Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491429
• Subject: NM_007714.6
• Aligned Length: 1443
• Identities: 1308
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCGGCATTCCAAAAGAACTCACTGTCCTGATTGGGATAGCAGAGAAAGCTGGGGACATGAAAGCTATCGTGG  74
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGCGGCATTCCAAACGAACTCACTGTCCTGATTGGGATAGTAGAGAAAGCTGGGGCCATGAAAGCTACAGTGG  74

Query   75  AAGTCACAAGCGGAAGAGGAGATCTCATAGTAGCACACAAGAGAACAGGCATTGTAAACCACATCACCAGTTTA  148
            |||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct   75  AAGTCACAAACGCAAGAGAAGGTCTCACAGCAGTACTCAGGAGAACAGGCACTGTAAACCACATCATCAGTTTA  148

Query  149  AAGAATCTGATTGTCATTATTTAGAAGCAAGGTCCTTGAATGAGCGAGATTATCGGGACCGGAGATACGTTGAC  222
            ||||.||.||||||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct  149  AAGACTCGGATTGTCACTATTTAGAAGCAAGATGCTTGAATGAGAGAGATTATCGGGACCGGAGATACATTGAT  222

Query  223  GAATACAGGAATGACTACTGTGAAGGATATGTTCCTAGACATTATCACAGAGACATTGAAAGCGGGTATCGAAT  296
            ||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||...||.||.||
Sbjct  223  GAATACAGAAATGACTACTGCGAAGGATATGTTCCAAGACATTACCATAGAGACGTTGAAAGCACTTACCGGAT  296

Query  297  CCACTGCAGTAAATCTTCAGTCCGCAGCAGGAGAAGCAGTCCTAAAAGGAAGCGCAATAGACACTGTTCAAGTC  370
            |||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||.||||.||||||
Sbjct  297  CCATTGCAGTAAATCCTCAGTCAGGAGCAGGAGAAGCAGCCCTAAGAGAAAGCGTAATAGACCCTGTGCAAGTC  370

Query  371  ATCAGTCACGTTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATC  444
            |||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ATCAGTCGCATTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATC  444

Query  445  TGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTGGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTAGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGT  518

Query  519  TGTAGAGTGCATTGATCATGGCATGGATGGCATGCATGTAGCAGTGAAAATCGTAAAAAATGTAGGCCGTTACC  592
            ||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGTAGAGTGCATTGATCACGGCATGGATGGCTTACATGTAGCAGTGAAAATTGTAAAAAATGTAGGCCGTTACC  592

Query  593  GTGAAGCAGCTCGTTCAGAAATCCAAGTATTAGAGCACTTAAATAGTACTGATCCCAATAGTGTCTTCCGATGT  666
            |.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct  593  GGGAGGCAGCTCGTTCTGAAATCCAAGTATTGGAGCACTTGAACAGCACTGACCCCAACAGTGTCTTCCGATGC  666

Query  667  GTCCAGATGCTAGAATGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAACTACTGGGACTTAGTACTTA  740
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  GTCCAGATGCTAGAGTGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAGCTGCTGGGACTTAGTACCTA  740

Query  741  CGATTTCATTAAAGAAAACAGCTTTCTGCCATTTCAAATTGACCACATCAGGCAGATGGCGTATCAGATCTGCC  814
            .|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  741  TGATTTTATTAAAGAAAATAGTTTTCTGCCATTTCAAATTGATCACATCAGGCAAATGGCTTATCAGATCTGCC  814

Query  815  AGTCAATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACCCATACAGATCTGAAGCCTGAAAATATTTTGTTTGTGAAG  888
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  815  AGTCTATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACACACACGGACCTAAAACCTGAAAATATTTTATTTGTGAAG  888

Query  889  TCTGACTATGTAGTCAAATATAATTCTAAAATGAAACGTGATGAACGCACACTGAAAAACACAGATATCAAAGT  962
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCTGACTATGTAGTCAAATACAATTCTAAAATGAAACGAGATGAGCGCACATTGAAAAACACAGATATCAAAGT  962

Query  963  TGTTGACTTTGGAAGTGCAACGTATGATGATGAACATCACAGTACTTTGGTGTCTACCCGGCACTACAGAGCTC  1036
            ||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||||
Sbjct  963  TGTTGATTTTGGAAGTGCAACATATGACGACGAACATCATAGTACTTTGGTGTCCACAAGGCACTACAGGGCTC  1036

Query 1037  CCGAGGTCATTTTGGCTTTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGTTGCATTCTTATTGAATAT  1110
            |.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1037  CAGAGGTCATTTTGGCTCTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGCTGCATTCTTATTGAGTAC  1110

Query 1111  TACCTTGGTTTCACAGTCTTTCAGACTCATGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAACGAATATTAGGACC  1184
            ||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1111  TACCTTGGGTTCACAGTCTTTCAGACCCACGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAGCGGATCTTAGGACC  1184

Query 1185  CATACCACAACACATGATTCAGAAAACAAGAAAACGCAAGTATTTTCACCATAACCAGCTAGATTGGGATGAAC  1258
            |||.|||..|||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1185  CATCCCAGCACATATGATCCAGAAGACAAGGAAACGCAAGTATTTCCACCATAACCAGCTAGATTGGGACGAGC  1258

Query 1259  ACAGTTCTGCTGGTAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAACCGTTGAAGGAATTTATGCTTTGTCATGATGAAGAA  1332
            |.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1259  ATAGTTCAGCTGGGAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAGCCGTTAAAGGAATTTATGCTGTGTCATGACGAAGAG  1332

Query 1333  CATGAGAAACTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTAGAATATGATCCAACTCAAAGAATTACCTTGGATGAAGC  1406
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|...|||.||.||||||||||||||
Sbjct 1333  CATGAGAAGCTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTGGAGTATGACCCAGCGAGAAGGATCACCTTGGATGAAGC  1406

Query 1407  ATTGCAGCATCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAAGAAA  1443
            |||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1407  ATTGCAGCACCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAGGAAA  1443