Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491423
• Subject: NM_001122605.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1085
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAGATCGGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGAC  74
            |||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGAACAGCGCGGGCGCCGACGAAATCGGGAAGCTCTTTGTGGGCGGCCTGGACTGGAGTACCACTCAAGAGAC  74

Query   75  TCTGCGCAGCTACTTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  148
            |||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCTACGCAGCTACTTTTCCCAGTATGGTGAGGTTGTGGATTGTGTCATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  148

Query  149  CTCGAGGCTTTGGGTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACG  222
            ||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  149  CTAGAGGCTTTGGATTTGTCAAGTTTAAAGACCCCAATTGTGTGGGGACAGTGCTGGCCAGCAGACCACACACC  222

Query  223  CTAGATGGCCGAAACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGA  296
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct  223  CTAGATGGCCGAAATATCGACCCGAAGCCGTGCACACCTCGGGGGATGCAGCCAGAGCGAACACGGCCCAAGGA  296

Query  297  AGGATGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATT  370
            |||.||   ||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  297  AGGCTG---GAAAGGACCCAGGAGCGACAGCAGCAAATCCAACAAGATCTTTGTCGGGGGCATTCCCCACAACT  367

Query  371  GTGGTGAGACAGAGCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCC  444
            |.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  368  GCGGGGAGACGGAGCTCAGGGAGTACTTCAAGAAGTTTGGAGTGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG  441

Query  445  GAGAAGCAGAGGCCCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  518
            |||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GAGAAGCAGCGGCCTCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  515

Query  519  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||.|
Sbjct  516  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAGGTTAAACGGGCTGAACCACGGGACAGCAAGAATCAAGCTC  589

Query  593  CGGGACAGCCAGGTGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCC  666
            |.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||..||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  590  CAGGACAGCCAGGAGCCAGCCAGTGGGGCAGCCGCGTGGCGCCCAGTGCAGCCAACGGCTGGGCAGGCCAGCCC  663

Query  667  CCGCCCACGTGGCAGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGG  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  664  CCGCCCACGTGGCAACAAGGATATGGCCCACAAGGAATGTGGGTGCCAGCAGGACAGGCCATTGGTGGCTATGG  737

Query  741  ACCGCCCCCTGCAGGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTG  814
            .||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  738  CCCACCCCCTGCGGGCAGAGGAGCCCCGCCCCCGCCCCCACCCTTCACCTCCTACATTGTATCCACACCGCCTG  811

Query  815  GAGGCTTTCCCCCTCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCT  888
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  812  GAGGCTTCCCCCCACCACAGGGCTTCCCACAGGGCTATGGCGCCCCACCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGTCCT  885

Query  889  CCACCTCCACCGCCAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCT  962
            ||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  886  CCTCCCCCACCCCCTGATCAGTTTGCCCCTCCAGGGGTCCCTCCTCCACCTGCCACCCCAGGGGCTGCCCCGCT  959

Query  963  GGCTTTCCCACCGCCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCT  1036
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  960  GGCCTTCCCACCACCTCCGTCTCAGGCTGCCCCAGACATGAGCAAACCCCCAACAGCCCAGCCGGACTTCCCCT  1033

Query 1037  ATGGTCAGTATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCT  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1034  ATGGTCAATATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGCCAGGGCTTCTCGGACCCCAGCCAGCAGCCG  1107

Query 1111  CCTTCCTACGGGGGTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCA  1184
            ||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1108  CCCTCCTATGGGGGCCCCTCTGTACCAGGTTCGGGGGGTCCCCCCGCTGGCGGCAGTGGCTTCGGACGCGGGCA  1181

Query 1185  GAACCACAACGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1221
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1182  GAACCACAACGTGCAGGGCTTCCATCCCTACCGGCGC  1218