Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491312
• Subject: XM_006533403.1
• Aligned Length: 1917
• Identities: 1624
• Gaps: 87

Alignment

Query    1  ATGGCGGGCGGCGCGGGCTGGTCGGGCGCCCCCGCGGCTCTGCTGCGCTCCGTGCGCCGCCTGCGCGAGGTGTT  74
            ||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGCGGGTGGCGCGGGCTGGGCGGGCGCCCCCGCGGCTCTGCTGCGCTCCGTGCGCCGCCTGCGCGAAGTGTT  74

Query   75  CGAGGTGTGCGGCCGCGACCCCGACGGCTTCCTGCGCGTGGAGCGCGTCGCGGCGCTCGGACTGCGCTTCGGCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct   75  CGAGGTGTGCGGCCGCGACCCCGACGGCTTTCTACGCGTGGAGCGCGTCGCGGCGCTCGGCCTGCGCTTCGGGC  148

Query  149  AGGGCGAGGAGGTGGAAAAACTTGTGAAATATTTGGATCCCAACGACCTGGGGAGAATCAACTTCAAGGACTTT  222
            |.||.|||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  AAGGAGAGGAGGTGGAAAAACTTGTGAAGTGTTTGGATCCCAATGACCTGGGGAGAATCAACTTCAAGGATTTT  222

Query  223  TGCCGGGGGGTGTTCGCCATGAAAGGGTGCGAGGAGCTGCTGAAGGATGTGCTGTCGGTGGAGAGCGCGGGGAC  296
            |||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  223  TGCCGCGGAGTATTCGCCATGAAAGGGTGTGAGGAGCTGCTGAAGGACGTGCTGTCGGTGGAGAGCGCAGGGAC  296

Query  297  GCTGCCGTGCGCGCCAGAGATCCCAGACTGCGTGGAGCAGGGCAGCGAGGTCACAGGCCCCACCTTTGCTGATG  370
            .|||||.||..|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||..||.|.||      ||.|.||||||
Sbjct  297  CCTGCCATGTTCTCCAGACATCCCAGACTGTGTGGAGCAGGGCAGCGACTTCTCTGG------CTCTACTGATG  364

Query  371  GCGAGCTCATCCCCAGGGAACCCGGCTTTTTTCCCGAGGACGAGGAGGAGGCTATGACGCTGGCGCCACCTGAG  444
            ||||||...|||||||||||||||.|||.||.|..||.|||||.|||||.||.|||||..||||.|.|||||||
Sbjct  365  GCGAGCAACTCCCCAGGGAACCCGACTTCTTCCAGGAAGACGAAGAGGAAGCGATGACATTGGCCCTACCTGAG  438

Query  445  GGCCCCCAGGAGTTGTACACAGACAGCCCCATGGAGAGCACTCAGAGCCTGGAGGGGTCTGTCGGGAGTCCTGC  518
            ||.|||||||||||..|||..|||||.|||||||||||||..||..|||.||||||.||||||..|.||..||.
Sbjct  439  GGACCCCAGGAGTTAGACATGGACAGTCCCATGGAGAGCAGCCAAGGCCCGGAGGGCTCTGTCAAGGGTTGTGG  512

Query  519  C---GAGAAGGA--CGGGGGACTTGGGGGCCTGTTTCTGCCAGAAGACAAGTCCCTGGTCCACACTCCATCCAT  587
            |   ||||||||  |.|.|  ||.|||||||||||.||||||||.|||||                        
Sbjct  513  CGAGGAGAAGGAGCCTGAG--CTGGGGGGCCTGTTCCTGCCAGAGGACAA------------------------  560

Query  588  GACGACCTCAGACCTTTCTACACACTCCACCACCTCGCTCATCAGCAATGAGGAGCAGTTTGAAGACTATGGGG  661
                                                         |||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  561  ---------------------------------------------CAACGAGGAGCAATTTGAAGACTATGGCG  589

Query  662  AGGGTGACGATGTGGACTGTGCCCCCAGCAGCCCTTGCCCCGATGATGAGACCAGGACCAACGTCTACTCGGAC  735
            ||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.
Sbjct  590  AGGGGGATGACGTGGACTGTGCTCCCAGCAGCCCATGCCCCGACGATGAGACCAGAACCAATGTCTACTCAGAT  663

Query  736  CTGGGGTCTTCGGTGTCTTCCAGTGCGGGGCAGACGCCTAGGAAAATGCGGCACGTGTACAACAGCGAATTGCT  809
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.||.|..|||||||||||..||||
Sbjct  664  CTGGGATCTTCAGTGTCTTCCAGTGCGGGACAGACCCCAAGGAAGATGCGACATGCCTACAACAGCGAGCTGCT  737

Query  810  AGATGTTTACTGCTCTCAATGCTGCAAGAAAATCAACCTGCTCAATGACTTGGAAGCCCGACTGAAAAACCTGA  883
            .||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct  738  GGACGTGTACTGCTCTCAGTGCTGCAAGAAGATCAACCTGCTGAATGACCTGGAGGCCCGGCTGAAGAACCTGA  811

