Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491523
- Subject:
- XM_024454306.1
- Aligned Length:
- 4071
- Identities:
- 3029
- Gaps:
- 1041
Alignment
Query 1 ATGGCGGACACCGACCTGTTCATGGAATGTGAGGAGGAGGAGTTGGAGCCATGGCAGAAAATCAGTGATGTCAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TGAGGACTCTGTAGTTGAAGATTATAATTCAGTGGATAAAACTACCACAGCTGGCAATCCTTTGGTCCAGCAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 GTGGACAGCCACTCATCCTGACCCAGAATCCAGCCCCAGGTCTGGGCACAATGGTTACTCAACCAGTATTGAGG 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 CCTGTTCAGGTCATGCAGAATGCCAATCATGTGACTAGTTCCCCTGTGGCCTCACAACCAATATTTATCACTAC 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 GCAGGGATTTCCTGTAAGGAATGTCCGGCCTGTACAAAATGCAATGAATCAGGTTGGGATTGTGCTGAACGTAC 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AGCAAGGCCAAACGGTTAGACCAATTACACTAGTTCCAGCCCCAGGTACCCAGTTTGTTAAGCCGACAGTTGGA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 GTTCCACAAGTGTTCTCCCAGATGACCCCTGTGAGGCCAGGCTCCACAATGCCTGTGAGGCCCACCACCAACAC 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 CTTCACCACCGTCATCCCGGCCACTCTTACCATTCGAAGCACCGTCCCACAGTCCCAGTCCCAGCAGACCAAGT 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 CCACTCCCAGCACTTCTACCACTCCCACTGCCACACAGCCAACCTCACTGGGGCAACTAGCTGTTCAGTCTCCA 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GGCCAGTCAAACCAGACCACGAATCCCAAGCTAGCTCCCTCCTTCCCCTCTCCACCTGCAGTGAGCATTGCCAG 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 CTTTGTCACTGTGAAGCGACCTGGTGTTACAGGCGAAAATAGCAATGAAGTGGCCAAATTGGTGAATACCCTTA 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 ACACCATCCCTTCCCTGGGCCAGAGTCCTGGGCCAGTGGTGGTGTCCAACAACAGCTCTGCTCATGGCTCTCAA 888
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 889 AGAACCAGCGGACCTGAGTCTTCAATGAAAGTGACCTCTTCCATCCCAGTATTTGACCTCCAGGATGGTGGACG 962
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 963 GAAAATATGTCCACGATGTAATGCTCAATTTCGTGTTACTGAAGCTTTGAGAGGTCACATGTGTTACTGTTGCC 1036
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 1037 CAGAAATGGTTGAATACCAGAAGAAAGGAAAGTCCCTGGATTCAGAACCCAGTGTCCCATCAGCAGCAAAGCCC 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----ATGGTTGAATACCAGAAGAAAGGAAAGTCCCTGGATTCAGAACCCAGTGTCCCATCAGCAGCAAAGCCC 69
Query 1111 CCATCCCCTGAGAAAACAGCTCCTGTTGCTTCCACACCCTCTTCTACACCTATTCCTGCTCTGTCACCGCCTAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 70 CCATCCCCTGAGAAAACAGCTCCTGTTGCTTCCACACCCTCTTCTACACCTATTCCTGCTCTGTCACCGCCTAC 143
Query 1185 CAAAGTACCAGAACCAAATGAGAACGTGGGCGATGCCGTCCAGACCAAACTCATTATGCTTGTAGATGACTTCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 144 CAAAGTACCAGAACCAAATGAGAACGTGGGCGATGCCGTCCAGACCAAACTCATTATGCTTGTAGATGACTTCT 217
Query 1259 ACTATGGACGGGATGGTGGCAAAGTAGCCCAGCTCACAAATTTCCCTAAGGTCGCCACATCTTTCCGATGCCCA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 218 ACTATGGACGGGATGGTGGCAAAGTAGCCCAGCTCACAAATTTCCCTAAGGTCGCCACATCTTTCCGATGCCCA 291
