Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491369
• Subject: XM_005270739.5
• Aligned Length: 1687
• Identities: 1614
• Gaps: 73

Alignment

Query    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74

Query   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148

Query  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222

Query  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAAT--------------------------------------------------  246

Query  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  247  ----------------------GAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  298

Query  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  299  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  372

Query  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  373  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  446

Query  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  447  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  520

Query  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  521  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  594

Query  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  595  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  668

Query  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  669  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  742

Query  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  743  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  816

Query  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  817  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  890

Query  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  891  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  964

Query 1037  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  965  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1038

Query 1111  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1039  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1112

Query 1185  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1113  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1186

Query 1259  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1187  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1260

Query 1333  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1261  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1334

Query 1407  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1408

Query 1481  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1482

Query 1555  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1556

Query 1629  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTCG  1687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1557  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTC-  1614