Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491312
• Subject: NM_175543.3
• Aligned Length: 1917
• Identities: 1681
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGGCGCGGGCTGGTCGGGCGCCCCCGCGGCTCTGCTGCGCTCCGTGCGCCGCCTGCGCGAGGTGTT  74
            ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGGTGGCGCGGGCTGGGCGGGCGCCCCCGCGGCTCTGCTGCGCTCCGTGCGCCGCCTGCGCGAAGTGTT  74

Query   75  CGAGGTGTGCGGCCGCGACCCCGACGGCTTCCTGCGCGTGGAGCGCGTCGCGGCGCTCGGACTGCGCTTCGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CGAGGTGTGCGGCCGCGACCCCGACGGCTTTCTACGCGTGGAGCGCGTCGCGGCGCTCGGCCTGCGCTTCGGGC  148

Query  149  AGGGCGAGGAGGTGGAAAAACTTGTGAAATATTTGGATCCCAACGACCTGGGGAGAATCAACTTCAAGGACTTT  222
            |.||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AAGGAGAGGAGGTGGAAAAACTTGTGAAGTGTTTGGATCCCAATGACCTGGGGAGAATCAACTTCAAGGATTTT  222

Query  223  TGCCGGGGGGTGTTCGCCATGAAAGGGTGCGAGGAGCTGCTGAAGGATGTGCTGTCGGTGGAGAGCGCGGGGAC  296
            |||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  TGCCGCGGAGTATTCGCCATGAAAGGGTGTGAGGAGCTGCTGAAGGACGTGCTGTCGGTGGAGAGCGCAGGGAC  296

Query  297  GCTGCCGTGCGCGCCAGAGATCCCAGACTGCGTGGAGCAGGGCAGCGAGGTCACAGGCCCCACCTTTGCTGATG  370
            .|||||.||..|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||.|.||      ||.|.||||||
Sbjct  297  CCTGCCATGTTCTCCAGACATCCCAGACTGTGTGGAGCAGGGCAGCGACTTCTCTGG------CTCTACTGATG  364

Query  371  GCGAGCTCATCCCCAGGGAACCCGGCTTTTTTCCCGAGGACGAGGAGGAGGCTATGACGCTGGCGCCACCTGAG  444
            ||||||...|||||||||||||||.|||.||.|..||.|||||.|||||.||.|||||..||||.|.|||||||
Sbjct  365  GCGAGCAACTCCCCAGGGAACCCGACTTCTTCCAGGAAGACGAAGAGGAAGCGATGACATTGGCCCTACCTGAG  438

Query  445  GGCCCCCAGGAGTTGTACACAGACAGCCCCATGGAGAGCACTCAGAGCCTGGAGGGGTCTGTCGGGAGTCCTGC  518
            ||.|||||||||||..|||..|||||.|||||||||||||..||..|||.||||||.||||||..|.||..||.
Sbjct  439  GGACCCCAGGAGTTAGACATGGACAGTCCCATGGAGAGCAGCCAAGGCCCGGAGGGCTCTGTCAAGGGTTGTGG  512

Query  519  C---GAGAAGGA--CGGGGGACTTGGGGGCCTGTTTCTGCCAGAAGACAAGTCCCTGGTCCACACTCCATCCAT  587
            |   ||||||||  |.|.|  ||.|||||||||||.||||||||.|||||||.|||.||||.|||||||||..|
Sbjct  513  CGAGGAGAAGGAGCCTGAG--CTGGGGGGCCTGTTCCTGCCAGAGGACAAGTGCCTCGTCCTCACTCCATCTGT  584

Query  588  GACGACCTCAGACCTTTCTACACACTCCACCACCTCGCTCATCAGCAATGAGGAGCAGTTTGAAGACTATGGGG  661
            |||.||.|||||||||||.||.|||||||||.||||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  585  GACCACATCAGACCTTTCCACTCACTCCACCGCCTCTCTTATCAGCAACGAGGAGCAATTTGAAGACTATGGCG  658

Query  662  AGGGTGACGATGTGGACTGTGCCCCCAGCAGCCCTTGCCCCGATGATGAGACCAGGACCAACGTCTACTCGGAC  735
            ||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  659  AGGGGGATGACGTGGACTGTGCTCCCAGCAGCCCATGCCCCGACGATGAGACCAGAACCAATGTCTACTCAGAT  732

Query  736  CTGGGGTCTTCGGTGTCTTCCAGTGCGGGGCAGACGCCTAGGAAAATGCGGCACGTGTACAACAGCGAATTGCT  809
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|..|||||||||||..||||
Sbjct  733  CTGGGATCTTCAGTGTCTTCCAGTGCGGGACAGACCCCAAGGAAGATGCGACATGCCTACAACAGCGAGCTGCT  806

