Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491296
- Subject:
- XM_017010714.2
- Aligned Length:
- 1881
- Identities:
- 1668
- Gaps:
- 181
Alignment
Query 1 ATGGTATCAAATGTTCATTCATTCCATCTCTTGATGCTCTACGATATTATCAGTCTACACT-----ATGCTTTC 69
||||.| |.|...|| |.||||| ||.|..| .||||..|
Sbjct 1 ----------ATGTGC-TGCTGGCC-------GCTGCTC---------------CTGCTGTGGGGGCTGCTCCC 41
Query 70 CTGAAAGGC---------------CAGAAGTTCAAAGATGGACTAGTTTCCCAGGGACCTGATTCCCCAGTTGG 128
|.|.|.||| |.||| .||| ||| |.|||.|| |||...|||
Sbjct 42 CGGGACGGCGGCGGGGGGCTCGGGCCGAA------------CCTA---TCC---GCACCGGA---CCCTCCTGG 94
Query 129 AATACTCCAGCCCCTTGGAAATTCCCGGGATTTATACAATAACT--CT-------AGACAACAAGACTTTGTCT 193
| ||.||| ||| |||..||| || ||.||.|
Sbjct 95 A------------CTCGGA-------GGG-------CAAGTACTGGCTGGGCTGGAGCCAGC------------ 130
Query 194 TTAAAGGTCCTATGAATTCTTTTCTCTCTGTATTTAGGTATCCTGATTTTTCCTT-----TCCATATTTTCCAC 262
|| ||.|.||.|| |..|||| || |
Sbjct 131 -----GG-----------------------------GGCAGCCAGA--TCGCCTTCCGCCTC-----------C 157
Query 263 AGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATG 336
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 158 AGGATTATTTTACAAATGCAAATAGAGAGTTGAAAAAAGATGCTCAGCAAGATTACCATCTAGAATATGCCATG 231
Query 337 GAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAAC 410
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 232 GAAAATAGCACACACACAATAATTGAATTTACCAGAGAGCTGCATACATGTGACATAAATGACAAGAGTATAAC 305
Query 411 GGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACT 484
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 306 GGATAGCACTGTGAGAGTGATCTGGGCCTACCACCATGAAGATGCAGGAGAAGCTGGTCCCAAGTACCATGACT 379
Query 485 CCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATAC 558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 380 CCAATAGGGGCACCAAGAGTTTGCGGTTATTGAATCCTGAGAAAACTAGTGTGCTATCTACAGCCTTACCATAC 453
Query 559 TTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCC 632
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 454 TTTGATCTGGTAAATCAGGACGTCCCCATCCCAAACAAAGATACAACATATTGGTGCCAAATGTTTAAGATTCC 527
Query 633 TGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACC 706
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 528 TGTGTTCCAAGAAAAGCATCATGTAATAAAGGTTGAGCCAGTGATACAGAGAGGCCATGAGAGTCTGGTGCACC 601
Query 707 ACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCC 780
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 602 ACATCCTGCTCTATCAGTGCAGCAACAACTTTAACGACAGCGTTCTGGAGTCCGGCCACGAGTGCTATCACCCC 675
Query 781 AACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTA 854
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 676 AACATGCCCGATGCATTCCTCACCTGTGAAACTGTGATTTTTGCCTGGGCTATTGGTGGAGAGGGCTTTTCTTA 749
Query 855 TCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATA 928
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 750 TCCACCTCATGTTGGATTATCCCTTGGCACTCCATTAGATCCGCATTATGTGCTCCTAGAAGTCCATTATGATA 823
Query 929 ATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATAT 1002
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 824 ATCCCACTTATGAGGAAGGCTTAATAGATAATTCTGGACTGAGGTTATTTTACACAATGGATATAAGGAAATAT 897
Query 1003 GATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCA 1076
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 898 GATGCTGGGGTGATTGAGGCTGGCCTCTGGGTGAGCCTCTTCCATACCATCCCTCCAGGGATGCCTGAGTTCCA 971
Query 1077 GTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGT 1150
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 972 GTCTGAGGGTCACTGCACTTTGGAGTGCCTGGAAGAGGCTCTGGAAGCCGAAAAGCCAAGTGGAATTCATGTGT 1045
Query 1151 TTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATG 1224
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1046 TTGCTGTTCTTCTCCATGCTCACCTGGCTGGCAGAGGCATCAGGCTGCGTCATTTTCGAAAAGGGAAGGAAATG 1119
Query 1225 AAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAAT 1298
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1120 AAATTACTTGCCTATGATGATGATTTTGACTTCAATTTCCAGGAGTTTCAGTATCTAAAGGAAGAACAAACAAT 1193
Query 1299 CTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGAC 1372
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1194 CTTACCAGGAGATAACCTAATTACTGAGTGTCGCTACAACACGAAAGATAGAGCTGAGATGACTTGGGGAGGAC 1267
Query 1373 TAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGT 1446
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1268 TAAGCACCAGGAGTGAAATGTGTCTCTCATACCTTCTTTATTACCCAAGAATTAATCTTACTCGATGTGCAAGT 1341
Query 1447 ATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTT 1520
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1342 ATTCCAGACATTATGGAACAACTTCAGTTCATTGGGGTTAAGGAGATCTACAGACCAGTCACGACCTGGCCTTT 1415
Query 1521 CATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAA 1594
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1416 CATTATCAAAAGTCCCAAGCAATATAAAAACCTTTCTTTCATGGATGCTATGAATAAGTTTAAATGGACTAAAA 1489
Query 1595 AGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCT 1668
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1490 AGGAAGGTCTCTCCTTCAACAAGCTGGTCCTCAGCCTGCCAGTGAATGTGAGATGTTCCAAGACAGACAATGCT 1563
Query 1669 GAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTG 1742
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1564 GAGTGGTCGATTCAAGGAATGACAGCATTACCTCCAGATATAGAAAGACCCTATAAAGCAGAACCTTTGGTGTG 1637
Query 1743 TGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCT 1816
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1638 TGGCACGTCTTCTTCCTCTTCCCTGCACAGAGATTTCTCCATCAACTTGCTTGTTTGCCTTCTGCTACTCAGCT 1711
Query 1817 GCACGCTGAGCACCAAGAGCTTGTGAAAGCT 1847
|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1712 GCACGCTGAGCACCAAGAGCTTG-------- 1734