Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491548
- Subject:
- XM_006524194.2
- Aligned Length:
- 2716
- Identities:
- 2341
- Gaps:
- 88
Alignment
Query 1 ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG 74
||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG 74
Query 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 75 CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG 148
Query 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT 222
|||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 149 AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT 222
Query 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 223 GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA 296
Query 297 GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT 370
|||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 297 GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT 370
Query 371 TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT 444
|.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 371 TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT 444
Query 445 CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG 518
||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 445 CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG 518
Query 519 CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT 592
.||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 519 AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT 592
Query 593 GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA 666
||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct 593 GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA 666
Query 667 TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA 740
||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct 667 TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA 740
Query 741 TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT 814
|||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct 741 TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT 814
Query 815 TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT 888
||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 815 TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA 888
Query 889 TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA 962
|||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 889 TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA 962
Query 963 CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA 1036
.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 963 TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA 1036
Query 1037 CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA 1110
||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGAGCCACATCACGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTCGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA 1110
Query 1111 TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAA------ 1178
||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||
Sbjct 1111 TCTAATCTGGATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAACTG 1184
Query 1179 ---------------------------GAGTCTTCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACG 1225
|||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1185 TATTCTATATAACGAGTCATTGGCAAGGAGTCTTCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCG-------- 1250
Query 1226 TCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATGATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCT 1299
.|||||..|||||||||||.|.||.|||
Sbjct 1251 ----------------------------------------------TTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCT 1278
Query 1300 CCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATACCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAAC 1373
|||.||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||
Sbjct 1279 CCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATACCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAAC 1352
Query 1374 AATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGCAAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGAT 1447
||||||||||||||||...|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1353 AATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGCAAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGT 1426
Query 1448 TACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATGGAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCA 1521
||||.|||||.||.||||.||..||||||||||||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1427 TACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATGGAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCA 1500
Query 1522 TTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTAT 1595
||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.||
Sbjct 1501 TTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACAAACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAAT 1574
Query 1596 TAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCATATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCT 1669
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1575 TAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCATATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCT 1648
Query 1670 TGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACCCAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAA 1743
|||||||.||||||||..||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.
Sbjct 1649 TGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACCCAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAG 1722
Query 1744 GGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATG 1817
||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct 1723 GGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCATGAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTG 1796
Query 1818 GTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAATATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAG 1891
|.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|.||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct 1797 GCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGTCTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGG 1870
Query 1892 GGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGTTACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATA 1965
|||||||.||||||||||||||.|||||.|||.|.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.|||||
Sbjct 1871 GGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGCTTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATA 1944
Query 1966 CTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATCCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAA 2039
|||||.|||||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 1945 CTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATTCCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAA 2018
Query 2040 TCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGCACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAA 2113
||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 2019 TCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGCGCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAA 2092
Query 2114 TGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATTTTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTA 2187
|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.
Sbjct 2093 TGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGTTTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTG 2166
Query 2188 GTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTTGGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATT 2261
||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2167 GTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTTGGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTT 2240
Query 2262 TGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATGGTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATG 2335
|||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.||||||.||||.|||||||..||.|||||||
Sbjct 2241 TGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTGGTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATG 2314
Query 2336 TAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTATGCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGA 2409
|.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 2315 TGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGTGCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGG 2388
Query 2410 TTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGA 2483
||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 2389 TTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTCACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGA 2462
Query 2484 CAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCAAGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTT 2557
||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2463 CAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCAAGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTT 2536
Query 2558 CAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGATCTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAAC 2631
||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2537 CAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGATCTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAAC 2610
Query 2632 CCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCGGGTCATGAAAACAGTTACG 2683
||.|||||||||||||||||.||||||.||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 2611 CCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCGGGTCACGAAAACAGCTAC- 2661