTGA  4133