Query  884  AGGCCAACAGCCCCAACCGAAAGATCTCCAGCACGGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAGCAGCAACTTCAGC  957
            |||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||
Sbjct  812  AGGCCAACAGCCCCAACCGGAAGATCTCAAGCACAGCCTTTGGACGGCAGCTCATGCACAACAGTAACTTCAGC  885

Query  958  AGCAGCAATGGCAGCACCGAAGACCTGTTCCGGGACAGCATTGACTCTTGCGACAATGACATCACAGAGAAGGT  1031
            |||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  AGCAGTAATGGCAGCACCGAGGACCTGTTCCGTGACAGCATCGACTCCTGTGACAATGACATCACAGAGAAGGT  959

Query 1032  AAGCTTCCTGGAAAAGAAGGTGACAGAGCTGGAGAATGACAGCCTGACCAATGGGGACCTGAAGAGCAAGCTGA  1105
            .||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.|..||||.|||||||||||||||||
Sbjct  960  GAGCTTCCTGGAAAAAAAGGTAACAGAACTGGAGAACGACAGCCTGACGAGCGGGGGCCTGAAGAGCAAGCTGA  1033

Query 1106  AGCAAGAGAACACACAGCTGGTGCACAGGGTGCATGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACGGCC  1179
            ||||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1034  AGCAAGAGAACATGCAGCTGGTGCACAGGGTGCACGAGCTGGAGGAGATGGTGAAGGATCAGGAGACCACAGCG  1107

Query 1180  GAGCAGGCTCTGGAGGAGGAGGCGCGGCGCCACCGCGAGGCCTACGGCAAGCTGGAGAGGGAGAAG-GCTACCG  1252
            ||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||||.||||.|||||||||||.||||.||| || ||.|
Sbjct 1108  GAGCAGGCGCTGGAGGAGGAGGCCCGGCGACACCGTGAGGTCTACTGCAAGCTGGAGCGGGAAAAGAGC-ACAG  1180

Query 1253  AGGTGGAGCTGCTCAATGCCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAAAATACAGAGCTTAGAACAACAGTGACTCGG  1326
            ||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||||||.||||.
Sbjct 1181  AGCTGGAGCTGCTCAACACCAGGGTGCAGCAGTTGGAGGAAGAGAACACAGATCTGAGAACGACAGTGGCTCGA  1254

Query 1327  CTCAAGTCTCAAACAGAGAAACTGGATGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGTCTGGAGGACACCAGCCTGCG  1400
            ||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  CTCAAGTCACAGACCGAGAAGCTGGACGAGGAGCGGCAGCGCATGTCTGACCGGCTGGAGGACACCAGCCTGCG  1328

Query 1401  GCTCAAAGATGAGATGGACCTGTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGACAGAACCGCCTTGAGTTCCAGAAGG  1474
            .||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1329  ACTGAAGGACGAGATGGACCTTTACAAGCGCATGATGGACAAGCTGCGGCAGAACCGCCTGGAGTTCCAGAAGG  1402

Query 1475  AGCGGGAGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAAGGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGAC  1548
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  AGCGGGAGGCGACGCAGGAGCTCATCGAGGACTTGCGGAGAGAGCTGGAGCACCTGCAGATGTACAAGCTGGAC  1476

Query 1549  TGCGAGCGGCCAGGCAGGGGCCGCAGTGCCTCCTCTGGCCTAGGCGAGTTCAATGCCAGGGCCCGCGAGGTGGA  1622
            ||||||||||||||.|||||||||||   ||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct 1477  TGCGAGCGGCCAGGTAGGGGCCGCAG---CTCCTCTGGCCTTGGCGAGTTCAACGCCAGAGCCCGGGAGGTGGA  1547

Query 1623  GCTCGAGCACGAGGTCAAGCGGCTCAAGCAGGAGAATTATAAGCTGCGGGATCAGAACGACGACTTGAATGGGC  1696
            .||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1548  ACTTGAACATGAGGTCAAGCGTCTGAAGCAGGAGAATCACAAGCTGCGGGATCAGAATGATGATTTAAATGGGC  1621

Query 1697  AGATTTTGAGCCTCAGCCTCTACGAAGCAAAAAACCTCTTTGCTGCCCAGACTAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCA  1770
            ||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1622  AGATCCTGAGCCTCAGCCTCTACGAGGCGAAGAACCTCTTTGCAACCCAGACCAAAGCCCAGTCTCTGGCTGCA  1695

Query 1771  GAGATAGACACCGCCTCGCGCGATGAGCTAATGGAAGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGGCTGAG  1844
            ||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1696  GAAATCGACACAGCATCTCGAGATGAGCTAATGGAGGCCCTGAAGGAGCAGGAGGAGATCAACTTCCGACTGAG  1769

Query 1845  GCAGTACATGGACAAGATTATCCTCGCCATCCTGGACCACAATCCCTCCATCCTCGAGATCAAACAC  1911
            .|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||
Sbjct 1770  ACAGTACATGGACAAGATTATCCTGGCTATACTGGACCACAACCCCTCCATCTTGGAGATTAAACAC  1836