Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491369
• Subject: XM_017001012.1
• Aligned Length: 1687
• Identities: 1161
• Gaps: 520

Alignment

Query    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACACCAACGATGCCAAGGAGTATCTGGCCCGGAGGGAAATCCCTCAGCTTTTTGAGAGCCTTTTGAATGG  74

Query   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ACTGATGTGTTCTAAGCCCGAAGATCCAGTAGAATACTTGGAAAGTTGTTTACAAAAAGTAAAGGAACTGGGTG  148

Query  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTGTGACAAGGTGAAATGGGATACATTTGTAAGCCAGGAAAAGAAGACCTTACCTCCACTAAATGGAGGACAG  222

Query  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TCACGGAGATCCTTTCTAAGAAATGTAATGCCTGAAAACTCAAACTTTCCATATCGGCGGTATGACCGGCTCCC  296

Query  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAATCCATCAATTCTCCATAGAAAGTGACACGGATCTCTCTGAGACTGCAGAGTTGATTGAGGAGTATGAGG  370

Query  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTTTTGATCCTACCAGACCTCGACCAAAAATCATTCTTGTTATAGGTGGTCCAGGAAGTGGAAAGGGTACTCAG  444

Query  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGTTTGAAAATTGCAGAACGATATGGATTCCAATACATTTCTGTGGGAGAATTATTAAGAAAGAAGATCCACAG  518

Query  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TACCAGCAGCAATAGGAAATGGAGTCTTATTGCCAAGATAATTACAACTGGAGAATTGGCCCCACAGGAAACAA  592

Query  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAATTACAGAGATAAAACAAAAATTGATGCAAATACCTGATGAAGAGGGCATTGTTATTGATGGATTTCCAAGA  666

Query  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGTTGCCCAGGCTCTATCTTTTGAGGACCAAATCTGTACCCCCGATTTGGTGGTATTCCTGGCTTGTGCTAA  740

Query  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCAGAGACTCAAAGAAAGATTACTGAAGCGTGCAGAACAGCAGGGCCGACCAGACGACAATGTAAAAGCTACCC  814

Query  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AAAGGAGACTAATGAACTTCAAGCAGAATGCTGCTCCATTGGTTAAATACTTCCAGGAAAAGGGGCTCATCATG  888

Query  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACATTTGATGCCGACCGCGATGAGGATGAGGTGTTCTATGACATCAGCATGGCAGTTGACAACAAGTTATTTCC  962

Query  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAACAAAGAGGCTGCAGCAGGTTCAAGTGACCTTGATCCTTCGATGATATTGGACACTGGAGAGATCATTGATA  1036

Query 1037  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGGATCTGATTATGAAGATCAGGGTGATGACCAGTTAAATGTATTTGGAGAGGACACTATGGGAGGTTTCATG  1110

Query 1111  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAATTGGTGGTCCTGGCTCTGGCAAAGGCACACAGTGTGAAAA  1184
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||.||..|||| ..||||   |||.          
Sbjct 1111  GAAGATTTGAGAAAGTGTAAAATTATTTTCATAAT---TGGACCATGCTC-ACCAAA---ACAA----------  1167

Query 1185  GCTGGTGGAAAAATATGGATTTACACATCTCTCAACTGGCGAGCTCCTGCGTGAGGAACTGGCATCAGAATCTG  1258
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1259  AAAGAAGCAAATTGATCAGAGACATTATGGAACGTGGAGACCTGGTGCCCTCAGGCATCGTTTTGGAGCTCCTG  1332
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1333  AAGGAGGCCATGGTGGCCAGCCTCGGGGACACCAGGGGCTTCCTGATTGACGGCTATCCTCGGGAGGTGAAGCA  1406
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1407  AGGGGAAGAGTTCGGACGCAGGATTGGAGACCCACAGTTGGTGATCTGTATGGACTGCTCGGCAGACACCATGA  1480
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1481  CCAACCGCCTTCTCCAAAGGAGCCGGAGCAGCCTGCCTGTGGACGACACCACCAAGACCATCGCCAAGCGCCTA  1554
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1555  GAAGCCTACTACCGAGCGTCCATCCCCGTGATCGCCTACTACGAGACAAAAACACAGCTACACAAGATAAATGC  1628
                                                                                      
Sbjct 1168  --------------------------------------------------------------------------  1167

Query 1629  AGAGGGAACACCAGAGGACGTTTTTCTTCAACTCTGCACAGCTATTGACTCTATTTTCG  1687
                                                                       
Sbjct 1168  -----------------------------------------------------------  1167