Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491423
• Subject: XM_006514070.4
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1066
• Gaps: 24

Alignment

Query    1  ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAGATCGGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGAC  74
                                    ||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGGGGAAGCTCTTTGTGGGCGGCCTGGACTGGAGTACCACTCAAGAGAC  50

Query   75  TCTGCGCAGCTACTTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  148
            |||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  TCTACGCAGCTACTTTTCCCAGTATGGTGAGGTTGTGGATTGTGTCATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  124

Query  149  CTCGAGGCTTTGGGTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACG  222
            ||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  125  CTAGAGGCTTTGGATTTGTCAAGTTTAAAGACCCCAATTGTGTGGGGACAGTGCTGGCCAGCAGACCACACACC  198

Query  223  CTAGATGGCCGAAACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGA  296
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct  199  CTAGATGGCCGAAATATCGACCCGAAGCCGTGCACACCTCGGGGGATGCAGCCAGAGCGAACACGGCCCAAGGA  272

Query  297  AGGATGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATT  370
            |||.|||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  273  AGGCTGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGACAGCAGCAAATCCAACAAGATCTTTGTCGGGGGCATTCCCCACAACT  346

Query  371  GTGGTGAGACAGAGCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCC  444
            |.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  347  GCGGGGAGACGGAGCTCAGGGAGTACTTCAAGAAGTTTGGAGTGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG  420

Query  445  GAGAAGCAGAGGCCCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  518
            |||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  421  GAGAAGCAGCGGCCTCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  494

Query  519  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||.|
Sbjct  495  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAGGTTAAACGGGCTGAACCACGGGACAGCAAGAATCAAGCTC  568

Query  593  CGGGACAGCCAGGTGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCC  666
            |.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||..||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  569  CAGGACAGCCAGGAGCCAGCCAGTGGGGCAGCCGCGTGGCGCCCAGTGCAGCCAACGGCTGGGCAGGCCAGCCC  642

Query  667  CCGCCCACGTGGCAGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGG  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  643  CCGCCCACGTGGCAACAAGGATATGGCCCACAAGGAATGTGGGTGCCAGCAGGACAGGCCATTGGTGGCTATGG  716

Query  741  ACCGCCCCCTGCAGGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTG  814
            .||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  717  CCCACCCCCTGCGGGCAGAGGAGCCCCGCCCCCGCCCCCACCCTTCACCTCCTACATTGTATCCACACCGCCTG  790

Query  815  GAGGCTTTCCCCCTCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCT  888
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  791  GAGGCTTCCCCCCACCACAGGGCTTCCCACAGGGCTATGGCGCCCCACCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGTCCT  864

Query  889  CCACCTCCACCGCCAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCT  962
            ||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  865  CCTCCCCCACCCCCTGATCAGTTTGCCCCTCCAGGGGTCCCTCCTCCACCTGCCACCCCAGGGGCTGCCCCGCT  938

Query  963  GGCTTTCCCACCGCCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCT  1036
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  939  GGCCTTCCCACCACCTCCGTCTCAGGCTGCCCCAGACATGAGCAAACCCCCAACAGCCCAGCCGGACTTCCCCT  1012

Query 1037  ATGGTCAGTATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCT  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1013  ATGGTCAATATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGCCAGGGCTTCTCGGACCCCAGCCAGCAGCCG  1086

Query 1111  CCTTCCTACGGGGGTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCA  1184
            ||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1087  CCCTCCTATGGGGGCCCCTCTGTACCAGGTTCGGGGGGTCCCCCCGCTGGCGGCAGTGGCTTCGGACGCGGGCA  1160

Query 1185  GAACCACAACGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1221
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1161  GAACCACAACGTGCAGGGCTTCCATCCCTACCGGCGC  1197