Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491519
- Subject:
- XM_017316624.1
- Aligned Length:
- 2665
- Identities:
- 1826
- Gaps:
- 659
Alignment
Query 1 ATGGCTTGCCTCCATGAGACCCGAACACCCTCTCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACCCTAAGTGAGGCATC 74
|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1 ATGGCCTGCCTCCATGAAACCCGAACACCCTCCCCTTCCTTTGGGGGCTTTGTGTCTACTCTAAGTGAGGCTTC 74
Query 75 CATGCGCAAGCTGGACCCAGACACTTCTGACTGCACTCCCGAGAAGGACCTGACGCCTACCCA----------- 137
.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 75 TATGCGAAAGCTGGATCCAGACACTTCAGACTGCACCCCCGAGAAAGACCTGACGCCCACCCAATGTGTACTTC 148
Query 138 -------------------------------------------------------------------------- 137
Sbjct 149 GAGATGTTGTGCCTCTCGGTGGGCAGGGTGGAGGAGGACCCAGCCCCTCCCCAGGTGGAGAGCCTCCCCCAGAG 222
Query 138 --------------TGTCCTGCAGCTACATGAGCAGGATGCAGGGGGCCCAGGGGGAGCAGCTGGGTCACCTGA 197
||||||.||||||||||||||||||.||||.||.|||||||||||..|||||||||||||
Sbjct 223 CCTTTTGCCAATAGTGTCCTCCAGCTACATGAGCAGGATACAGGTGGGCCAGGGGGAGCCACTGGGTCACCTGA 296
Query 198 GAGTCGGGCATCCAGAGTTCGAGCTGACGAGGTGCGACTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAGGGCC 271
||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 297 GAGTCGAGCATCTAGAGTTCGAGCTGATGAGGTACGTCTGCAGTGCCAGAGTGGCAGTGGCTTCCTTGAAGGTC 370
Query 272 TCTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACCATGATTGGCAAAGCCTACTCCACTGAGCACAAGCAGCAGCAGGAA 345
|.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 371 TTTTTGGCTGCCTGCGCCCTGTCTGGACAATGATTGGCAAAGCCTACTCCACAGAACACAAGCAACAGCAGGAA 444
Query 346 GACCTTTGGGAGGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACCTGCAGTGGGTGGGCTCAGGGGCCCAGGGTGCTGTCTT 419
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 445 GACCTTTGGGAAGTCCCCTTTGAGGAAATCCTGGACCTGCAGTGGGTAGGCTCAGGGGCTCAGGGTGCTGTTTT 518
Query 420 CCTGGGGCGCTTCCACGGGGAGGAGGTGGCTGTGAAGAAGGTGCGAGACCTCAAAGAAACCGACATCAAGCA-C 492
||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||||||||||| |
Sbjct 519 CCTGGGACGCTTCCACGGGGAGGAGGTAGCTGTGAAGAAGGTTCGAGATCTCAAGGAGACTGACATCAAGCATC 592
Query 493 TTGCGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAAGGGTGTGTGCACCCAGGCTCCCTGCTACTGCATCCT 566
|| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 593 TT-CGAAAGCTGAAGCACCCCAACATCATCACTTTCAAGGGTGTTTGCACACAGGCCCCCTGCTACTGCATCCT 665
Query 567 CATGGAGTTCTGCGCCCAGGGCCAGCTGTATGAGGTACTGCGGGCTGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTACTGG 640
.|||||.||||||||.||.||.|||||.||||||||.||..|.||.|||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 666 TATGGAATTCTGCGCTCAAGGACAGCTATATGAGGTGCTCAGAGCCGGCCGCCCTGTCACCCCCTCCTTGCTGG 739
Query 641 TTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGAACTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGGGATCTCAAG 714
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||
Sbjct 740 TTGACTGGTCCATGGGCATCGCTGGTGGCATGAATTACCTGCACCTGCACAAGATTATCCACAGAGACCTGAAG 813
Query 715 TCACCCAACATGCTAATCACCTACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGA 788
||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 814 TCACCCAACATGCTAATCACATACGACGATGTGGTGAAGATCTCAGATTTTGGCACTTCCAAGGAGCTGAGTGA 887
Query 789 CAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGGACAGTAGCCTGGATGGCCCCTGAGGTGATCCGCAATGAACCTGTGT 862
|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||.|.|||||||||||||
Sbjct 888 CAAGAGCACCAAGATGTCCTTTGCAGGAACAGTAGCCTGGATGGCTCCTGAAGTGATCAGAAATGAACCTGTGT 961
Query 863 CTGAGAAGGTCGACATCTGGTCCTTTGGCGTGGTGCTATGGGAACTGCTGACTGGTGAGATCCCCTACAAAGAC 936
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.
