Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491429
• Subject: XM_011248708.2
• Aligned Length: 1521
• Identities: 1254
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATG-CGGCAT-----------TCCAAAAG----------------------AAC-----TCACTGTCC--TGAT  33
            ||| |.||||           |..|||.|                      |||     ||||  |||  ||.|
Sbjct    1  ATGACAGCATATTCTGGGGAGTGTAAAGGGGTTGGCGGGGGCAGCTGCAGCAACATCTGTCAC--TCCATTGCT  72

Query   34  TG---GGA-----TAGCAGA-------GAAAGCTGGGGACATGAAAGCTATC-------GTGGAAGTCACAAGC  85
            ||   |||     ||||.||       ||   |||||.|..||....||.||       |||   .|| ||.|.
Sbjct   73  TGTCAGGATTATTTAGCTGATTTGTCTGA---CTGGGCAGGTGTCCCCTCTCTCCCCCAGTG---CTC-CATGT  139

Query   86  G----------GAAGAGGAGATCTCATAGTAGCACAC-----AAGAGAACAGGCATTGTAAACCACATCACCAG  144
            |          ||||       ||     |.||||.|     |||||.|||            |.|||| ||| 
Sbjct  140  GCATCCCTCTTGAAG-------CT-----TCGCACTCTGTTGAAGAGGACA------------CTCATC-CCA-  187

Query  145  TTTAAAGAATCTGATTGTCATTATTTAGAAGCAAGGTCCTTGAATGAGCGAGATTATCGGGACCGGAGATACGT  218
                            ||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  188  ----------------GTCACTATTTAGAAGCAAGATGCTTGAATGAGAGAGATTATCGGGACCGGAGATACAT  245

Query  219  TGACGAATACAGGAATGACTACTGTGAAGGATATGTTCCTAGACATTATCACAGAGACATTGAAAGCGGGTATC  292
            |||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||...||.|
Sbjct  246  TGATGAATACAGAAATGACTACTGCGAAGGATATGTTCCAAGACATTACCATAGAGACGTTGAAAGCACTTACC  319

Query  293  GAATCCACTGCAGTAAATCTTCAGTCCGCAGCAGGAGAAGCAGTCCTAAAAGGAAGCGCAATAGACACTGTTCA  366
            |.|||||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||.||||.||
Sbjct  320  GGATCCATTGCAGTAAATCCTCAGTCAGGAGCAGGAGAAGCAGCCCTAAGAGAAAGCGTAATAGACCCTGTGCA  393

Query  367  AGTCATCAGTCACGTTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCT  440
            |||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  394  AGTCATCAGTCGCATTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCT  467

Query  441  GATCTGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTGGGTGAAGGAGCCTTTGGCA  514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  468  GATCTGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTAGGTGAAGGAGCCTTTGGCA  541

Query  515  AAGTTGTAGAGTGCATTGATCATGGCATGGATGGCATGCATGTAGCAGTGAAAATCGTAAAAAATGTAGGCCGT  588
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  542  AAGTTGTAGAGTGCATTGATCACGGCATGGATGGCTTACATGTAGCAGTGAAAATTGTAAAAAATGTAGGCCGT  615

Query  589  TACCGTGAAGCAGCTCGTTCAGAAATCCAAGTATTAGAGCACTTAAATAGTACTGATCCCAATAGTGTCTTCCG  662
            |||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.|||||||||||
Sbjct  616  TACCGGGAGGCAGCTCGTTCTGAAATCCAAGTATTGGAGCACTTGAACAGCACTGACCCCAACAGTGTCTTCCG  689

Query  663  ATGTGTCCAGATGCTAGAATGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAACTACTGGGACTTAGTA  736
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct  690  ATGCGTCCAGATGCTAGAGTGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAGCTGCTGGGACTTAGTA  763

Query  737  CTTACGATTTCATTAAAGAAAACAGCTTTCTGCCATTTCAAATTGACCACATCAGGCAGATGGCGTATCAGATC  810
            |.||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct  764  CCTATGATTTTATTAAAGAAAATAGTTTTCTGCCATTTCAAATTGATCACATCAGGCAAATGGCTTATCAGATC  837

Query  811  TGCCAGTCAATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACCCATACAGATCTGAAGCCTGAAAATATTTTGTTTGT  884
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||
Sbjct  838  TGCCAGTCTATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACACACACGGACCTAAAACCTGAAAATATTTTATTTGT  911

Query  885  GAAGTCTGACTATGTAGTCAAATATAATTCTAAAATGAAACGTGATGAACGCACACTGAAAAACACAGATATCA  958
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  912  GAAGTCTGACTATGTAGTCAAATACAATTCTAAAATGAAACGAGATGAGCGCACATTGAAAAACACAGATATCA  985

Query  959  AAGTTGTTGACTTTGGAAGTGCAACGTATGATGATGAACATCACAGTACTTTGGTGTCTACCCGGCACTACAGA  1032
            ||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.
Sbjct  986  AAGTTGTTGATTTTGGAAGTGCAACATATGACGACGAACATCATAGTACTTTGGTGTCCACAAGGCACTACAGG  1059

Query 1033  GCTCCCGAGGTCATTTTGGCTTTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGTTGCATTCTTATTGA  1106
            |||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1060  GCTCCAGAGGTCATTTTGGCTCTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGCTGCATTCTTATTGA  1133

Query 1107  ATATTACCTTGGTTTCACAGTCTTTCAGACTCATGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAACGAATATTAG  1180
            .||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||
Sbjct 1134  GTACTACCTTGGGTTCACAGTCTTTCAGACCCACGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAGCGGATCTTAG  1207

Query 1181  GACCCATACCACAACACATGATTCAGAAAACAAGAAAACGCAAGTATTTTCACCATAACCAGCTAGATTGGGAT  1254
            |||||||.|||..|||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1208  GACCCATCCCAGCACATATGATCCAGAAGACAAGGAAACGCAAGTATTTCCACCATAACCAGCTAGATTGGGAC  1281

Query 1255  GAACACAGTTCTGCTGGTAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAACCGTTGAAGGAATTTATGCTTTGTCATGATGA  1328
            ||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct 1282  GAGCATAGTTCAGCTGGGAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAGCCGTTAAAGGAATTTATGCTGTGTCATGACGA  1355

Query 1329  AGAACATGAGAAACTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTAGAATATGATCCAACTCAAAGAATTACCTTGGATG  1402
            |||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|...|||.||.||||||||||
Sbjct 1356  AGAGCATGAGAAGCTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTGGAGTATGACCCAGCGAGAAGGATCACCTTGGATG  1429

Query 1403  AAGCATTGCAGCATCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAAGAAA  1443
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1430  AAGCATTGCAGCACCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAGGAAA  1470