Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491325
- Subject:
- XM_017020542.1
- Aligned Length:
- 3170
- Identities:
- 2608
- Gaps:
- 541
Alignment
Query 1 ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG 74
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Sbjct 1 ATGAGGCCAAAGACTTTTCCTGCCACGACTTATTCTGGAAATAGCCGGCAGCGACTGCAAGAGATTCGTGAGGG 74
Query 75 GTTAAAGCAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA 148
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Sbjct 75 GTTAAAACAGCCATCCAAGTCTTCGGTTCAGGGGCTACCCGCAGGACCAAACAGTGACACTTCCCTGGATGCCA 148
Query 149 AAGTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGACCTTATCAG 222
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Sbjct 149 AAGTCCTGGGGAGCAAAGATGCCACCAGGCAGCAGCAGCAGATGAGAGCCACCCCAAAGTTCGGACCTTATCAG 222
Query 223 AAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGT 296
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Sbjct 223 AAAGCCTTGAGGGAAATCAGATATTCCTTGTTGCCTTTTGCTAATGAATCGGGCACCTCTGCAGCTGCAGAAGT 296
Query 297 GAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA 370
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Sbjct 297 GAACCGGCAAATGCTGCAGGAACTGGTGAACGCAGGATGCGACCAGGAGATGGCTGGCCGAGCTCTCAAGCAGA 370
Query 371 CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG 444
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Sbjct 371 CTGGCAGCAGGAGCATCGAGGCCGCCCTGGAGTACATCAGCAAGATGGGCTACCTGGACCCGAGGAATGAGCAG 444
Query 445 ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT 518
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Sbjct 445 ATTGTGCGGGTCATTAAGCAGACCTCCCCAGGAAAGGGGCTCATGCCAACCCCAGTGACGCGGAGGCCCAGCTT 518
Query 519 CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG 592
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Sbjct 519 CGAAGGAACCGGCGATTCGTTTGCGTCCTACCACCAGCTGAGCGGTACCCCCTACGAGGGCCCAAGCTTCGGCG 592
Query 593 CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC 666
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Sbjct 593 CTGACGGCCCCACGGCGCTGGAGGAGATGCCGCGGCCGTACGTGGACTACCTTTTCCCCGGAGTCGGCCCCCAC 666
Query 667 GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC 740
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Sbjct 667 GGGCCCGGCCACCAGCACCAGCACCCACCCAAGGGCTACGGTGCCAGCGTAGAGGCAGCAGGGGCACACTTCCC 740
Query 741 GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA 814
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Sbjct 741 GCTGCAGGGCGCGCACTACGGGCGGCCGCACCTGCTGGTGCCTGGGGAACCCCTGGGCTACGGAGTGCAGCGCA 814
Query 815 GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA 888
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Sbjct 815 GCCCCTCCTTCCAGAGCAAGACGCCGCCGGAGACCGGGGGTTACGCCAGCCTGCCCACGAAGGGCCAGGGAGGA 888
Query 889 CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC 962
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Sbjct 889 CCGCCAGGCGCCGGCCTCGCTTTCCCACCCCCTGCCGCCGGGCTCTACGTGCCGCACCCACACCACAAGCAGGC 962
Query 963 CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA 1036
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Sbjct 963 CGGTCCCGCGGCCCACCAGCTGCATGTGCTGGGCTCCCGCAGCCAGGTGTTCGCCAGCGACAGCCCCCCGCAGA 1036
Query 1037 GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGAGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG 1110
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Sbjct 1037 GCCTGCTCACTCCCTCGCGGAACAGCCTCAACGTGGACCTGTATGAATTGGGCAGCACCTCCGTCCAGCAGTGG 1110
Query 1111 CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC 1184
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Sbjct 1111 CCGGCTGCCACCCTGGCCCGCCGGGACTCCCTGCAGAAGCCGGGCCTGGAGGCGCCGCCGCGCGCGCACGTGGC 1184
Query 1185 CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG 1258
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Sbjct 1185 CTTCCGGCCTGACTGCCCAGTGCCCAGCAGGACCAACTCCTTCAACAGCCACCAGCCGCGGCCCGGTCCGCCTG 1258
Query 1259 GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG 1332
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Sbjct 1259 GCAAGGCCGAGCCCTCCCTGCCCGCCCCCAACACCGTGACGGCTGTCACGGCCGCGCACATCTTGCACCCGGTG 1332
Query 1333 AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC 1406
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Sbjct 1333 AAGAGCGTGCGTGTGCTGAGGCCGGAGCCGCAGACGGCTGTGGGGCCCTCGCACCCCGCCTGGGTGCCCGCGCC 1406
Query 1407 TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC 1480
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Sbjct 1407 TGCCCCGGCCCCCGCCCCCGCCCCCGCCCCGGCTGCGGAGGGCTTGGACGCCAAGGAGGAGCATGCCCTGGCGC 1480
Query 1481 TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCACCCTAC 1554
