Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491418
• Subject: NM_001171004.1
• Aligned Length: 2670
• Identities: 2394
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCTGCAAATAATTCCCCTCCATCAGCCCAGAAGTCTGTATTACCCACAGCTATTCCTGCTGTGCTTCCAGC  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||..||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTGCAAATAATTCCCCTCCATCAGCCCAGAAATCTGTGTTCCCTGCAACTGTTTCTGCTGTGCTTCCAGC  74

Query   75  TGCTTCTCCGTGTTCAAGTCCTAAGACGGGACTCTCTGCCCGACTCTCTAATGGAAGCTTCAGTGCACCATCAC  148
            |.|||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct   75  TCCTTCTCCGTGTTCAAGTCCCAAAACAGGACTCTCAGCTCGGCTCTCTAATGGCAGCTTCAGTGCCCCGTCAC  148

Query  149  TCACCAACTCCAGAGGCTCAGTGCATACAGTTTCATTTCTACTGCAAATTGGCCTCACACGGGAGAGTGTTACC  222
            ||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  149  TCACAAACTCTAGAGGCTCAGTGCACACAGTTTCATTTCTACTTCAGATTGGCCTCACACGAGAGAGTGTTACC  222

Query  223  ATTGAAGCCCAGGAACTGTCTTTATCTGCTGTCAAGGATCTTGTGTGCTCCATAGTTTATCAAAAGTTTCCAGA  296
            ||.||.|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  ATCGAGGCCCAGGAACTGTCTCTCTCTGCTGTCAAAGACCTCGTGTGCTCCATTGTTTATCAGAAGTTTCCAGA  296

Query  297  GTGTGGATTCTTTGGCATGTATGACAAAATTCTTCTCTTTCGCCATGACATGAACTCAGAAAACATTTTGCAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GTGTGGATTCTTTGGCATGTATGATAAAATTCTTCTCTTTCGCCACGACATGAACTCAGAAAACATTTTGCAGC  370

Query  371  TGATTACCTCAGCAGATGAAATACATGAAGGAGACCTAGTGGAAGTGGTTCTTTCAGCTTTAGCCACAGTAGAA  444
            |||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TGATTACCTCAGCAGATGAAATACATGAAGGGGACCTGGTAGAAGTTGTCCTGTCAGCTTTGGCCACAGTGGAA  444

Query  445  GACTTCCAGATTCGTCCACATACTCTCTATGTACATTCTTACAAAGCTCCTACTTTCTGTGATTACTGTGGTGA  518
            |||||||||||.||.||.||..|||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTTCCAGATCCGCCCTCACGCTCTCTATGTACATTCTTACAAAGCACCTACTTTTTGTGATTACTGTGGTGA  518

Query  519  GATGCTCTGGGGATTGGTACGTCAAGGACTGAAATGTGAAGGCTGTGGATTAAATTACCATAAACGATGTGCCT  592
            .||||||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  519  AATGCTCTGGGGACTGGTACGTCAAGGATTAAAATGTGAAGGCTGTGGATTAAATTATCATAAACGATGTGCCT  592

Query  593  TCAAGATTCCAAATAACTGTAGTGGAGTAAGAAAGAGACGTCTGTCAAATGTATCTTTACCAGGACCCGGCCTC  666
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||.||||||
Sbjct  593  TCAAGATTCCAAATAACTGCAGTGGAGTAAGAAAGAGACGTCTGTCAAATGTATCTCTGCCAGGACCTGGCCTC  666

Query  667  TCAGTTCCAAGACCCCTACAGCCTGAATATGTAGCCCTTCCCAGTGAAGAGTCACATGTCCACCAGGAACCAAG  740
            |||||||||||||||||.||||||||.|.|||..||||||.||||||||||||||||...|||||.||.||.||
Sbjct  667  TCAGTTCCAAGACCCCTGCAGCCTGAGTGTGTGCCCCTTCTCAGTGAAGAGTCACATACTCACCAAGAGCCCAG  740

Query  741  TAAGAGAATTCCTTCTTGGAGTGGTCGCCCAATCTGGATGGAAAAGATGGTAATGTGCAGAGTGAAAGTTCCAC  814
            |||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct  741  TAAGAGAATCCCGTCGTGGAGTGGTCGTCCGATCTGGATGGAAAAGATGGTAATGTGCAGGGTCAAAGTCCCTC  814

Query  815  ACACATTTGCTGTTCACTCTTACACCCGTCCCACGATATGTCAGTACTGCAAGCGGTTACTGAAAGGCCTCTTT  888
            |||||||||||||.||||||||...|||.||.||.|||||.||||||||||||||..|.||||||||||||||.
Sbjct  815  ACACATTTGCTGTCCACTCTTATGGCCGCCCGACCATATGCCAGTACTGCAAGCGCCTGCTGAAAGGCCTCTTC  888

