Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491325
• Subject: XM_011535042.2
• Aligned Length: 3273
• Identities: 2798
• Gaps: 462

Alignment

Query    1  ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GTTAAAGCAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA  148
                |.|||||                      ||||                            |||||||| 
Sbjct    1  ----ATGCAGC----------------------GCTA----------------------------TGGATGCC-  19

Query  149  AAGTCCTGGGGAGC---------AAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGA  213
                    ||||||         ||||                           |||.|.||            
Sbjct   20  --------GGGAGCGATCTTTGGAAAG---------------------------GAGTCCCC------------  46

Query  214  CCTTATCAGAAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGC  287
                        |.||.|||.||.|          ||                        ||.||.|||..||
Sbjct   47  ------------GGCTCGAGCGACA----------CT------------------------GCCCCCCTGGGGC  74

Query  288  TGCAGAAGTGAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTC  361
            |                     |||                           ||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  T---------------------CTG---------------------------CAGGAGATGGCTGGCCGAGCTC  100

Query  362  TCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGG  435
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  101  TCAAGCAGACTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGG  174

Query  436  AATGAGCAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAG  509
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  175  AATGAGCAGATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAG  248

Query  510  GCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAA  583
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  GCCCAGCTTCGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAA  322

Query  584  GCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTC  657
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  GCTTCGGCGCTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTC  396

Query  658  GGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGC  731
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  GGCCCCCACGGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGC  470

Query  732  ACACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAG  805
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  ACACTTCCCGCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAG  544

Query  806  TGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGC  879
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  545  TGCAGCGCAGCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGC  618

Query  880  CAGGGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCA  953
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  619  CAGGGAGGACCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCA  692

Query  954  CAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCC  1027
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  CAAGCAGGCCGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCC  766

Query 1028  CCCCGCAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGAGCAGCACCTCCGTC  1101
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  767  CCCCGCAGAGCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGGGCAGCACCTCCGTC  840

Query 1102  CAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGC  1175
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  841  CAGCAGTGGCCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGC  914

Query 1176  GCACGTGGCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCG  1249
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  GCACGTGGCCTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCG  988

Query 1250  GTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTG  1323
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  989  GTCCGCCTGGCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTG  1062

Query 1324  CACCCGGTGAAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGT  1397
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1063  CACCCGGTGAAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGT  1136

Query 1398  GCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATG  1471
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1137  GCCCGCGCCTGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATG  1210

Query 1472  CCCTGGCGCTGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCT  1545
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1211  CCCTGGCGCTGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCT  1284

Query 1546  CCACCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCAT  1619
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1285  CCGCCCTACCCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCAT  1358

Query 1620  GGAGCAGAGCCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACA  1693
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1359  GGAGCAGAGCCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACA  1432

Query 1694  AAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAG  1767
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1433  AAGGCGGAAAGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAG  1506

Query 1768  AGAGAGTCACGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCAT  1841
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1507  AGAGAGTCACGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCAT  1580

Query 1842  CAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAG  1915
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1581  CAAAACCTACCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAG  1654

Query 1916  CTGAGCAGGAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATG  1989
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1655  CTGAGCAGGAGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATG  1728

Query 1990  GACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGT  2063
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1729  GACAAGTCTATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGT  1802

Query 2064  GGACACTCACGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACG  2137
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1803  GGACACTCACGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACG  1876

Query 2138  TCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGAC  2211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1877  TCAAGGCCGAGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGAC  1950

Query 2212  AAAGACAGCCTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGT  2285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1951  AAAGACAGCCTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGT  2024

Query 2286  CTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCT  2359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2025  CTTCCCTGAGCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCT  2098

Query 2360  TCATCCACCGAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGC  2433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2099  TCATCCACCGAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGC  2172

Query 2434  CTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAG-----------------------------  2478
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                             
Sbjct 2173  CTCTGCACTGGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGGAGCCATGTCAGACAGGACAGCAT  2246

Query 2479  --------------------------------------------------------------------------  2478
                                                                                      
Sbjct 2247  GGAGCCCAGCGACCTCTGGGATGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAAGACCCTAGAGCAGAGGG  2320

Query 2479  --------------------------------------------------------------------------  2478
                                                                                      
Sbjct 2321  CGCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCCTGGCACATTCACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGTGCTC  2394

Query 2479  ------AAAGGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCA  2546
                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2395  CTCCGCAAAGGGTACACTCAACTCTGTGACTGGTGGAGTGTTGGAGTGATTCTCTTCGAGATGCTGGTGGGGCA  2468

Query 2547  GCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTC  2620
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2469  GCCGCCCTTTTTGGCACCTACTCCCACAGAAACCCAGCTGAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTC  2542

Query 2621  CAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTG  2694
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2543  CAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCCAGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTG  2616

Query 2695  GGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAA  2768
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2617  GGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGCCCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAA  2690

Query 2769  GCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAA  2842
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2691  GCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCAGCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAA  2764

Query 2843  GCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCT  2916
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2765  GCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGCACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCT  2838

Query 2917  GAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCC  2990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2839  GAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCGAAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCC  2912

Query 2991  TTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCT  3064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2913  TTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGAGCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCT  2986

Query 3065  GCCAGCCTGTGTACGTG  3081
            |||||||||||||||||
Sbjct 2987  GCCAGCCTGTGTACGTG  3003