Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000491309
Subject:
XM_024454074.1
Aligned Length:
1363
Identities:
1059
Gaps:
304

Alignment

Query    1  ATGCCCCTGTCCCGCTGGTTGAGATCTGTGGGGGTCTTCCTGCTGCCAGCCCCCTACTGGGCACCCCGGGAGAG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTGGCTGGGTTCCCTACGGCGGCCCTCCCTGGTGCACGGGTACCCAGTCCTGGCCTGGCACAGTGCCCGCTGCT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGTGCCAAGCGTGGACAGAGGAACCTCGAGCCCTTTGCTCCTCCCTCAGAATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  222
                                                              ||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------------------------ATGAACGGAGACCAGAATTCAGAT  24

Query  223  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   25  GTTTATGCCCAAGAAAAGCAGGATTTCGTTCAGCACTTCTCCCAGATCGTTAGGGTGCTGACTGAGGATGAGAT  98

Query  297  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   99  GGGGCACCCAGAGATAGGAGATGCTATTGCCCGGCTCAAGGAGGTCCTGGAGTACAATGCCATTGGAGGCAAGT  172

Query  371  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  173  ATAACCGGGGTTTGACGGTGGTAGTAGCATTCCGGGAGCTGGTGGAGCCAAGGAAACAGGATGCTGATAGTCTC  246

Query  445  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  CAGCGGGCCTGGACTGTGGGCTGGTGTGTGGAACTGCTGCAAGCTTTCTTCCTGGTGGCAGATGACATCATGGA  320

Query  519  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  321  TTCATCCCTTACCCGCCGGGGACAGATCTGCTGGTATCAGAAGCCGGGCGTGGGTTTGGATGCCATCAATGATG  394

Query  593  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  395  CTAACCTCCTGGAAGCATGTATCTACCGCCTGCTGAAGCTCTATTGCCGGGAGCAGCCCTATTACCTGAACCTG  468

Query  667  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  469  ATCGAGCTCTTCCTGCAGAGTTCCTATCAGACTGAGATTGGGCAGACCCTGGACCTCCTCACAGCCCCCCAGGG  542

Query  741  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  543  CAATGTGGATCTTGTCAGATTCACTGAAAAGAGGTACAAATCTATTGTCAAGTACAAGACAGCTTTCTACTCCT  616

Query  815  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  617  TCTACCTTCCTATAGCTGCAGCCATGTACATGGCAGGAATTGATGGCGAGAAGGAGCACGCCAATGCCAAGAAG  690

Query  889  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATT-----------------------------------------  921
            |||||||||||||||||||||||||||||||||                                         
Sbjct  691  ATCCTGCTGGAGATGGGGGAGTTCTTTCAGATTCAGGTAAGAAGGCAGGAGGCAGTAGCAGAGAACAGGCACCA  764

Query  922  ----------------------------------------------------------------CAGGATGATT  931
                                                                            ||||||||||
Sbjct  765  GCTTCACTCCTCCTCTGCCCAGGAACCTCATCCTTCCTCTTTTGCTGCCCTCCCCCTCCCTGCCCAGGATGATT  838

Query  932  ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  839  ACCTTGACCTCTTTGGGGACCCCAGTGTGACCGGCAAAATTGGCACTGACATCCAGGACAACAAATGCAGCTGG  912

Query 1006  CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA  1079
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  913  CTGGTGGTTCAGTGTCTGCAACGGGCCACTCCAGAACAGTACCAGATCCTGAAGGAAAATTACGGGCAGAAGGA  986

Query 1080  GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  987  GGCTGAGAAAGTGGCCCGGGTGAAGGCGCTATATGAGGAGCTGGATCTGCCAGCAGTGTTCTTGCAATATGAGG  1060

Query 1154  AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1061  AAGACAGTTACAGCCACATTATGGCTCTCATTGAACAGTACGCAGCACCCCTGCCCCCAGCCGTCTTTCTGGGG  1134

Query 1228  CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAGG  1258
            |||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1135  CTTGCGCGCAAAATCTACAAGCGGAGAAAG-  1164