Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491369
• Subject: NM_001081277.1
• Aligned Length: 1688
• Identities: 1458
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||..|.|||||
Sbjct    1  ATGAACACCAACGACGCCAAGGAGTACCTGGCCCGGAGGGACATTCCTCAGCTTTTCGAGAGCCTGCTCAATGG  74

Query   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148
            ..||||||||||.|||||.|||||.||..||||.||||||||||.|||||||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct   75  CTTGATGTGTTCCAAGCCAGAAGACCCCATAGAGTACTTGGAAACTTGTTTACAGAAAGTCAAGGAGCTAGGAG  148

Query  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.
Sbjct  149  GCTGTGACAAGGTGAAGTGGGACACATTTGTCAGCCAGGAAAAGAAGACGTTACCGCCCCTAAATGGAGGACAA  222

Query  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296
            ||||||||||||||.||..|||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACGGAGATCCTTCCTCCGAAATGTCATGCCTGAAAATTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296

Query  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370
            |||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||.||.||.|||||||
Sbjct  297  TCCAATCCACCAGTTTTCCATAGAGAGTGACACGGACCTGTCGGAGACGGCGGAGCTGATAGAAGAATATGAGG  370

Query  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444
            |||||||.||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTTGACCCGACTAGACCTCGGCCCAAAATCATTCTTGTCATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444

Query  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518
            |||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  445  AGTTTGAAAATTGCAGAGCGGTATGGATTCCAGTACATCTCAGTGGGAGAATTATTGAGGAAGAAAATCCACAG  518

Query  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592
            |.||||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||.||.|.|||.||..|||||||||||||.||||
Sbjct  519  TGCCAGCAGCAACAGAAAATGGAGTCTGATCGCCAAGATAATCACCAATGGGGAGCTGGCCCCACAGGAGACAA  592

Query  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  593  CAATTACGGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCCGATGAAGAAGGCATTGTGATTGATGGATTCCCAAGG  666

Query  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||..|||||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  GATGTTGCCCAGGCTCTGTCTTTTGAGGACCAGATCTGCACCCCTGACCTGGTGGTGTTCCTGGCTTGTGCCAA  740

Query  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814
            .|||||.|||||.||.||.||||.|||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||..|.|||||.||||
Sbjct  741  CCAGAGGCTCAAGGAGAGGTTACAGAAGCGTGCGGAGCAGCAGGGGCGGCCAGATGACAACCTGAAAGCAACCC  814

Query  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888
            |||||||||||.|||||||||||||||||||.||.|||.|.||.||.||||||||.||.|||||.||||||.||
Sbjct  815  AAAGGAGACTAGTGAACTTCAAGCAGAATGCCGCCCCACTAGTGAAGTACTTCCAAGAGAAGGGACTCATCGTG  888

Query  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962
            ||.||||||||||||||.|||||.||.|..||||||.|||||||||||.||||.||.||||.||||.|.|||||
Sbjct  889  ACTTTTGATGCCGACCGAGATGAAGACGCAGTGTTCCATGACATCAGCGTGGCCGTCGACAGCAAGCTGTTTCC  962

Query  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGG-TTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGAT  1035
            ||||||||||||| |.|..|| |||||||||||||||.|||||.|||||.||.||..||||||||||.|||||.
Sbjct  963  AAACAAAGAGGCT-CCGATGGATTCAAGTGACCTTGACCCTTCCATGATGTTTGATGCTGGAGAGATTATTGAC  1035

Query 1036  ACAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCAT  1109
            ||||||||.|||||.||..|.||||..|||||.|||.||||||||||||||||.|||||...||||||.|||||
Sbjct 1036  ACAGGATCAGATTACGATAACCAGGACGATGATCAGCTAAATGTATTTGGAGAAGACACAGAGGGAGGCTTCAT  1109

Query 1110  GGAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAA  1183
            |||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 1110  GGAGGATTTGAGGAAGTGTAAAATTATTTTCTTGATGGGTGGCCCTGGCTCTGGCAAAGGCACCCAGTGTGAGA  1183

Query 1184  AGCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCT  1257
            ||||||..|||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||..||||||||.|.|||||.||.
Sbjct 1184  AGCTGGCAGAAAAATATGGCTTCACCCATCTCTCTACTGGTGAGCTCCTGCGCCAGGAACTGACCTCAGAGTCA  1257

Query 1258  GAAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCT  1331
            ||||||||||||.|||||.|.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||..|||||.|||||||.||
Sbjct 1258  GAAAGAAGCAAACTGATCCGTGACATCATGGAGCGTGGAGATCTGGTGCCCTCGGGTGTCGTTCTGGAGCTGCT  1331

Query 1332  GAAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGC  1405
            ||||||||||||||||||||||||.||..||||||.|||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1332  GAAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTGGGCAACACCAAGGGCTTCCTGATTGACGGCTACCCCCGGGAAGTGAAGC  1405

Query 1406  AAGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATG  1479
            |||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1406  AAGGGGAAGAGTTTGGACGAAGGATCGGAGACCCACACTTGGTGATCTGCATGGACTGCTCAGCAGACACCATG  1479

Query 1480  ACCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCT  1553
            ||.|||||||||||.||.||.||||.||||||||.||..|.|||.|||....||||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1480  ACTAACCGCCTTCTTCAGAGAAGCCAGAGCAGCCAGCGGGGGGAGGACGGTGCCAAGAGCATTGCCAAGCGCCT  1553

Query 1554  AGAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATG  1627
            .||.||||||.|||||||||||||||||||..||.||||||||||||..|||||||||||||..|||.||||||
Sbjct 1554  GGAGGCCTACCACCGAGCGTCCATCCCCGTCGTCACCTACTACGAGAGGAAAACACAGCTACGGAAGGTAAATG  1627

Query 1628  CAGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTCG  1687
            |||||||||||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||| 
Sbjct 1628  CAGAGGGAACACCAGAGCAAGTTTTTCTTCAGCTCTGCACAGCTATTGACTCTGTTTTC-  1686