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Sbjct 1481 TGGGCGGCGCAGGCGCCTTCCCGCTGGACGTGGAGTACGGAGGCCCAGACCGGAGGTGCCCGCCTCCGCCCTAC 1554
Query 1555 CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG 1628
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Sbjct 1555 CCGAAGCACCTGCTGCTGCGCAGCAAGTCGGAGCAGTACGACCTGGACAGCCTGTGCGCAGGCATGGAGCAGAG 1628
Query 1629 CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA 1702
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Sbjct 1629 CCTCCGTGCGGGCCCCAACGAGCCCGAGGGCGGCGACAAGAGCCGCAAAAGCGCCAAGGGGGACAAAGGCGGAA 1702
Query 1703 AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA 1776
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Sbjct 1703 AGGATAAAAAGCAGATTCAGACCTCTCCCGTTCCCGTCCGCAAAAACAGCAGAGACGAAGAGAAGAGAGAGTCA 1776
Query 1777 CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA 1850
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Sbjct 1777 CGCATCAAGAGCTACTCGCCATACGCCTTTAAGTTCTTCATGGAGCAGCACGTGGAGAATGTCATCAAAACCTA 1850
Query 1851 CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG 1924
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Sbjct 1851 CCAGCAGAAGGTTAACCGGAGGCTGCAGCTGGAGCAAGAAATGGCCAAAGCTGGACTCTGTGAAGCTGAGCAGG 1924
Query 1925 AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT 1998
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Sbjct 1925 AGCAGATGCGGAAGATCCTCTACCAGAAAGAGTCTAATTACAACAGGTTAAAGAGGGCCAAGATGGACAAGTCT 1998
Query 1999 ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA 2072
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Sbjct 1999 ATGTTTGTCAAGATCAAAACCCTGGGGATCGGTGCCTTTGGAGAAGTGTGCCTTGCTTGTAAGGTGGACACTCA 2072
Query 2073 CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG 2146
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Sbjct 2073 CGCCCTGTACGCCATGAAGACCCTAAGGAAAAAGGATGTCCTGAACCGGAATCAGGTGGCCCACGTCAAGGCCG 2146
Query 2147 AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC 2220
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Sbjct 2147 AGAGGGACATCCTGGCCGAGGCAGACAATGAGTGGGTGGTCAAACTCTACTACTCCTTCCAAGACAAAGACAGC 2220
Query 2221 CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA 2294
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Sbjct 2221 CTGTACTTTGTGATGGACTACATCCCTGGTGGGGACATGATGAGCCTGCTGATCCGGATGGAGGTCTTCCCTGA 2294
Query 2295 GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC 2368
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Sbjct 2295 GCACCTGGCCCGGTTCTACATCGCAGAGCTGACTTTGGCCATTGAGAGTGTCCACAAGATGGGCTTCATCCACC 2368
Query 2369 GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT 2442
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Sbjct 2369 GAGACATCAAGCCTGATAACATTTTGATAGATCTGGATGGTCACATTAAACTCACAGATTTCGGCCTCTGCACT 2442
Query 2443 GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGGTACACTCAACTCTGT--GACTGG------TGG 2508
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Sbjct 2443 GGGTTCAGGTGGACTCACAATTCCAAATATTACCAGAAAGGG-------AGCCATGTCAGACAGGACAGCATGG 2509
Query 2509 AG----------TGTTGGAGTGAT-TCTCT-----TC--------GAGATGCTG--------------GTGGG- 2543
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Sbjct 2510 AGCCCAGCGACCTCTGGGA-TGATGTGTCTAACTGTCGGTGTGGGGACAGGCTGAAGACCCTAGAGCAGAGGGC 2582
Query 2544 ------GCAGC--------CGCCCTTTTTGGCACCT------------ACTCC------CACAGAAACCCAGCT 2585
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Sbjct 2583 GCGGAAGCAGCACCAGAGGTGCC-----TGGCACATTCACTGGTGGGGACTCCAAACTACATCGCACCCGAGGT 2651
Query 2586 G----------AAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCCTGAGGCC 2649
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Sbjct 2652 GCTCCTCCGCAAAGGTGATCAACTGGGAGAACACGCTCCACATTCCAGCCCAGGTGAAGCTGAGCCC------- 2718
Query 2650 AGGGACCTCATCACCAAGCTGTGCTGCTCCGCAGACCACCGCCTGGGGCGGAATGGGGCCGATGACCTGAAGGC 2723
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2724 CCACCCCTTCTTCAGCGCCATTGACTTCTCCAGTGACATCCGGAAGCAGCCAGCCCCCTACGTTCCCACCATCA 2797
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2798 GCCACCCCATGGACACCTCGAATTTCGACCCCGTAGATGAAGAAAGCCCTTGGAACGATGCCAGCGAAGGTAGC 2871
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2872 ACCAAGGCCTGGGACACACTCACCTCGCCCAATAACAAGCATCCTGAGCACGCATTTTACGAATTCACCTTCCG 2945
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 2946 AAGGTTCTTTGATGACAATGGCTACCCCTTTCGATGCCCAAAGCCTTCAGGAGCAGAAGCTTCACAGGCTGAGA 3019
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------------------- 2718
Query 3020 GCTCAGATTTAGAAAGCTCTGATCTGGTGGATCAGACTGAAGGCTGCCAGCCTGTGTACGTG 3081
Sbjct 2719 -------------------------------------------------------------- 2718