Query 1333 CATTGTACCAAAAGGCTAAAAAACAATATTCGATTCATGAACCATATGAAACACCACGTAGAACTCGATCAGCA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 292 CATTGTACCAAAAGGCTAAAAAACAATATTCGATTCATGAACCATATGAAACACCACGTAGAACTCGATCAGCA 365
Query 1407 GAACGGTGAGGTAGATGGTCACACTATCTGCCAGCACTGTTACCGCCAGTTTTCCACTCCCTTCCAGCTTCAGT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 366 GAACGGTGAGGTAGATGGTCACACTATCTGCCAGCACTGTTACCGCCAGTTTTCCACTCCCTTCCAGCTTCAGT 439
Query 1481 GCCACTTGGAAAATGTTCATAGTCCCTATGAATCTACTACCAAGTGCAAGATCTGTGAATGGGCGTTTGAAAGT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 440 GCCACTTGGAAAATGTTCATAGTCCCTATGAATCTACTACCAAGTGCAAGATCTGTGAATGGGCGTTTGAAAGT 513
Query 1555 GAGCCACTATTTCTCCAGCATATGAAGGATACTCATAAGCCTGGAGAGATGCCTTATGTTTGCCAGGTGTGTCA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 GAGCCACTATTTCTCCAGCATATGAAGGATACTCATAAGCCTGGAGAGATGCCTTATGTTTGCCAGGTGTGTCA 587
Query 1629 ATATCGCTCCTCACTCTACTCTGAGGTAGATGTCCATTTTCGGATGATCCATGAGGATACCCGGCATCTGCTCT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 588 ATATCGCTCCTCACTCTACTCTGAGGTAGATGTCCATTTTCGGATGATCCATGAGGATACCCGGCATCTGCTCT 661
Query 1703 GCCCTTATTGCCTGAAGGTCTTCAAAAATGGCAATGCATTCCAACAGCATTACATGAGGCACCAGAAGAGAAAT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 662 GCCCTTATTGCCTGAAGGTCTTCAAAAATGGCAATGCATTCCAACAGCATTACATGAGGCACCAGAAGAGAAAT 735
Query 1777 GTTTATCACTGCAACAAATGCCGGCTGCAGTTTCTCTTTGCCAAGGACAAAATTGAACACAAGCTTCAACACCA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 736 GTTTATCACTGCAACAAATGCCGGCTGCAGTTTCTCTTTGCCAAGGACAAAATTGAACACAAGCTTCAACACCA 809
Query 1851 TAAAACCTTCCGTAAACCCAAGCAGCTGGAGGGCTTGAAACCAGGCACCAAGGTGACAATCCGGGCTTCCCGAG 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 810 TAAAACCTTCCGTAAACCCAAGCAGCTGGAGGGCTTGAAACCAGGCACCAAGGTGACAATCCGGGCTTCCCGAG 883
Query 1925 GGCAGCCACGAACTGTTCCTGTATCCTCTAATGATACACCTCCCAGCGCCTTGCAGGAGGCAGCACCGCTGACC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 884 GGCAGCCACGAACTGTTCCTGTATCCTCTAATGATACACCTCCCAGCGCCTTGCAGGAGGCAGCACCGCTGACC 957
Query 1999 TCCTCAATGGACCCTCTGCCTGTCTTCCTTTATCCCCCTGTCCAGCGCAGCATCCAGAAGAGAGCTGTTAGGAA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 958 TCCTCAATGGACCCTCTGCCTGTCTTCCTTTATCCCCCTGTCCAGCGCAGCATCCAGAAGAGAGCTGTTAGGAA 1031
Query 2073 AATGAGTGTCATGGGCCGGCAGACATGCCTGGAGTGCAGCTTCGAGATCCCAGACTTCCCTAATCATTTCCCTA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1032 AATGAGTGTCATGGGCCGGCAGACATGCCTGGAGTGCAGCTTCGAGATCCCAGACTTCCCTAATCATTTCCCTA 1105
Query 2147 CTTACGTACACTGCTCTCTGTGTCGCTATAGCACCTGCTGTTCTCGAGCTTATGCCAACCACATGATCAACAAT 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 CTTACGTACACTGCTCTCTGTGTCGCTATAGCACCTGCTGTTCTCGAGCTTATGCCAACCACATGATCAACAAT 1179
