Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491296
• Subject: NM_015529.4
• Aligned Length: 1949
• Identities: 1695
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGGTATCAAATGTTCATTCATTCCATCTCTTGATGCTCTACGATATTATCAGTCTACACT-----ATGCTTTC  69
                      ||||.| |.|...||       |.|||||               ||.|..|     .||||..|
Sbjct    1  ----------ATGTGC-TGCTGGCC-------GCTGCTC---------------CTGCTGTGGGGGCTGCTCCC  41

Query   70  CTGAAAGGC---------------CAGAAGTTCAAAGATGGACTAGTTTCCCAGGGACCTGATTCCCCAGTTGG  128
            |.|.|.|||               |.|||            .|||   |||   |.|||.||   |||...|||
Sbjct   42  CGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAA------------CCTA---TCC---GCACCGGA---CCCTCCTGG  94

Query  129  AATACTCCAGCCCCTTGGAAATTCCCGGGATTTATACAATAACT-------CTAGA----------CAACAAGA  185
            |            ||.|||       |||       |||..|||       ||.||          ||.|.|||
Sbjct   95  A------------CTCGGA-------GGG-------CAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGCGGGGCAGCCAGA  142

Query  186  CTTTGTCTT-----TAAAGGT-----------CCTATGAATTCTT----TTCTCTC------------TGTATT  227
              |.|.|||     |..||||           .|||.|....|||    |||||.|            ||    
Sbjct  143  --TCGCCTTCCGCCTCCAGGTGCGCACTGCAGGCTACGTGGGCTTCGGCTTCTCGCCCACCGGGGCCATG----  210

Query  228  TAG-GT--------ATC------------------------CTGATTTTTCCTTTCCATATTTTCCACAGGATT  268
              | ||        |||                        |.|      ||.|.||      ||  |||||||
Sbjct  211  --GCGTCCGCCGACATCGTCGTGGGCGGGGTGGCCCACGGGCGG------CCCTACC------TC--CAGGATT  268

Query  269  ATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAAT  342
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  ATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATGGAAAAT  342

Query  343  AGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAG  416
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  AGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAACGGATAG  416

Query  417  CACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATA  490
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  CACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACTCCAATA  490

Query  491  GGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGAT  564
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  GGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATACTTTGAT  564

Query  565  CTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTT  638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  CTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCCTGTGTT  638

Query  639  CCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCC  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  CCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACCACATCC  712

Query  713  TGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATG  786
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  TGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCCAACATG  786

Query  787  CCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACC  860
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  CCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTATCCACC  860

Query  861  TCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCA  934
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATAATCCCA  934

Query  935  CTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCT  1008
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  CTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATATGATGCT  1008

Query 1009  GGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGA  1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCAGTCTGA  1082

Query 1083  GGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTG  1156
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGTTTGCTG  1156

Query 1157  TTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTA  1230
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1157  TTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATGAAATTA  1230

Query 1231  CTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACC  1304
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1231  CTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAATCTTACC  1304

Query 1305  AGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCA  1378
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1305  AGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGACTAAGCA  1378

Query 1379  CCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCA  1452
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1379  CCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGTATTCCA  1452

Query 1453  GACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTAT  1526
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1453  GACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTTCATTAT  1526

Query 1527  CAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAG  1600
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1527  CAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAAAGGAAG  1600

Query 1601  GTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGG  1674
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1601  GTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCTGAGTGG  1674

Query 1675  TCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCAC  1748
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1675  TCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTGTGGCAC  1748

Query 1749  GTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGC  1822
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1749  GTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCTGCACGC  1822

Query 1823  TGAGCACCAAGAGCTTGTGAAAGCT  1847
            |||||||||||||||||        
Sbjct 1823  TGAGCACCAAGAGCTTG--------  1839