Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491429
- Subject:
- XM_011248709.2
- Aligned Length:
- 1443
- Identities:
- 1212
- Gaps:
- 108
Alignment
Query 1 ATGCGGCATTCCAAAAGAACTCACTGTCCTGATTGGGATAGCAGAGAAAGCTGGGGACATGAAAGCTATCGTGG 74
||| .||||.|| ||.|| ||||| |||
Sbjct 1 ATG-TGCATCCC--------------TCTTG----------------AAGCT----------------TCG--- 24
Query 75 AAGTCACAAGCGGAAGAGGAGATCTCATAGTAGCACACAAGAGAACAGGCATTGTAAACCACATCACCAGTTTA 148
||| ||| ||.| |||||.||| |.|||| |||
Sbjct 25 ----CAC---------------TCT----GTTG-----AAGAGGACA------------CTCATC-CCA----- 52
Query 149 AAGAATCTGATTGTCATTATTTAGAAGCAAGGTCCTTGAATGAGCGAGATTATCGGGACCGGAGATACGTTGAC 222
||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.
Sbjct 53 ------------GTCACTATTTAGAAGCAAGATGCTTGAATGAGAGAGATTATCGGGACCGGAGATACATTGAT 114
Query 223 GAATACAGGAATGACTACTGTGAAGGATATGTTCCTAGACATTATCACAGAGACATTGAAAGCGGGTATCGAAT 296
||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||...||.||.||
Sbjct 115 GAATACAGAAATGACTACTGCGAAGGATATGTTCCAAGACATTACCATAGAGACGTTGAAAGCACTTACCGGAT 188
Query 297 CCACTGCAGTAAATCTTCAGTCCGCAGCAGGAGAAGCAGTCCTAAAAGGAAGCGCAATAGACACTGTTCAAGTC 370
|||.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||.||||.||||||
Sbjct 189 CCATTGCAGTAAATCCTCAGTCAGGAGCAGGAGAAGCAGCCCTAAGAGAAAGCGTAATAGACCCTGTGCAAGTC 262
Query 371 ATCAGTCACGTTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATC 444
|||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 ATCAGTCGCATTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATC 336
Query 445 TGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTGGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 TGTCAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTAGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGT 410
Query 519 TGTAGAGTGCATTGATCATGGCATGGATGGCATGCATGTAGCAGTGAAAATCGTAAAAAATGTAGGCCGTTACC 592
||||||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 TGTAGAGTGCATTGATCACGGCATGGATGGCTTACATGTAGCAGTGAAAATTGTAAAAAATGTAGGCCGTTACC 484
Query 593 GTGAAGCAGCTCGTTCAGAAATCCAAGTATTAGAGCACTTAAATAGTACTGATCCCAATAGTGTCTTCCGATGT 666
|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.
Sbjct 485 GGGAGGCAGCTCGTTCTGAAATCCAAGTATTGGAGCACTTGAACAGCACTGACCCCAACAGTGTCTTCCGATGC 558
Query 667 GTCCAGATGCTAGAATGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAACTACTGGGACTTAGTACTTA 740
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 559 GTCCAGATGCTAGAGTGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAGCTGCTGGGACTTAGTACCTA 632
Query 741 CGATTTCATTAAAGAAAACAGCTTTCTGCCATTTCAAATTGACCACATCAGGCAGATGGCGTATCAGATCTGCC 814
.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 633 TGATTTTATTAAAGAAAATAGTTTTCTGCCATTTCAAATTGATCACATCAGGCAAATGGCTTATCAGATCTGCC 706
Query 815 AGTCAATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACCCATACAGATCTGAAGCCTGAAAATATTTTGTTTGTGAAG 888
||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 707 AGTCTATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACACACACGGACCTAAAACCTGAAAATATTTTATTTGTGAAG 780
Query 889 TCTGACTATGTAGTCAAATATAATTCTAAAATGAAACGTGATGAACGCACACTGAAAAACACAGATATCAAAGT 962
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TCTGACTATGTAGTCAAATACAATTCTAAAATGAAACGAGATGAGCGCACATTGAAAAACACAGATATCAAAGT 854
Query 963 TGTTGACTTTGGAAGTGCAACGTATGATGATGAACATCACAGTACTTTGGTGTCTACCCGGCACTACAGAGCTC 1036
||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.||||
Sbjct 855 TGTTGATTTTGGAAGTGCAACATATGACGACGAACATCATAGTACTTTGGTGTCCACAAGGCACTACAGGGCTC 928
Query 1037 CCGAGGTCATTTTGGCTTTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGTTGCATTCTTATTGAATAT 1110
|.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 929 CAGAGGTCATTTTGGCTCTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGCTGCATTCTTATTGAGTAC 1002
Query 1111 TACCTTGGTTTCACAGTCTTTCAGACTCATGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAACGAATATTAGGACC 1184
||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1003 TACCTTGGGTTCACAGTCTTTCAGACCCACGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAGCGGATCTTAGGACC 1076
Query 1185 CATACCACAACACATGATTCAGAAAACAAGAAAACGCAAGTATTTTCACCATAACCAGCTAGATTGGGATGAAC 1258
|||.|||..|||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1077 CATCCCAGCACATATGATCCAGAAGACAAGGAAACGCAAGTATTTCCACCATAACCAGCTAGATTGGGACGAGC 1150
Query 1259 ACAGTTCTGCTGGTAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAACCGTTGAAGGAATTTATGCTTTGTCATGATGAAGAA 1332
|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1151 ATAGTTCAGCTGGGAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAGCCGTTAAAGGAATTTATGCTGTGTCATGACGAAGAG 1224
Query 1333 CATGAGAAACTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTAGAATATGATCCAACTCAAAGAATTACCTTGGATGAAGC 1406
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|...|||.||.||||||||||||||
Sbjct 1225 CATGAGAAGCTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTGGAGTATGACCCAGCGAGAAGGATCACCTTGGATGAAGC 1298
Query 1407 ATTGCAGCATCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAAGAAA 1443
|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1299 ATTGCAGCACCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAGGAAA 1335