Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491308
• Subject: NM_001359990.1
• Aligned Length: 1392
• Identities: 1305
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG  222

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
            ||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAAAGTATGGCTTCTCTTTGACTA  296

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCTGAGCATGACCTCTGGCATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  444

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  592

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  666
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  666

Query  667  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  740

Query  741  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  814

Query  815  AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT  888
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATTGCAGCCTTATCAAGTAT  888

Query  889  ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT  962
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||
Sbjct  889  ATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTGCTCACTATGGACCCAAT  962

Query  963  AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  963  AAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACTTCCCACGTCAGATGTTT  1036

Query 1037  TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA  1110
            |.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct 1037  TCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCCAAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCTGATGAGAAAGGAGACAAA  1110

Query 1111  AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA  1184
               |.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct 1111  ---ACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACCACACTAACGGAACTGGCCATCCGGGGAACCAGGACAGCGGCCA  1181

Query 1185  CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT  1258
            |.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1182  CGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTCATCATGACCT  1255

Query 1259  CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC  1332
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1256  CCGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCTTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCCCAGAGCAGC  1329

Query 1333  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1389