Query  889  CGCCAAGGAATGCAGTGTAAAGATTGCAAATTCAACTGCCATAAATGCTGTGCATCAAAAGTACCAAGAGACTG  962
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  889  CGCCAAGGGATGCAGTGTAAAGATTGCAAATTCAACTGCCATAAACGCTGTGCATCCAAAGTACCAAGAGACTG  962

Query  963  CCTTGGAGAGGTTACTTTCAATGGAGAACCTTCCAGTCTGGGAACAGATACAGATATACCAATGGATATCGACA  1036
            ||||||.||.|||||||||||||||||.||.|.|||..||||.||.|||.||||.||.||.||||||||.||||
Sbjct  963  CCTTGGCGAAGTTACTTTCAATGGAGAGCCGTGCAGCGTGGGGACTGATGCAGACATGCCCATGGATATTGACA  1036

Query 1037  ATAATGACATAAATAGTGATAGTAGTCGGGGTTTGGATGACACAGAAGAGCCATCACCCCCAGAAGATAAGATG  1110
            .||.|||..|.||.||||||.|.|||.||||.|||||||||.||||.|||||.||.||.||.|||||.||||||
Sbjct 1037  GTAGTGATGTGAACAGTGATGGCAGTAGGGGCTTGGATGACTCAGAGGAGCCGTCCCCGCCCGAAGACAAGATG  1110

Query 1111  TTCTTCTTGGACCCATCTGATCTCGATGTGGAAAGAGATGAAGAAGCCGTTAAAACAATCAGTCCATCAACAAG  1184
            ||||||.|.|||||..||||||||||.|||||..|||||||.||..|.|||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 1111  TTCTTCCTCGACCCGACTGATCTCGACGTGGAGCGAGATGAGGAGACTGTTAAGACAATCAGTCCATCCACCAG  1184

Query 1185  CAATAATATTCCGCTCATGAGGGTTGTACAATCCATCAAGCACACAAAGAGGAAGAGCAGCACAATGGTGAAGG  1258
            |||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||.||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1185  CAATAATATCCCGCTGATGAGGGTGGTGCAGTCCATCAAGCACACAAAGAGGAGGAGCAGCACAGTTGTGAAGG  1258

Query 1259  AAGGGTGGATGGTCCATTACACCAGCAGGGATAACCTGAGAAAGAGGCATTATTGGAGACTTGACAGCAAATGT  1332
            ||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1259  AAGGGTGGATGGTCCACTACACCAGCAGGGACAACCTGAGAAAGAGACATTATTGGAGACTTGACAGTAAATGT  1332

Query 1333  CTAACATTATTTCAGAATGAATCTGGATCAAAGTATTATAAGGAAATTCCACTTTCAGAAATTCTCCGCATATC  1406
            ||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1333  CTAACATTGTTTCAAAATGAATCTGGATCAAAGTATTATAAGGAAATTCCACTTTCAGAAATTCTCCGTGTATC  1406

Query 1407  TTCACCACGAGATTTCACAAACATTTCACAAGGCAGCAATCCACACTGTTTTGAAATCATTACTGATACTATGG  1480
            ||||||.|.|||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||..|||
Sbjct 1407  TTCACCGCAAGATTTCACCAGCATTTCACAAGGCAGTAACCCACACTGTTTTGAAATCATCACCGATACCGTGG  1480

Query 1481  TATACTTCGTTGGTGAGAACAATGGGGACAGCTCTCATAATCCTGTTCTTGCTGCCACTGGAGTTGGACTTGAT  1554
            |||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 1481  TATACTTTGTTGGTGAGAACAATGGGAGCAGCTCTCATAATCCTGTTCTCGCTGCCACTGGAGTGGGACTAGAT  1554

Query 1555  GTAGCACAGAGCTGGGAAAAAGCAATTCGCCAAGCCCTCATGCCTGTTACTCCTCAAGCAAGTGTTTGCACTTC  1628
            ||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GTGGCGCAGAGCTGGGAAAAAGCAATTCGCCAGGCCCTCATGCCTGTCACTCCTCAAGCAAGTGTTTGCACTTC  1628

Query 1629  TCCAGGGCAAGGGAAAGATCACAAAGATTTGTCTACAAGTATCTCTGTATCTAATTGTCAGATTCAGGAGAATG  1702
            |||.|||||||||||.||.|||||||||.||.||||.||||||||.||.|||||.||||||.||||||||||||
Sbjct 1629  TCCGGGGCAAGGGAAGGACCACAAAGATCTGGCTACCAGTATCTCCGTGTCTAACTGTCAGGTTCAGGAGAATG  1702

Query 1703  TGGATATCAGTACTGTTTACCAGATCTTTGCAGATGAGGTGCTTGGTTCAGGCCAGTTTGGCATCGTTTATGGA  1776
            |.||.|||||.|..|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1703  TCGACATCAGCAGCGTTTACCAGATCTTTGCGGACGAGGTGCTTGGTTCTGGCCAGTTTGGCATTGTTTATGGA  1776