Query  810  AGATGTTTACTGCTCTCAATGCTGCAAGAAAATCAACCTGCTCAATGACTTGGAAGCCCGACTGAAAAACCTGA  883
            .||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  807  GGACGTGTACTGCTCTCAGTGCTGCAAGAAGATCAACCTGCTGAATGACCTGGAGGCCCGGCTGAAGAACCTGA  880

Query  884  AGGCCAACAGCCCCAACCGAAAGATCTCCAGCACGGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAGCAGCAACTTCAGC  957
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  881  AGGCCAACAGCCCCAACCGGAAGATCTCAAGCACAGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAACAGTAACTTCAGC  954

Query  958  AGCAGCAATGGCAGCACCGAAGACCTGTTCCGGGACAGCATTGACTCTTGCGACAATGACATCACAGAGAAGGT  1031
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  AGCAGTAATGGCAGCACCGAGGACCTGTTCCGTGACAGCATCGACTCCTGTGACAATGACATCACAGAGAAGGT  1028

Query 1032  AAGCTTCCTGGAAAAGAAGGTGACAGAGCTGGAGAATGACAGCCTGACCAATGGGGACCTGAAGAGCAAGCTGA  1105
            .||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1029  GAGCTTCCTGGAAAAAAAGGTAACAGAACTGGAGAACGACAGCCTGACGAGCGGGGGCCTGAAGAGCAAGCTGA  1102

Query 1106  AGCAAGAGAACACACAGCTGGTGCACAGGGTGCATGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACGGCC  1179
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1103  AGCAAGAGAACATGCAGCTGGTGCACAGGGTGCACGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACAGCG  1176

Query 1180  GAGCAGGCTCTGGAGGAGGAGGCGCGGCGCCACCGCGAGGCCTACGGCAAGCTGGAGAGGGAGAAG-GCTACCG  1252
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||.||||.|||||||||||.||||.||| || ||.|
Sbjct 1177  GAGCAGGCGCTGGAGGAGGAGGCCCGGCGACACCGTGAGGTCTACTGCAAGCTGGAGCGGGAAAAGAGC-ACAG  1249

Query 1253  AGGTGGAGCTGCTCAATGCCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAAAATACAGAGCTTAGAACAACAGTGACTCGG  1326
            ||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||.||||.
Sbjct 1250  AGCTGGAGCTGCTCAACACCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAGAACACAGATCTGAGAACGACAGTGGCTCGA  1323

Query 1327  CTCAAGTCTCAAACAGAGAAACTGGATGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGTCTGGAGGACACCAGCCTGCG  1400
            ||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1324  CTCAAGTCACAGACCGAGAAGCTGGACGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGGCTGGAGGACACCAGCCTGCG  1397

Query 1401  GCTCAAAGATGAGATGGACCTGTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGACAGAACCGCCTTGAGTTCCAGAAGG  1474
            .||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1398  ACTGAAGGACGAGATGGACCTTTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGGCAGAACCGCCTGGAGTTCCAGAAGG  1471

Query 1475  AGCGGGAGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAAGGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGAC  1548
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1472  AGCGGGAGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAGAGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGAC  1545

Query 1549  TGCGAGCGGCCAGGCAGGGGCCGCAGTGCCTCCTCTGGCCTAGGCGAGTTCAATGCCAGGGCCCGCGAGGTGGA  1622
            ||||||||||||||.|||||||||||   ||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1546  TGCGAGCGGCCAGGTAGGGGCCGCAG---CTCCTCTGGCCTTGGCGAGTTCAACGCCAGAGCCCGGGAGGTGGA  1616

Query 1623  GCTCGAGCACGAGGTCAAGCGGCTCAAGCAGGAGAATTATAAGCTGCGGGATCAGAACGACGACTTGAATGGGC  1696
            .||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1617  ACTTGAACATGAGGTCAAGCGTCTGAAGCAGGAGAATCACAAGCTGCGGGATCAGAATGATGATTTAAATGGGC  1690

Query 1697  AGATTTTGAGCCTCAGCCTCTACGAAGCAAAAAACCTCTTTGCTGCCCAGACTAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCA  1770
            ||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1691  AGATCCTGAGCCTCAGCCTCTACGAGGCGAAGAACCTCTTTGCAACCCAGACCAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCA  1764

Query 1771  GAGATAGACACCGCCTCGCGCGATGAGCTAATGGAAGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGGCTGAG  1844
            ||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1765  GAAATCGACACAGCATCTCGAGATGAGCTAATGGAGGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGACTGAG  1838

Query 1845  GCAGTACATGGACAAGATTATCCTCGCCATCCTGGACCACAATCCCTCCATCCTCGAGATCAAACAC  1911
            .|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||
Sbjct 1839  ACAGTACATGGACAAGATTATCCTGGCTATACTGGACCACAACCCCTCCATCTTGGAGATTAAACAC  1905