Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491308
• Subject: XM_006504838.4
• Aligned Length: 1392
• Identities: 1272
• Gaps: 39

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCATTACTCCGAGAGCTTAAG  222

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
            ||.|||||||||||.||.||||..||||||||||||||||||||||||.||||                     
Sbjct  223  CACCCAAACGTCATCTCCCTTCTGAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATCGGAA---------------------  275

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
                              .||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  276  ------------------ACATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  331

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  332  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  405

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  479

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  480  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  553

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  666
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  627

Query  667  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  701

Query  741  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  775

Query  815  AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT  888
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  776  AGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATTGCAGCCTTATCAAGTAT  849

Query  889  ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT  962
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||
Sbjct  850  ATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTGCTCACTATGGACCCAAT  923

Query  963  AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  924  AAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACTTCCCACGTCAGATGTTT  997

Query 1037  TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA  1110
            |.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  998  TCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCCAAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCTGATGAGAAAGGAGACAAA  1071

Query 1111  AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA  1184
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct 1072  AAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACCACACTAACGGAACTGGCCATCCGGGGAACCAGGACAGCGGCCA  1145

Query 1185  CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT  1258
            |.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1146  CGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTCATCATGACCT  1219

Query 1259  CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC  1332
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1220  CCGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCTTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCCCAGAGCAGC  1293

Query 1333  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1353