Sbjct 962 CTGAGAAGGTTGACATCTGGTCCTTTGGGGTGGTGCTATGGGAACTACTGACTGGAGAGATTCCCTACAAAGAT 1035
Query 937 GTAGATTCCTCAGCCATTATCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCATCTGCCCGTGCCCTCCAGTTGCCCAGA 1010
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||
Sbjct 1036 GTAGATTCCTCAGCCATCATCTGGGGTGTGGGAAGCAACAGTCTCCACCTGCCTGTACCCTCCAGCTGCCCAGA 1109
Query 1011 TGGTTTCAAGATCCTGCTTCGCCAGTGCTGGAATAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCCTGC 1084
||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1110 TGGTTTTAAAATTCTACTTCGCCAGTGCTGGAACAGCAAACCACGAAATCGCCCATCATTCCGACAGATCTTGC 1183
Query 1085 TGCATCTGGACATTGCCTCAGCTGATGTACTCTCCACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGGCAGAGTGG 1158
||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184 TGCACCTGGACATCGCCTCCGCTGATGTGCTCTCTACACCCCAGGAGACTTACTTTAAGTCCCAGGCAGAGTGG 1257
Query 1159 CGGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAAGATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACT 1232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258 CGGGAAGAAGTAAAACTGCACTTTGAAAAGATTAAGTCAGAAGGGACCTGTCTGCACCGCCTAGAAGAGGAACT 1331
Query 1233 GGTGATGAGGAGGAGGGAGGAGCTCAGACACGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAAAGGAAGCTGGAGAGAG 1306
|||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||
Sbjct 1332 GGTGATGCGGAGAAGGGAGGAGCTCAGACATGCCCTGGACATCAGGGAGCACTATGAACGGAAGTTGGAGAGAG 1405
Query 1307 CCAACAACCTGTATATGGAACTTAATGCCCTCATGTTGCAGCTGGAACTCAAGGAGAGGGAGCTGCTCAGGCGA 1380
|||||||||||||.||||||||.||||||||||||.||||.||.||||||||.||||||||..|||||||||||
Sbjct 1406 CCAACAACCTGTACATGGAACTGAATGCCCTCATGCTGCAACTAGAACTCAAAGAGAGGGAATTGCTCAGGCGA 1479
Query 1381 GAGCAAGCTTTAGAGCGGAGGTGCCCAGGCCTGCTGAAGCCACACCCTTCCCGGGGCCTCCTGCATGGAAACAC 1454
|||||.||||||||..||.||||.||.||.||.||.|||.||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1480 GAGCAGGCTTTAGAAAGGCGGTGTCCTGGTCTACTAAAGTCACACCCTTCTCGGGGCCTCCTACATGGAAACAC 1553
Query 1455 AATGGAGAAGCTTATCAAGAAGAGGAATGTGCCACAGAAGCTGTCACCCCATAGCAAAAGGCCAGATATCCTCA 1528
.|||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1554 TATGGAGAAGCTCATCAAGAAAAGGAACGTGCCACAGAAACTGTCGCCCCACAGCAAAAGGCCAGATATTCTCA 1627
Query 1529 AGACGGAGTCTTTGCTCCCTAAACTAGATGCAGCCCTGAGTGGGGTGGGGCTTCCTGGGTGTCCTAAGGGCCCC 1602
||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1628 AGACAGAGTCGTTGCTACCTAAACTAGATGCAGCCCTAAGTGGGGTGGGGCTTCCTGGGTGTCCTAAGGGCCCC 1701
Query 1603 CCCTCACCAGGACGGAGTCGCCGTGGCAAGACCCGTCACCGCAAGGCCAGCGCCAAGGGGAGCTGTGGGGACCT 1676
