Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491308
• Subject: XM_006504839.4
• Aligned Length: 1392
• Identities: 1208
• Gaps: 111

Alignment

Query    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGACTATGACTTTAAAGTGAAGCTGAGCAGCGAGCGGGAGCGGGTCGAGGACCTGTTTGAATACGAGGGCTG  74

Query   75  CAAAGTTGGCCGAGGCACTTATGGTCACGTCTACAAAGCCAAGAGGAAAGATGGGAAGGATGATAAAGACTATG  148
            |||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CAAAGTTGGTCGAGGCACTTACGGGCACGTCTACAAGGCGAAGAGGAAAGATGGGAAGGACGATAAAGACTACG  148

Query  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGGATCTCTATGTCGGCATGTAGAGAAATAGCATTACTTCGAGAGCTTAAG  222
            |||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.||||||                  
Sbjct  149  CTTTAAAACAAATAGAAGGAACTGGAATTTCTATGTCGGCATGCAGAGAGATAGCA------------------  204

Query  223  CATCCAAACGTCATTTCTCTTCAAAAGGTGTTTCTGTCTCATGCTGATAGGAAGGTGTGGCTTCTGTTTGACTA  296
                                                                                      
Sbjct  205  --------------------------------------------------------------------------  204

Query  297  TGCTGAACATGACCTCTGGCATATAATCAAGTTTCACAGAGCTTCTAAAGCAAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  370
                               ||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  205  -------------------CATATAATTAAGTTTCACAGAGCTTCGAAAGCCAACAAGAAGCCAGTTCAGTTAC  259

Query  371  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTATTATATCAGATCCTAGATGGTATTCACTACCTGCATGCTAACTGGGTGTTG  444
            ||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  260  CTCGGGGAATGGTGAAGTCACTGTTGTACCAGATCCTAGATGGGATTCACTATCTTCATGCCAACTGGGTGTTG  333

Query  445  CACAGAGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  518
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  334  CACAGGGATTTGAAACCTGCTAATATTTTAGTTATGGGTGAAGGTCCTGAGCGAGGAAGAGTAAAAATTGCTGA  407

Query  519  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTTACATTCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  408  CATGGGCTTTGCCCGATTATTTAATTCACCTTTGAAGCCTTTAGCAGATTTGGATCCAGTGGTTGTAACATTCT  481

Query  593  GGTACCGAGCCCCTGAACTACTTCTTGGAGCAAGGCATTATACCAAAGCTATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  666
            ||||||||||.||.|||.||||.||.|||||..|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  482  GGTACCGAGCTCCAGAATTACTCCTCGGAGCGCGACATTATACCAAAGCAATTGATATTTGGGCTATAGGGTGT  555

Query  667  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  556  ATATTTGCAGAACTACTAACGTCAGAACCAATATTTCACTGTCGACAAGAGGACATCAAAACTAGTAATCCTTA  629

Query  741  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTTCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  630  TCACCATGACCAGCTGGACAGAATATTCAATGTAATGGGATTCCCTGCAGATAAAGATTGGGAAGATATAAAAA  703

Query  815  AGATGCCTGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAACTGCAGCCTTATCAAGTAT  888
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  704  AGATGCCCGAACATTCAACATTAATGAAAGATTTCAGAAGAAATACGTATACCAATTGCAGCCTTATCAAGTAT  777

Query  889  ATGGAAAAACATAAAGTTAAACCAGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGCTGCTTACCATGGACCCAAT  962
            ||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||
Sbjct  778  ATGGAAAAGCATAAAGTTAAACCCGATAGTAAAGCATTCCACTTGCTTCAGAAGTTGCTCACTATGGACCCAAT  851

Query  963  AAAGCGAATTACCTCAGAACAGGCTATGCAGGACCCCTATTTCTTAGAAGACCCACTTCCTACATCAGACGTTT  1036
            ||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||.||.|||||.||||
Sbjct  852  AAAGCGAATTACCTCAGAGCAGGCCATGCAGGACCCCTACTTCCTAGAAGACCCACTTCCCACGTCAGATGTTT  925

Query 1037  TTGCCGGTTGTCAAATCCCTTACCCAAAACGAGAATTTTTAACGGAAGAAGAACCTGATGACAAAGGAGACAAA  1110
            |.|||||||||||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||
Sbjct  926  TCGCCGGTTGTCAGATCCCATATCCCAAACGAGAATTTTTAACAGAAGAAGAGCCTGATGAGAAAGGAGACAAA  999

Query 1111  AAGAACCAGCAGCAGCAGCAGGGCAATAACCACACTAATGGAACTGGCCACCCAGGGAATCAAGACAGCAGTCA  1184
            ||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||.|.||
Sbjct 1000  AAGACCCAGCAGCAGCAGCAGGGCAACAACCACACTAACGGAACTGGCCATCCGGGGAACCAGGACAGCGGCCA  1073

Query 1185  CACACAGGGACCCCCGTTGAAGAAAGTGAGAGTTGTTCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTTATCATGACCT  1258
            |.|||||||.|||||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1074  CGCACAGGGGCCCCCCTTGAAAAAAGTGAGAGTTGTCCCTCCTACCACTACCTCAGGTGGACTCATCATGACCT  1147

Query 1259  CAGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCCTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCGCAGAGCAGC  1332
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1148  CCGACTATCAGCGTTCCAATCCACATGCTGCTTATCCCAACCCTGGACCAAGCACATCACAGCCCCAGAGCAGC  1221

Query 1333  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1392
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1222  ATGGGATACTCAGCTACCTCCCAGCAGCCTCCACAGTACTCACATCAGACACATCGGTAC  1281