Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491512
• Subject: NM_001043354.2
• Aligned Length: 1377
• Identities: 1280
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCGAGCACAAATTGAAGTGATACCATGCAAAATTTGTGGCGATAAGTCCTCTGGGATCCACTACGGAGTCAT  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCGAGCACAAATTGAAGTGATACCATGCAAAATTTGTGGCGATAAATCCTCCGGGATCCACTACGGAGTCAT  74

Query   75  CACATGTGAAGGCTGCAAGGGATTCTTTAGGAGGAGCCAGCAGAACAATGCTTCTTATTCCTGCCCAAGGCAGA  148
            |||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  CACGTGTGAAGGCTGCAAGGGATTCTTCAGGAGGAGCCAGCAGAACAATGCCTCTTACTCCTGCCCAAGGCAGA  148

Query  149  GAAACTGTTTAATTGACAGAACGAACAGAAACCGTTGCCAACACTGCCGACTGCAGAAGTGTCTTGCCCTAGGA  222
            ||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAAACTGTTTAATTGACAGAACCAACAGGAACCGTTGCCAACACTGCCGCCTGCAGAAGTGTCTTGCCCTAGGA  222

Query  223  ATGTCAAGAGATGCTGTGAAGTTTGGGAGGATGTCCAAGAAGCAAAGGGACAGCCTGTATGCTGAGGTGCAGAA  296
            |||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGTCAAGAGATGCTGTAAAGTTCGGGAGGATGTCCAAGAAGCAGCGGGACAGCCTGTATGCTGAGGTGCAGAA  296

Query  297  GCACCAGCAGCGGCTGCAGGAACAGCGGCAGCAGCAGAGTGGGGAGGCAGAAGCCCTTGCCAGGGTGTACAGCA  370
            |||.|||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  297  GCATCAGCAAAGGCTGCAGGAGCAGCGGCAGCAGCAGAGTGGGGAGGCGGAGGCCCTCGCCAGGGTGTACAGCA  370

Query  371  GCAGCATTAGCAACGGCCTGAGCAACCTGAACAACGAGACCAGCGGCACTTATGCCAACGGGCACGTCATTGAC  444
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||||||.|||||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCAGCATTAGCAATGGCCTCAGCAACCTGAACACCGAGACCGGCGGCACATACGCCAACGGGCACGTCATTGAC  444

Query  445  CTGCCCAAGTCTGAGGGTTATTACAACGTCGATTCCGGTCAGCCGTCCCCTGATCAGTCAGGACTTGACATGAC  518
            |||||||||||.||.||||||||||.|.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CTGCCCAAGTCCGAAGGTTATTACAGCATAGATTCCGGTCAGCCGTCTCCCGATCAGTCAGGACTGGACATGAC  518

Query  519  TGGAATCAAACAGATAAAGCAAGAACCTATCTATGACCTCACATCCGTACCCAACTTGTTTACCTATAGCTCTT  592
            |||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGGGATCAAACAGATAAAGCAAGAACCTATCTATGACCTCACATCTGTACCCAACTTGTTTACCTATAGCTCTT  592

Query  593  TCAACAATGGGCAGTTAGCACCAGGGATAACCATGACTGAAATCGACCGAATTGCACAGAACATCATTAAGTCC  666
            |||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCAACAACGGGCAGTTAGCTCCCGGGATAACAATGTCTGAGATCGATCGAATTGCACAGAACATCATTAAGTCC  666

Query  667  CATTTGGAGACATGTCAATACACCATGGAAGAGCTGCACCAGCTGGCGTGGCAGACCCACACCTATGAAGAAAT  740
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  667  CATTTGGAGACATGTCAGTACACCATGGAAGAACTCCATCAGCTGGCATGGCAGACCCACACCTACGAGGAAAT  740

Query  741  TAAAGCATATCAAAGCAAGTCCAGGGAAGCACTGTGGCAACAATGTGCCATCCAGATCACTCACGCCATCCAAT  814
            .||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|
Sbjct  741  CAAGGCGTATCAAAGCAAGTCCAGGGAGGCTCTGTGGCAGCAGTGTGCCATCCAGATCACCCATGCTATCCAGT  814

Query  815  ACGTGGTGGAGTTTGCAAAGCGGATAACAGGCTTCATGGAGCTCTGTCAAAATGATCAAATTCTACTTCTGAAG  888
            |||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||..|||||||||||
Sbjct  815  ACGTGGTGGAGTTCGCCAAGCGGATAACAGGCTTCATGGAGCTGTGTCAGAACGATCAGATCTTACTTCTGAAG  888

Query  889  TCAGGTTGCTTGGAAGTGGTTTTAGTGAGAATGTGCCGTGCCTTCAACCCATTAAACAACACTGTTCTGTTTGA  962
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TCAGGTTGCTTGGAAGTGGTTTTAGTGAGAATGTGTCGTGCCTTCAACCCATTAAACAACACTGTTCTGTTTGA  962

Query  963  AGGAAAATATGGAGGAATGCAAATGTTCAAAGCCTTAGGTTCTGATGACCTAGTGAATGAAGCATTTGACTTTG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGGAAAATATGGAGGAATGCAAATGTTCAAAGCCTTAGGTTCGGATGACCTAGTGAATGAAGCATTTGACTTTG  1036

Query 1037  CAAAGAATTTGTGTTCCTTGCAGCTGACCGAGGAGGAGATCGCTTTGTTCTCATCTGCTGTTCTGATATCTCCA  1110
            |.||||||.|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  CGAAGAATCTGTGTTCCTTGCAGCTGACTGAGGAAGAGATTGCTCTGTTCTCCTCTGCTGTTCTGATATCCCCA  1110

Query 1111  GACCGAGCCTGGCTTATAGAACCAAGGAAAGTCCAGAAGCTTCAGGAAAAAATTTATTTTGCACTTCAACATGT  1184
            ||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1111  GACCGAGCCTGGCTGATCGAACCAAGAAAAGTCCAGAAGCTTCAGGAAAAGATTTATTTTGCACTGCAACATGT  1184

Query 1185  GATTCAGAAGAATCACCTGGATGATGAGACCTTGGCAAAGTTAATAGCCAAGATACCAACCATCACGGCAGTTT  1258
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 1185  GATTCAGAAGAACCACCTGGATGATGAGACCCTGGCAAAGTTAATAGCCAAGATACCAACTATCACGGCAGTCT  1258

Query 1259  GCAACTTGCACGGGGAGAAGCTGCAGGTATTTAAGCAATCTCATCCAGAGATAGTGAATACACTGTTTCCTCCG  1332
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  GCAACTTGCATGGGGAGAAGCTGCAGGTATTTAAGCAGTCTCATCCAGACATAGTGAATACACTGTTTCCTCCA  1332

Query 1333  TTATACAAGGAGCTCTTTAATCCTGACTGTGCCACCGGCTGCAAA  1377
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||..|.|.|||||||
Sbjct 1333  TTGTACAAGGAGCTCTTTAATCCTGACTGTGCTGCGGTCTGCAAA  1377