Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491312
• Subject: NM_001346748.2
• Aligned Length: 1911
• Identities: 1487
• Gaps: 423

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGGCGCGGGCTGGTCGGGCGCCCCCGCGGCTCTGCTGCGCTCCGTGCGCCGCCTGCGCGAGGTGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGAGGTGTGCGGCCGCGACCCCGACGGCTTCCTGCGCGTGGAGCGCGTCGCGGCGCTCGGACTGCGCTTCGGCC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGGGCGAGGAGGTGGAAAAACTTGTGAAATATTTGGATCCCAACGACCTGGGGAGAATCAACTTCAAGGACTTT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TGCCGGGGGGTGTTCGCCATGAAAGGGTGCGAGGAGCTGCTGAAGGATGTGCTGTCGGTGGAGAGCGCGGGGAC  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  GCTGCCGTGCGCGCCAGAGATCCCAGACTGCGTGGAGCAGGGCAGCGAGGTCACAGGCCCCACCTTTGCTGATG  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  GCGAGCTCATCCCCAGGGAACCCGGCTTTTTTCCCGAGGACGAGGAGGAGGCTATGACGCTGGCGCCACCTGAG  444
                                                                 |||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------ATGACGCTGGCGCCACCTGAG  21

Query  445  GGCCCCCAGGAGTTGTACACAGACAGCCCCATGGAGAGCACTCAGAGCCTGGAGGGGTCTGTCGGGAGTCCTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   22  GGCCCCCAGGAGTTGTACACAGACAGCCCCATGGAGAGCACTCAGAGCCTGGAGGGGTCTGTCGGGAGTCCTGC  95

Query  519  CGAGAAGGACGGGGGACTTGGGGGCCTGTTTCTGCCAGAAGACAAGTCCCTGGTCCACACTCCATCCATGACGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   96  CGAGAAGGACGGGGGACTTGGGGGCCTGTTTCTGCCAGAAGACAAGTCCCTGGTCCACACTCCATCCATGACGA  169

Query  593  CCTCAGACCTTTCTACACACTCCACCACCTCGCTCATCAGCAATGAGGAGCAGTTTGAAGACTATGGGGAGGGT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  170  CCTCAGACCTTTCTACACACTCCACCACCTCGCTCATCAGCAATGAGGAGCAGTTTGAAGACTATGGGGAGGGT  243

Query  667  GACGATGTGGACTGTGCCCCCAGCAGCCCTTGCCCCGATGATGAGACCAGGACCAACGTCTACTCGGACCTGGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  244  GACGATGTGGACTGTGCCCCCAGCAGCCCTTGCCCCGATGATGAGACCAGGACCAACGTCTACTCGGACCTGGG  317

Query  741  GTCTTCGGTGTCTTCCAGTGCGGGGCAGACGCCTAGGAAAATGCGGCACGTGTACAACAGCGAATTGCTAGATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  GTCTTCGGTGTCTTCCAGTGCGGGGCAGACGCCTAGGAAAATGCGGCACGTGTACAACAGCGAATTGCTAGATG  391

Query  815  TTTACTGCTCTCAATGCTGCAAGAAAATCAACCTGCTCAATGACTTGGAAGCCCGACTGAAAAACCTGAAGGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  392  TTTACTGCTCTCAATGCTGCAAGAAAATCAACCTGCTCAATGACTTGGAAGCCCGACTGAAAAACCTGAAGGCC  465

Query  889  AACAGCCCCAACCGAAAGATCTCCAGCACGGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAGCAGCAACTTCAGCAGCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  AACAGCCCCAACCGAAAGATCTCCAGCACGGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAGCAGCAACTTCAGCAGCAG  539

Query  963  CAATGGCAGCACCGAAGACCTGTTCCGGGACAGCATTGACTCTTGCGACAATGACATCACAGAGAAGGTAAGCT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  540  CAATGGCAGCACCGAAGACCTGTTCCGGGACAGCATTGACTCTTGCGACAATGACATCACAGAGAAGGTAAGCT  613

Query 1037  TCCTGGAAAAGAAGGTGACAGAGCTGGAGAATGACAGCCTGACCAATGGGGACCTGAAGAGCAAGCTGAAGCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  614  TCCTGGAAAAGAAGGTGACAGAGCTGGAGAATGACAGCCTGACCAATGGGGACCTGAAGAGCAAGCTGAAGCAA  687

Query 1111  GAGAACACACAGCTGGTGCACAGGGTGCATGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACGGCCGAGCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  GAGAACACACAGCTGGTGCACAGGGTGCATGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACGGCCGAGCA  761

Query 1185  GGCTCTGGAGGAGGAGGCGCGGCGCCACCGCGAGGCCTACGGCAAGCTGGAGAGGGAGAAGGCTACCGAGGTGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  GGCTCTGGAGGAGGAGGCGCGGCGCCACCGCGAGGCCTACGGCAAGCTGGAGAGGGAGAAGGCTACCGAGGTGG  835

Query 1259  AGCTGCTCAATGCCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAAAATACAGAGCTTAGAACAACAGTGACTCGGCTCAAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  AGCTGCTCAATGCCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAAAATACAGAGCTTAGAACAACAGTGACTCGGCTCAAG  909

Query 1333  TCTCAAACAGAGAAACTGGATGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGTCTGGAGGACACCAGCCTGCGGCTCAA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  910  TCTCAAACAGAGAAACTGGATGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGTCTGGAGGACACCAGCCTGCGGCTCAA  983

Query 1407  AGATGAGATGGACCTGTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGACAGAACCGCCTTGAGTTCCAGAAGGAGCGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  984  AGATGAGATGGACCTGTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGACAGAACCGCCTTGAGTTCCAGAAGGAGCGGG  1057

Query 1481  AGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAAGGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGACTGCGAG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1058  AGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAAGGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGACTGCGAG  1131

Query 1555  CGGCCAGGCAGGGGCCGCAGTGCCTCCTCTGGCCTAGGCGAGTTCAATGCCAGGGCCCGCGAGGTGGAGCTCGA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1132  CGGCCAGGCAGGGGCCGCAGTGCCTCCTCTGGCCTAGGCGAGTTCAATGCCAGGGCCCGCGAGGTGGAGCTCGA  1205

Query 1629  GCACGAGGTCAAGCGGCTCAAGCAGGAGAATTATAAGCTGCGGGATCAGAACGACGACTTGAATGGGCAGATTT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206  GCACGAGGTCAAGCGGCTCAAGCAGGAGAATTATAAGCTGCGGGATCAGAACGACGACTTGAATGGGCAGATTT  1279

Query 1703  TGAGCCTCAGCCTCTACGAAGCAAAAAACCTCTTTGCTGCCCAGACTAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCAGAGATA  1776
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1280  TGAGCCTCAGCCTCTACGAAGCAAAAAACCTCTTTGCTGCCCAGACTAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCGGAGATA  1353

Query 1777  GACACCGCCTCGCGCGATGAGCTAATGGAAGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGGCTGAGGCAGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1354  GACACCGCCTCGCGCGATGAGCTAATGGAAGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGGCTGAGGCAGTA  1427

Query 1851  CATGGACAAGATTATCCTCGCCATCCTGGACCACAATCCCTCCATCCTCGAGATCAAACAC  1911
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1428  CATGGACAAGATTATCCTCGCCATCCTGGACCACAATCCCTCCATCCTCGAGATCAAACAC  1488