||.|||||.|||.|||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1702 CCTTCACCTGGAAGGAGTCGGCGTGGCAAGACCCGTCACCGAAAGGCCAGTGCCAAGGGCAGCTGTGGAGACCT 1775
Query 1677 GCCTGGGCTTCGTACAGCTGTGCCACCCCATGAACCTGGAGGACCAGGAAGCCCAGGGGGCCTAGGAGGGGGAC 1750
|||||||||||||.|||||.|||||||||||||.||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 1776 GCCTGGGCTTCGTGCAGCTTTGCCACCCCATGAGCCTGGAGGACTAGGAAGCCCAGGGGGCCTAGGAGTGGGCC 1849
Query 1751 CCTCAGCCTGGGAGGCCTGCCCTCCCGCCCTCCGTGGGCTTCATCATGACCTCCTGCTCCGCAAAATGTCTTCA 1824
|.|||||.|||||.||.|||||.||.||.||||||||.||.||.||||||||.||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1850 CTTCAGCTTGGGATGCTTGCCCCCCTGCTCTCCGTGGACTCCACCATGACCTTCTACTCCGAAAGATGTCATCA 1923
Query 1825 TCGTCCCCAGACCTGCTGTCAGCAGCACTAGGGTCCCGGGGCCGGGGGGCCACAGGCGGAGCTGGGGATCCTGG 1898
||.||||||||||||||.||||||||.||.||..||||.|||||.|||||.|||||.||||||.||||||||||
Sbjct 1924 TCATCCCCAGACCTGCTATCAGCAGCGCTGGGAGCCCGAGGCCGAGGGGCTACAGGGGGAGCTCGGGATCCTGG 1997
Query 1899 CTCACCACCTCCGGCCCGGGGTGACACCCCACCAAGTGAGGGCTCAGCCCCTGGCTCCACCAGCCCAGATTCAC 1972
||||||||||||..|||.|||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1998 CTCACCACCTCCACCCCAGGGCGATACTCCTCCAAGTGAGGGATCAGCTCCTGGTTCCACCAGCCCAGATTCGC 2071
Query 1973 CTGGGGGAGCCAAAGGGGAACCACCTCCTCC-------CCTC-------------------------------- 2007
||||||||||.|||||||||||.|||||.|| |||.
Sbjct 2072 CTGGGGGAGCTAAAGGGGAACCCCCTCCACCAGTAGGGCCTGGAGAAGGTGTGGGGCTGCTGGGAACTGGAAGG 2145
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2146 GAAGGGACTGCAGGCCGGGGAGGAAACCGGGCTGGGTCCCAGCACTTGACCCCCGCTGCGCTGCTGTACAGGGC 2219
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2220 TGCTGTGACTCGAAGTCAGAAACGTGGTATCTCATCTGAAGAAGAAGAAGGAGAGGTAGACAGTGAAGTAGAGC 2293
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2294 TACCCCCAAGTCAAAGGTGGCCTCAGGGCCCGAACATGCGTCAGTCACTATCTACATTCAGCTCAGAGAACCCA 2367
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2368 TCAGATGTGGAGGAAGGTACAGCTAGTGAGCCTTCCCCAAGTGGCACACCAGAAGTTGGCAGTACCAACACTGA 2441
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2442 TGAGCGACCAGATGAACGATCTGATGACATGTGCTCACAGGGCTCAGAAATTCCACTGGACCTACCTACTTCAG 2515
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2516 AGGTGGTCCCTGAACGTGAAGCCAGCTCCTTGCCCATGCAACACCAGGATGGCCAGGGCCCCAATCCTGAAGAC 2589
Query 2008 -------------------------------------------------------------------------- 2007
Sbjct 2590 TCAGACTGTGACAGCACTGAATTGGACAACTCCAACAGCATTGATGCCTTGCGGCCCCCAGCCTCCCTTCCTCC 2663
Query 2008 - 2007
Sbjct 2664 A 2664