Query 2221 CATGTTCCACGGAAGAGCCCCAAGTATTTGGCTTTGTTTAAAAATTCTGTGAGTGGAATCAAGCTGGCCTGCAC 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1180 CATGTTCCACGGAAGAGCCCCAAGTATTTGGCTTTGTTTAAAAATTCTGTGAGTGGAATCAAGCTGGCCTGCAC 1253
Query 2295 TTCATGTACCTTTGTTACCTCTGTGGGCGATGCTATGGCCAAGCATTTGGTATTCAACCCCTCTCACAGATCCA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1254 TTCATGTACCTTTGTTACCTCTGTGGGCGATGCTATGGCCAAGCATTTGGTATTCAACCCCTCTCACAGATCCA 1327
Query 2369 GCAGCATCCTGCCACGGGGACTCACTTGGATAGCTCACTCAAGGCATGGCCAGACTCGTGACCGAGTGCATGAC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1328 GCAGCATCCTGCCACGGGGACTCACTTGGATAGCTCACTCAAGGCATGGCCAGACTCGTGACCGAGTGCATGAC 1401
Query 2443 CGGAACGTGAAGAATATGTACCCTCCTCCTTCCTTCCCCACTAACAAAGCTGCCACTGTGAAATCTGCGGGGGC 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1402 CGGAACGTGAAGAATATGTACCCTCCTCCTTCCTTCCCCACTAACAAAGCTGCCACTGTGAAATCTGCGGGGGC 1475
Query 2517 CACCCCAGCTGAGCCTGAAGAGCTACTAACTCCCTTAGCCCCAGCACTCCCATCACCAGCCTCAACTGCAACCC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1476 CACCCCAGCTGAGCCTGAAGAGCTACTAACTCCCTTAGCCCCAGCACTCCCATCACCAGCCTCAACTGCAACCC 1549
Query 2591 CACCACCAACCCCCACTCACCCGCAGGCTTTAGCCCTTCCACCGCTGGCTACAGAGGGAGCCGAATGTCTGAAT 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1550 CACCACCAACCCCCACTCACCCGCAGGCTTTAGCCCTTCCACCGCTGGCTACAGAGGGAGCCGAATGTCTGAAT 1623
Query 2665 GTTGATGATCAGGATGAAGGGAGCCCAGTCACCCAAGAACCTGAGCTAGCATCAGGTGGTGGTGGTAGTGGTGG 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1624 GTTGATGATCAGGATGAAGGGAGCCCAGTCACCCAAGAACCTGAGCTAGCATCAGGTGGTGGTGGTAGTGGTGG 1697
Query 2739 AGTTGGCAAAAAGGAGCAGCTGTCTGTGAAGAAGCTTCGAGTAGTACTGTTTGCTCTATGCTGCAATACAGAAC 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1698 AGTTGGCAAAAAGGAGCAGCTGTCTGTGAAGAAGCTTCGAGTAGTACTGTTTGCTCTATGCTGCAATACAGAAC 1771
Query 2813 AGGCAGCTGAACACTTCCGAAATCCCCAGCGACGTATTCGCCGTTGGCTTCGACGTTTCCAGGCCTCCCAGGGG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1772 AGGCAGCTGAACACTTCCGAAATCCCCAGCGACGTATTCGCCGTTGGCTTCGACGTTTCCAGGCCTCCCAGGGG 1845
Query 2887 GAGAATCTAGAGGGCAAATATCTGAGCTTTGAGGCAGAAGAGAAACTGGCTGAGTGGGTGCTAACCCAGCGCGA 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1846 GAGAATCTAGAGGGCAAATATCTGAGCTTTGAGGCAGAAGAGAAACTGGCTGAGTGGGTGCTAACCCAGCGCGA 1919
Query 2961 ACAACAGCTACCTGTAAATGAGGAGACCTTGTTCCAGAAGGCCACCAAAATAGGACGTTCTTTGGAAGGGGGGT 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1920 ACAACAGCTACCTGTAAATGAGGAGACCTTGTTCCAGAAGGCCACCAAAATAGGACGTTCTTTGGAAGGGGGGT 1993
Query 3035 TTAAGATCTCCTATGAGTGGGCTGTGCGTTTCATGCTGCGGCACCACCTGACTCCCCATGCCCGGCGAGCTGTG 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1994 TTAAGATCTCCTATGAGTGGGCTGTGCGTTTCATGCTGCGGCACCACCTGACTCCCCATGCCCGGCGAGCTGTG 2067
Query 3109 GCCCACACCCTACCTAAGGATGTAGCAGAGAATGCAGGACTCTTCATTGATTTTGTACAACGGCAGATTCACAA 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2068 GCCCACACCCTACCTAAGGATGTAGCAGAGAATGCAGGACTCTTCATTGATTTTGTACAACGGCAGATTCACAA 2141
