Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491423
- Subject:
- XM_030245259.1
- Aligned Length:
- 1221
- Identities:
- 1060
- Gaps:
- 30
Alignment
Query 1 ATGAACAACTCGGGCGCCGACGAGATCGGGAAGCTCTTCGTGGGCGGTCTTGACTGGAGCACGACCCAAGAGAC 74
||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1 ------------------------ATGGGGAAGCTCTTTGTGGGCGGCCTGGACTGGAGTACCACTCAAGAGAC 50
Query 75 TCTGCGCAGCTACTTTTCCCAATATGGAGAAGTCGTAGATTGTGTTATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT 148
|||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 51 TCTACGCAGCTACTTTTCCCAGTATGGTGAGGTTGTGGATTGTGTCATCATGAAAGATAAAACCACCAACCAGT 124
Query 149 CTCGAGGCTTTGGGTTTGTCAAATTTAAAGACCCAAACTGTGTGGGGACGGTGCTGGCCAGCAGACCGCACACG 222
||.||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 125 CTAGAGGCTTTGGATTTGTCAAGTTTAAAGACCCCAATTGTGTGGGGACAGTGCTGGCCAGCAGACCACACACC 198
Query 223 CTAGATGGCCGAAACATCGACCCCAAGCCATGCACACCCCGGGGGATGCAGCCGGAGAGAACACGGCCGAAGGA 296
||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|||||
Sbjct 199 CTAGATGGCCGAAATATCGACCCGAAGCCGTGCACACCTCGGGGGATGCAGCCAGAGCGAACACGGCCCAAGGA 272
Query 297 AGGATGGCAGAAAGGACCCAGGAGCGATAACAGTAAATCAAATAAGATATTTGTCGGTGGAATTCCTCACAATT 370
|||.|| ||||||||||||||||||.|.|||.|||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 273 AGGCTG---GAAAGGACCCAGGAGCGACAGCAGCAAATCCAACAAGATCTTTGTCGGGGGCATTCCCCACAACT 343
Query 371 GTGGTGAGACAGAGCTCAGGGAATACTTCAAGAAGTTCGGAGTGGTCACGGAGGTAGTCATGATCTATGACGCC 444
|.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct 344 GCGGGGAGACGGAGCTCAGGGAGTACTTCAAGAAGTTTGGAGTGGTCACAGAGGTGGTTATGATCTATGATGCG 417
Query 445 GAGAAGCAGAGGCCCCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT 518
|||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 418 GAGAAGCAGCGGCCTCGAGGTTTTGGATTTATTACTTTCGAGGACGAACAATCAGTGGACCAGGCTGTCAACAT 491
Query 519 GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAAGTTAAACGAGCTGAGCCTCGGGACAGCAAGAGCCAAGCGC 592
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||..|||||.|
Sbjct 492 GCATTTTCACGACATCATGGGCAAAAAAGTGGAGGTTAAACGGGCTGAACCACGGGACAGCAAGAATCAAGCTC 565
Query 593 CGGGACAGCCAGGTGCCAGCCAGTGGGGGAGCCGGGTTGTGCCCAACGCTGCCAATGGCTGGGCAGGCCAGCCC 666
|.|||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.|.|||||..||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 566 CAGGACAGCCAGGAGCCAGCCAGTGGGGCAGCCGCGTGGCGCCCAGTGCAGCCAACGGCTGGGCAGGCCAGCCC 639
Query 667 CCGCCCACGTGGCAGCAAGGATATGGCCCGCAAGGAATGTGGGTGCCGGCAGGACAGGCGATTGGTGGCTATGG 740
||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 640 CCGCCCACGTGGCAACAAGGATATGGCCCACAAGGAATGTGGGTGCCAGCAGGACAGGCCATTGGTGGCTATGG 713
Query 741 ACCGCCCCCTGCAGGAAGAGGAGCCCCCCCGCCACCCCCACCGTTCACCTCCTACATCGTGTCCACCCCTCCTG 814
.||.||||||||.||.|||||||||||.||.||.||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 714 CCCACCCCCTGCGGGCAGAGGAGCCCCGCCCCCGCCCCCACCCTTCACCTCCTACATTGTATCCACACCGCCTG 787
Query 815 GAGGCTTTCCCCCTCCCCAGGGCTTCCCTCAGGGCTACGGTGCCCCGCCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGGCCT 888
|||||||.|||||.||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 788 GAGGCTTCCCCCCACCACAGGGCTTCCCACAGGGCTATGGCGCCCCACCACAGTTCAGTTTTGGCTACGGTCCT 861
Query 889 CCACCTCCACCGCCAGATCAGTTTGCCCCTCCGGGGGTTCCTCCTCCACCAGCCACTCCCGGGGCAGCACCTCT 962
||.||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 862 CCTCCCCCACCCCCTGATCAGTTTGCCCCTCCAGGGGTCCCTCCTCCACCTGCCACCCCAGGGGCTGCCCCGCT 935
Query 963 GGCTTTCCCACCGCCTCCGTCTCAGGCTGCCCCGGACATGAGCAAGCCCCCGACAGCTCAGCCAGACTTCCCCT 1036
|||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||
Sbjct 936 GGCCTTCCCACCACCTCCGTCTCAGGCTGCCCCAGACATGAGCAAACCCCCAACAGCCCAGCCGGACTTCCCCT 1009
Query 1037 ATGGTCAGTATGCAGGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGACAGGGCTTCTCAGACCCCAGCCAGCAGCCT 1110
|||||||.||| |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1010 ATGGTCAATAT---GGTTACGGGCAGGACTTGAGTGGCTTCGGCCAGGGCTTCTCGGACCCCAGCCAGCAGCCG 1080
Query 1111 CCTTCCTACGGGGGTCCCTCCGTGCCAGGGTCGGGGGGCCCCCCCGCCGGCGGCAGCGGCTTTGGACGAGGGCA 1184
||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||
Sbjct 1081 CCCTCCTATGGGGGCCCCTCTGTACCAGGTTCGGGGGGTCCCCCCGCTGGCGGCAGTGGCTTCGGACGCGGGCA 1154
Query 1185 GAACCACAACGTGCAAGGGTTCCACCCCTACCGACGC 1221
|||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 1155 GAACCACAACGTGCAGGGCTTCCATCCCTACCGGCGC 1191