Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491423
• Subject: XM_006514071.4
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1063
• Gaps: 27

Alignment

Query    1  ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAGATCGGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGAC  74
                                    ||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ------------------------ATGGGGAAGCTCTTTGTGGGCGGCCTGGACTGGAGTACCACTCAAGAGAC  50

Query   75  TCTGCGCAGCTACTTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  148
            |||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   51  TCTACGCAGCTACTTTTCCCAGTATGGTGAGGTTGTGGATTGTGTCATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT  124

Query  149  CTCGAGGCTTTGGGTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACG  222
            ||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct  125  CTAGAGGCTTTGGATTTGTCAAGTTTAAAGACCCCAATTGTGTGGGGACAGTGCTGGCCAGCAGACCACACACC  198

Query  223  CTAGATGGCCGAAACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGA  296
            ||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct  199  CTAGATGGCCGAAATATCGACCCGAAGCCGTGCACACCTCGGGGGATGCAGCCAGAGCGAACACGGCCCAAGGA  272

Query  297  AGGATGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATT  370
            |||.||   ||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct  273  AGGCTG---GAAAGGACCCAGGAGCGACAGCAGCAAATCCAACAAGATCTTTGTCGGGGGCATTCCCCACAACT  343

Query  371  GTGGTGAGACAGAGCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCC  444
            |.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  344  GCGGGGAGACGGAGCTCAGGGAGTACTTCAAGAAGTTTGGAGTGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG  417

Query  445  GAGAAGCAGAGGCCCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  518
            |||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  418  GAGAAGCAGCGGCCTCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT  491

Query  519  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGC  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||.|
Sbjct  492  GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAGGTTAAACGGGCTGAACCACGGGACAGCAAGAATCAAGCTC  565

Query  593  CGGGACAGCCAGGTGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCC  666
            |.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||..||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct  566  CAGGACAGCCAGGAGCCAGCCAGTGGGGCAGCCGCGTGGCGCCCAGTGCAGCCAACGGCTGGGCAGGCCAGCCC  639

Query  667  CCGCCCACGTGGCAGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGG  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  640  CCGCCCACGTGGCAACAAGGATATGGCCCACAAGGAATGTGGGTGCCAGCAGGACAGGCCATTGGTGGCTATGG  713

Query  741  ACCGCCCCCTGCAGGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTG  814
            .||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct  714  CCCACCCCCTGCGGGCAGAGGAGCCCCGCCCCCGCCCCCACCCTTCACCTCCTACATTGTATCCACACCGCCTG  787

Query  815  GAGGCTTTCCCCCTCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCT  888
            |||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  788  GAGGCTTCCCCCCACCACAGGGCTTCCCACAGGGCTATGGCGCCCCACCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGTCCT  861

Query  889  CCACCTCCACCGCCAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCT  962
            ||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct  862  CCTCCCCCACCCCCTGATCAGTTTGCCCCTCCAGGGGTCCCTCCTCCACCTGCCACCCCAGGGGCTGCCCCGCT  935

Query  963  GGCTTTCCCACCGCCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCT  1036
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct  936  GGCCTTCCCACCACCTCCGTCTCAGGCTGCCCCAGACATGAGCAAACCCCCAACAGCCCAGCCGGACTTCCCCT  1009

Query 1037  ATGGTCAGTATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCT  1110
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1010  ATGGTCAATATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGCCAGGGCTTCTCGGACCCCAGCCAGCAGCCG  1083

Query 1111  CCTTCCTACGGGGGTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCA  1184
            ||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1084  CCCTCCTATGGGGGCCCCTCTGTACCAGGTTCGGGGGGTCCCCCCGCTGGCGGCAGTGGCTTCGGACGCGGGCA  1157

Query 1185  GAACCACAACGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC  1221
            |||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1158  GAACCACAACGTGCAGGGCTTCCATCCCTACCGGCGC  1194