Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491429
- Subject:
- XM_017314243.1
- Aligned Length:
- 1588
- Identities:
- 1253
- Gaps:
- 203
Alignment
Query 1 ATGCGGCATTCCAAAAGAACTCACTGTCCTGATTGGGATAGCAGAGAAAGCTGGGGACATGAAAGCTATCGTGG 74
||||||||||..||||
Sbjct 1 ----------------------------------------------------------ATGAAAGCTACAGTGG 16
Query 75 AAGTCACAAGCGGAAGAGGAGATCTCATAGTAGCACACAAGAGAACAGGCATTGTAAACCACATCACCAGTTTA 148
|||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 17 AAGTCACAAACGCAAGAGAAGGTCTCACAGCAGTACTCAGGAGAACAGGCACTGTAAACCACATCATCAGTTTA 90
Query 149 AAGAATCTGATT-------------------------------------------------------------- 160
||||.||.||||
Sbjct 91 AAGACTCGGATTGATGTTCCATTGGGGCTGTTTACCAGATTGCTTTCTAAATTAGCCAGCTGGGGTTACTTTAA 164
Query 161 -------------------------------------------------------------------------- 160
Sbjct 165 AAAACAGGGTCTTTGTGTACAAATCTTTGCCTGTGGCTATTTCCTGAGAGTAGATTCTAAGAAGAGGCATTTTC 238
Query 161 ---------GTCATTATTTAGAAGCAAGGTCCTTGAATGAGCGAGATTATCGGGACCGGAGATACGTTGACGAA 225
||||.||||||||||||||.|.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||.|||
Sbjct 239 AAGTTAAAGGTCACTATTTAGAAGCAAGATGCTTGAATGAGAGAGATTATCGGGACCGGAGATACATTGATGAA 312
Query 226 TACAGGAATGACTACTGTGAAGGATATGTTCCTAGACATTATCACAGAGACATTGAAAGCGGGTATCGAATCCA 299
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||.||||||||...||.||.|||||
Sbjct 313 TACAGAAATGACTACTGCGAAGGATATGTTCCAAGACATTACCATAGAGACGTTGAAAGCACTTACCGGATCCA 386
Query 300 CTGCAGTAAATCTTCAGTCCGCAGCAGGAGAAGCAGTCCTAAAAGGAAGCGCAATAGACACTGTTCAAGTCATC 373
.|||||||||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||.||||.|||||||||
Sbjct 387 TTGCAGTAAATCCTCAGTCAGGAGCAGGAGAAGCAGCCCTAAGAGAAAGCGTAATAGACCCTGTGCAAGTCATC 460
Query 374 AGTCACGTTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATCTGT 447
||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 461 AGTCGCATTCGAAGAGCCACCGAAGGAAAAGATCCAGGAGTATAGAGGATGATGAGGAGGGTCACCTGATCTGT 534
Query 448 CAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTGGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGTTGT 521
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 535 CAAAGTGGAGACGTTCTAAGAGCAAGATATGAAATCGTGGACACTTTAGGTGAAGGAGCCTTTGGCAAAGTTGT 608
Query 522 AGAGTGCATTGATCATGGCATGGATGGCATGCATGTAGCAGTGAAAATCGTAAAAAATGTAGGCCGTTACCGTG 595
|||||||||||||||.||||||||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 609 AGAGTGCATTGATCACGGCATGGATGGCTTACATGTAGCAGTGAAAATTGTAAAAAATGTAGGCCGTTACCGGG 682
Query 596 AAGCAGCTCGTTCAGAAATCCAAGTATTAGAGCACTTAAATAGTACTGATCCCAATAGTGTCTTCCGATGTGTC 669
|.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 683 AGGCAGCTCGTTCTGAAATCCAAGTATTGGAGCACTTGAACAGCACTGACCCCAACAGTGTCTTCCGATGCGTC 756
Query 670 CAGATGCTAGAATGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAACTACTGGGACTTAGTACTTACGA 743
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 757 CAGATGCTAGAGTGGTTTGATCATCATGGTCATGTTTGTATTGTGTTTGAGCTGCTGGGACTTAGTACCTATGA 830
Query 744 TTTCATTAAAGAAAACAGCTTTCTGCCATTTCAAATTGACCACATCAGGCAGATGGCGTATCAGATCTGCCAGT 817
|||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 831 TTTTATTAAAGAAAATAGTTTTCTGCCATTTCAAATTGATCACATCAGGCAAATGGCTTATCAGATCTGCCAGT 904
Query 818 CAATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACCCATACAGATCTGAAGCCTGAAAATATTTTGTTTGTGAAGTCT 891
|.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 905 CTATAAATTTTTTACATCATAATAAATTAACACACACGGACCTAAAACCTGAAAATATTTTATTTGTGAAGTCT 978
Query 892 GACTATGTAGTCAAATATAATTCTAAAATGAAACGTGATGAACGCACACTGAAAAACACAGATATCAAAGTTGT 965
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 979 GACTATGTAGTCAAATACAATTCTAAAATGAAACGAGATGAGCGCACATTGAAAAACACAGATATCAAAGTTGT 1052
Query 966 TGACTTTGGAAGTGCAACGTATGATGATGAACATCACAGTACTTTGGTGTCTACCCGGCACTACAGAGCTCCCG 1039
|||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||.||..||||||||||.|||||.|
Sbjct 1053 TGATTTTGGAAGTGCAACATATGACGACGAACATCATAGTACTTTGGTGTCCACAAGGCACTACAGGGCTCCAG 1126
Query 1040 AGGTCATTTTGGCTTTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGTTGCATTCTTATTGAATATTAC 1113
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1127 AGGTCATTTTGGCTCTAGGTTGGTCTCAGCCTTGTGATGTTTGGAGCATAGGCTGCATTCTTATTGAGTACTAC 1200
Query 1114 CTTGGTTTCACAGTCTTTCAGACTCATGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAACGAATATTAGGACCCAT 1187
|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 1201 CTTGGGTTCACAGTCTTTCAGACCCACGATAGTAAAGAGCACCTGGCAATGATGGAGCGGATCTTAGGACCCAT 1274
Query 1188 ACCACAACACATGATTCAGAAAACAAGAAAACGCAAGTATTTTCACCATAACCAGCTAGATTGGGATGAACACA 1261
.|||..|||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 1275 CCCAGCACATATGATCCAGAAGACAAGGAAACGCAAGTATTTCCACCATAACCAGCTAGATTGGGACGAGCATA 1348
Query 1262 GTTCTGCTGGTAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAACCGTTGAAGGAATTTATGCTTTGTCATGATGAAGAACAT 1335
||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||
Sbjct 1349 GTTCAGCTGGGAGATATGTTAGGAGACGCTGCAAGCCGTTAAAGGAATTTATGCTGTGTCATGACGAAGAGCAT 1422
Query 1336 GAGAAACTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTAGAATATGATCCAACTCAAAGAATTACCTTGGATGAAGCATT 1409
|||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|...|||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1423 GAGAAGCTGTTTGACCTGGTTCGAAGAATGTTGGAGTATGACCCAGCGAGAAGGATCACCTTGGATGAAGCATT 1496
Query 1410 GCAGCATCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAAGAAA 1443
||||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1497 GCAGCACCCTTTCTTTGACTTATTAAAAAGGAAA 1530