Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491369
• Subject: XM_017001011.2
• Aligned Length: 1687
• Identities: 1536
• Gaps: 151

Alignment

Query    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  70

Query  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  144

Query  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||                                                  
Sbjct  145  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAAT--------------------------------------------------  168

Query  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  169  ----------------------GAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  220

Query  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  221  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  294

Query  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  368

Query  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  369  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  442

Query  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  443  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  516

Query  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  517  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  590

Query  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  591  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  664

Query  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  738

Query  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  739  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  812

Query  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  813  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  886

Query 1037  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  887  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  960

Query 1111  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  961  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1034

Query 1185  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1035  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1108

Query 1259  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1182

Query 1333  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1256

Query 1407  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1257  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1330

Query 1481  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1331  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1404

Query 1555  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1405  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1478

Query 1629  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTCG  1687
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct 1479  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTC-  1536