Query 3183 CCAGGACTTACCCTTGTCTATGATTGTGGCTATTGATGAGATCTCTTTGTTCCTGGATACAGAGGTGCTGAGCA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2142 CCAGGACTTACCCTTGTCTATGATTGTGGCTATTGATGAGATCTCTTTGTTCCTGGATACAGAGGTGCTGAGCA 2215
Query 3257 GTGATGATCGAAAGGAGAATGCCCTGCAGACAGTGGGCACAGGGGAACCTTGGTGTGATGTAGTCCTAGCCATT 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2216 GTGATGATCGAAAGGAGAATGCCCTGCAGACAGTGGGCACAGGGGAACCTTGGTGTGATGTAGTCCTAGCCATT 2289
Query 3331 CTGGCAGATGGCACTGTCCTTCCCACCCTGGTTTTCTACAGAGGGCAGATGGATCAGCCTGCTAACATGCCAGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2290 CTGGCAGATGGCACTGTCCTTCCCACCCTGGTTTTCTACAGAGGGCAGATGGATCAGCCTGCTAACATGCCAGA 2363
Query 3405 CTCCATATTGCTAGAGGCAAAGGAGAGTGGCTACAGTGATGACGAGATCATGGAGCTGTGGTCAACTCGAGTGT 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2364 CTCCATATTGCTAGAGGCAAAGGAGAGTGGCTACAGTGATGACGAGATCATGGAGCTGTGGTCAACTCGAGTGT 2437
Query 3479 GGCAGAAGCACACAGCTTGCCAGCGCAGCAAAGGCATGCTTGTGATGGACTGTCATCGCACTCACTTGTCAGAA 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2438 GGCAGAAGCACACAGCTTGCCAGCGCAGCAAAGGCATGCTTGTGATGGACTGTCATCGCACTCACTTGTCAGAA 2511
Query 3553 GAGGTACTGGCTATGCTTAGTGCCTCTAGCACTTTGCCTGCAGTGGTCCCAGCAGGCTGTAGCTCCAAAATTCA 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2512 GAGGTACTGGCTATGCTTAGTGCCTCTAGCACTTTGCCTGCAGTGGTCCCAGCAGGCTGTAGCTCCAAAATTCA 2585
Query 3627 GCCATTAGATGTATGCATCAAAAGAACTGTCAAGAACTTCCTGCATAAAAAATGGAAGGAACAGGCTCGGGAAA 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2586 GCCATTAGATGTATGCATCAAAAGAACTGTCAAGAACTTCCTGCATAAAAAATGGAAGGAACAGGCTCGGGAAA 2659
Query 3701 TGGCAGATACTGCATGTGATTCTGATGTCCTGCTTCAGCTGGTGCTTGTCTGGCTGGGTGAAGTGCTAGGTGTC 3774
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2660 TGGCAGATACTGCATGTGATTCTGATGTCCTGCTTCAGCTGGTGCTTGTCTGGCTGGGTGAAGTGCTAGGTGTC 2733
Query 3775 ATTGGGGACTGTCCAGAGCTAGTTCAGCGCTCCTTCCTGGTGGCTAGTGTTCTGCCTGGCCCCGATGGCAACAT 3848
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2734 ATTGGGGACTGTCCAGAGCTAGTTCAGCGCTCCTTCCTGGTGGCTAGTGTTCTGCCTGGCCCCGATGGCAACAT 2807
Query 3849 TAACTCACCTACAAGAAATGCTGACATGCAGGAGGAGCTAATTGCCTCCCTAGAGGAGCAACTGAAGCTGAGTG 3922
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2808 TAACTCACCTACAAGAAATGCTGACATGCAGGAGGAGCTAATTGCCTCCCTAGAGGAGCAACTGAAGCTGAGTG 2881
Query 3923 GGGAACATTCTGAGTCTTCCACGCCACGACCCAGATCATCTCCTGAAGAGACAATTGAGCCTGAAAGTCTTCAC 3996
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2882 GGGAACATTCTGAGTCTTCCACTCCACGACCCAGATCATCTCCTGAAGAGACAATTGAGCCTGAAAGTCTTCAC 2955
Query 3997 CAGCTCTTTGAGGGTGAAAGTGAGACCGAGTCTTTCTATGGCTTTGAAGAAGCTGACCTAGATCTGATGGAGAT 4070
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2956 CAGCTCTTTGAGGGTGAAAGTGAGACCGAGTCTTTCTATGGCTTTGAAGAAGCTGACCTAGATCTGATGGAGAT 3029
Query 4071 T 4071
|
Sbjct 3030 T 3030
