Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491537
- Subject:
- NR_003573.1
- Aligned Length:
- 1322
- Identities:
- 1035
- Gaps:
- 263
Alignment
Query 1 -AT---GGGCCGC---CAGCTAGCGGGGTGCGGAGACGCTGGGAAGAAGGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTC 67
|| |||.||| |||||..|||.|..||| |.| .|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 CATTTGGGGACGCTCTCAGCTCTCGGCGCACGG---CCC---------AGCTTCCTTCAAAATGTCTACTGTTC 62
Query 68 ACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCC 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 ACGAAATCCTGTGCAAGCTCAGCTTGGAGGGTGATCACTCTACACCCCCAAGTGCATATGGGTCTGTCAAAGCC 136
Query 142 TATACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGT 215
||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 TACACTAACTTTGATGCTGAGCGGGATGCTTTGAACATTGAAACAGCCATCAAGACCAAAGGTGTGGATGAGGT 210
Query 216 CACCATTGTCAACATTTTGACCAACCGCAGCAATGCACAGAGACAGGATATTGCCTTCGCCTACCAGAGAAGGA 289
||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 211 CACCATTGTCAACATTGTGACCAACCGCGACAATGCACAGAGACAGGATATTGTCTTCTCCTACCAGAGAAGGA 284
Query 290 CCAAAAAGGAACTTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTG 363
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CCAAAAAGGAACTTGCATCAGCACTGAAGTCAGCCTTATCTGGCCACCTGGAGACGGTGATTTTGGGCCTATTG 358
Query 364 AAGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTGGGAACCGACGAGGACTCTCT 437
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AAGACACCTGCTCAGTATGACGCTTCTGAGCTAAAAGCTTCCATGAAGGGGCTAGGAACCGACGAGGACTCTCT 432
Query 438 CATTGAGATCATCTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA 511
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 CATTGAGATCATCTGCTCCAGAACCAACCAGGAGCTGCAGGAAATTAACAGAGTCTACAAGGAAATGTACAAGA 506
Query 512 CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 CTGATCTGGAGAAGGACATTATTTCGGACACATCTGGTGACTTCCGCAAGCTGATGGTTGCCCTGGCAAAGGGT 580
Query 586 AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCTCGGGATCTCTATGACGCTGG 659
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 581 AGAAGAGCAGAGGATGGCTCTGTCATTGATTATGAACTGATTGACCAAGATGCCCAGGATCTCTATGACGCTGG 654
Query 660 AGTGAAGAGGAAAGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGA 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 AGTGAAGAGGAAAGGAACTGATGTTCCCAAGTGGATCAGCATCATGACCGAGCGGAGCGTGCCCCACCTCCAGA 728
Query 734 AAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGAC 807
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 AAGTATTTGATAGGTACAAGAGTTACAGCCCTTATGACATGTTGGAAAGCATCAGGAAAGAGGTTAAAGGAGAC 802
Query 808 CTGGAAAATGCTTTCCTGAACCTGGTTCAGTGCATTCAGAACAAGCCCCTGTATTTTGCTGATCGGCTGTATGA 881
||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||.||
Sbjct 803 CTGGAAAATGCTTTCCTGAACCTGGTCCAGCGCATTCAGAACAAGCCCTTGTATTTTGCTGATCAGCTGTACGA 876
Query 882 CTCCATGAAGGGCAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGT 955
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 CTCCATGAAGGGCAAGGGGACGCGAGATAAGGTCCTGATCAGAATCATGGTCTCCCGCAGTGAAGTGGACATGT 950
Query 956 TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTATATCCAGCAAGACACTAAGGGC 1029
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 951 TGAAAATTAGGTCTGAATTCAAGAGAAAGTACGGCAAGTCCCTGTACTATTACATCCAGCAAGACACTAAGGGC 1024
Query 1030 GACTACCAGAAAGCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGATGAC-------------------------------- 1071
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1025 GACTACCAGAAAGCGCTGCTGTACCTGTGTGGTGGAGACGACTGAAGCCCGACACAGCCTGAGCGTCCAGAAAT 1098
Query 1072 -------------------------------------------------------------------------- 1071
Sbjct 1099 GGTGCTCACCATGCTTCCAGCTAACAGGTCTACTAAACATACAAAAGTTTAGCCGGGCGTGGTGGCGCTCGCCT 1172
Query 1072 -------------------------------------------------------------------------- 1071
Sbjct 1173 GTAGTCCCAGCTAGTCCGGAGGCTGAGGCAGGAGAATGGCTTGAACCCGGAAGGCAGAGGTTACAGTGAGCCGA 1246
Query 1072 ---------------------------------------------------------------- 1071
Sbjct 1247 GATCATGCCACTGCACTCCAGCCTGGGCAACAGAGCTAGACTCTGTCTCTAAATAAATAAATAA 1310