Query 1777  GGAAAACATAGAAAGACTGGGAGGGATGTGGCTATTAAAGTAATTGATAAGATGAGATTCCCCACAAAACAAGA  1850
            ||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1777  GGAAAACACAGAAAGACGGGAAGGGATGTGGCTATTAAAGTGATTGATAAAATGAGGTTCCCCACAAAGCAAGA  1850

Query 1851  AAGTCAACTCCGTAATGAAGTGGCTATTTTACAGAATTTGCACCATCCTGGGATTGTAAACCTGGAATGTATGT  1924
            .|||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1851  GAGTCAGCTCCGGAACGAAGTGGCCATTTTACAGAATCTGCACCATCCTGGGATTGTAAACCTGGAGTGTATGT  1924

Query 1925  TTGAAACCCCAGAACGAGTCTTTGTAGTAATGGAAAAGCTGCATGGAGATATGTTGGAAATGATTCTATCCAGT  1998
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1925  TTGAAACCCCAGAACGAGTCTTCGTGGTGATGGAAAAGCTCCATGGAGATATGTTGGAAATGATTCTGTCCAGT  1998

Query 1999  GAGAAAAGTCGGCTTCCAGAACGAATTACTAAATTCATGGTCACACAGATACTTGTTGCTTTGAGGAATCTGCA  2072
            ||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.||
Sbjct 1999  GAAAAGAGTCGACTTCCAGAACGGATTACCAAATTCATGGTCACACAGATACTTGTTGCCTTGAGGAATTTACA  2072

Query 2073  TTTTAAGAATATTGTGCACTGTGATTTAAAGCCAGAAAATGTGCTGCTTGCATCAGCAGAGCCATTTCCTCAGG  2146
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2073  TTTCAAGAATATTGTGCACTGTGATTTAAAGCCCGAAAATGTGCTGCTTGCATCCGCAGAGCCATTTCCTCAGG  2146

Query 2147  TGAAGCTGTGTGACTTTGGATTTGCACGCATCATTGGTGAAAAGTCATTCAGGAGATCTGTGGTAGGAACTCCA  2220
            |||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 2147  TGAAGCTGTGTGACTTTGGGTTTGCCCGCATCATTGGTGAGAAGTCGTTCCGGAGGTCAGTGGTAGGAACTCCA  2220

Query 2221  GCATACTTAGCCCCTGAAGTTCTCCGGAGCAAAGGTTACAACCGTTCCCTAGATATGTGGTCAGTGGGAGTTAT  2294
            ||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 2221  GCCTACTTAGCCCCTGAGGTTCTCAGGAGCAAAGGCTACAACCGTTCTCTAGACATGTGGTCGGTGGGCGTCAT  2294

Query 2295  CATCTATGTGAGCCTCAGTGGCACATTTCCTTTTAATGAGGATGAAGATATAAATGACCAAATCCAAAATGCTG  2368
            |.|.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2295  CGTTTATGTGAGCCTCAGTGGCACATTCCCATTCAATGAAGATGAAGATATAAATGACCAAATCCAAAACGCTG  2368

Query 2369  CATTTATGTACCCACCAAATCCATGGAGAGAAATTTCTGGTGAAGCAATTGATCTGATAAACAATCTGCTTCAA  2442
            |.||||||||||||||||||||||||.||||||||||..|||||||||||||..||||||||||..||||||||
Sbjct 2369  CGTTTATGTACCCACCAAATCCATGGCGAGAAATTTCCAGTGAAGCAATTGACTTGATAAACAACTTGCTTCAA  2442

Query 2443  GTGAAGATGAGAAAACGTTACAGTGTTGACAAATCTCTTAGTCATCCCTGGCTACAGGACTATCAGACTTGGCT  2516
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2443  GTGAAGATGAGAAAACGATACAGTGTTGACAAATCTCTCAGTCATCCTTGGCTACAGGATTATCAGACTTGGCT  2516

Query 2517  TGACCTTAGAGAATTTGAAACTCGCATTGGAGAACGTTACATTACACATGAAAGTGATGATGCTCGCTGGGAAA  2590
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  TGACCTCAGAGAATTTGAAACTCGCATTGGAGAACGTTACATTACACACGAAAGTGATGATGCTCGCTGGGAAA  2590

Query 2591  TACATGCATACACACATAACCTTGTATACCCAAAGCACTTCATTATGGCTCCTAATCCAGATGATATGGAAGAA  2664
            ||||.||||||||.||.||.||.|.||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||.||.
Sbjct 2591  TACACGCATACACGCACAATCTGGAATACCCAAAGCATTTCATTATGGCCCCCAACCCAGACGACATGGAGGAG  2664

Query 2665  GATCCT  2670
            ||||||
Sbjct 2665  GATCCT  2670