Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491369
• Subject: XM_006710572.3
• Aligned Length: 1687
• Identities: 1608
• Gaps: 79

Alignment

Query    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  70

Query  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  144

Query  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  218

Query  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  292

Query  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  366

Query  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  367  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  440

Query  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  441  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  514

Query  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  515  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  588

Query  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  589  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  662

Query  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  736

Query  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  810

Query  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  884

Query  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  958

Query 1037  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1032

Query 1111  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1106

Query 1185  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1180

Query 1259  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1254

Query 1333  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1328

Query 1407  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1402

Query 1481  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1476

Query 1555  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1550

Query 1629  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTCG  1687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1551  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTC-  1608