Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491548
• Subject: XM_006524197.2
• Aligned Length: 2683
• Identities: 2324
• Gaps: 64

Alignment

Query    1  ATGAACCCCGGCTTCGATTTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATTCAGCGCATCGGCAGCGG  74
            ||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAACCCGGGCTTCGATCTGTCCCGCCGGAACCCGCAGGAGGACTTCGAGCTGATCCAGCGCATCGGCAGCGG  74

Query   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTTAACACTGGTGAATTAGCAGCAATTAAAGTAATAAAATTGG  148
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct   75  CACCTACGGCGACGTCTACAAGGCACGGAATGTCAACACTGGAGAATTAGCAGCAATTAAAGTGATAAAATTGG  148

Query  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCAGTTGTGCAGCAAGAAATTATCATGATGAAAGACTGTAAACACCCAAATATTGTT  222
            |||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  149  AACCAGGAGAAGACTTTGCGGTTGTACAGCAAGAAATCATTATGATGAAAGACTGCAAACACCCAAACATTGTT  222

Query  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAGCTTTGGATTTGCATGGAGTTTTGTGGAGGTGGTTCTTTACA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  223  GCTTATTTTGGAAGCTATCTCAGGCGAGATAAACTTTGGATTTGCATGGAATTCTGTGGAGGTGGCTCTTTACA  296

Query  297  GGATATTTATCACGTAACTGGACCTCTGTCAGAACTGCAAATTGCATATGTTAGCAGAGAAACACTGCAGGGAT  370
            |||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct  297  GGACATATATCATGTAACTGGACCCCTTTCAGAACTGCAGATTGCATATGTTAGCAGAGAAACTCTACAGGGAT  370

Query  371  TATATTATCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACAGAGATATAAAGGGAGCTAACATTCTATTAACGGATAATGGT  444
            |.|||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||..||||||||||||||
Sbjct  371  TGTATTACCTTCACAGTAAAGGAAAAATGCACCGAGATATAAAGGGCGCTAACATTCTCCTAACGGATAATGGT  444

Query  445  CATGTGAAATTGGCTGATTTTGGAGTATCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCTTTCATTGG  518
            ||.||||||.|.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CACGTGAAACTAGCTGATTTTGGAGTTTCTGCACAGATAACAGCTACAATTGCCAAACGGAAGTCCTTCATTGG  518

Query  519  CACACCATATTGGATGGCTCCAGAAGTTGCAGCTGTTGAGAGGAAGGGGGGTTACAATCAACTCTGTGATCTCT  592
            .||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  AACGCCATATTGGATGGCCCCAGAAGTCGCGGCTGTTGAGAGGAAAGGCGGGTACAATCAACTGTGTGACCTCT  592

Query  593  GGGCAGTGGGAATCACTGCCATAGAACTTGCAGAGCTTCAGCCTCCTATGTTTGACTTACACCCAATGAGAGCA  666
            ||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||.|||||||||.|.|||||.|||||.|||
Sbjct  593  GGGCGGTGGGCATCACTGCCATCGAGCTGGCGGAGCTCCAGCCACCCATGTTTGACCTTCACCCGATGAGGGCA  666

Query  667  TTATTTCTAATGACAAAAAGCAATTTTCAGCCTCCTAAACTAAAGGATAAAATGAAATGGTCAAATAGTTTTCA  740
            ||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||..||||.||||||||||||||.||
Sbjct  667  TTGTTTCTAATGACAAAAAGCAATTTCCAGCCTCCTAAACTAAAAGATAAGTTGAAGTGGTCAAATAGTTTCCA  740

Query  741  TCACTTTGTGAAAATGGCACTTACCAAAAATCCGAAAAAAAGACCTACTGCTGAAAAATTATTACAGCATCCTT  814
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||.||.||||||||.|.|||.|||||..|.|||||||||||.|
Sbjct  741  TCATTTTGTGAAGATGGCTCTTACCAAAAATCCAAAGAAAAGACCCAATGCAGAAAAGCTGTTACAGCATCCCT  814

Query  815  TTGTAACACAACATTTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGCTGTTGGATAAAGTAAATAATCCAGATCATTCCACT  888
            ||||.|||||.|.|.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  815  TTGTCACACAGCCTCTGACACGGTCTTTGGCAATCGAGTTGCTGGACAAAGTGAATAATCCAGACCATTCCACA  888

Query  889  TACCATGATTTCGATGATGATGATCCTGAGCCTCTTGTTGCTGTACCACATAGAATTCACTCAACAAGTAGAAA  962
            |||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  TACCACGATTTTGATGATGATGACCCAGAGCCTCTTGTTGCCGTACCACATAGAATTCCTTCAACGAGTAGAAA  962

Query  963  CGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAACCTTTGGCCAAGTGAAATTTGATCCACCCTTAAGAAAGGAGA  1036
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||.|||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct  963  TGTGAGAGAAGAAAAAACACGCTCAGAGATAAACTTTGGCCAGGTAAAATTTGATCCGCCCTTAAGGAAGGAGA  1036

Query 1037  CAGAACCACATCATGAACTTCCCGACAGTGATGGTTTTTTGGACAGTTCAGAAGAAATATACTACACTGCAAGA  1110
            ||||.||||||||.||||||                                                      
Sbjct 1037  CAGAGCCACATCACGAACTT------------------------------------------------------  1056

Query 1111  TCTAATCTGGATCTGCAACTGGAATATGGACAAGGACACCAAGGTGGTTACTTTTTAGGTGCAAACAAGAGTCT  1184
                     |||||||||||.||.||.|||||||||||||||.|...||.|||.|||||||..|||||||||||
Sbjct 1057  ---------GATCTGCAACTAGAGTACGGACAAGGACACCAAAGCCATTGCTTCTTAGGTGGCAACAAGAGTCT  1121

Query 1185  TCTCAAGTCTGTTGAAGAAGAATTGCATCAGCGAGGACACGTCGCACATTTAGAAGATGATGAAGGAGATGATG  1258
            |||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1122  TCTGAAGTCTGTTGAAGAGGAATTACATCAGCGAGGACATGTGGCACACTTAGAAGATGACGAAGGCGACGATG  1195

Query 1259  ATGAATCTAAACACTCAACTCTGAAAGCAAAAATTCCACCTCCTTTGCCACCAAAGCCTAAGTCTATCTTCATA  1332
            |.||.|||||.||.|||||..|||||||||||.|.||.||||||.||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1196  ACGACTCTAAGCATTCAACCATGAAAGCAAAAGTCCCGCCTCCTCTGCCACCAAAGCCTAAATCCATCTTCATA  1269

Query 1333  CCACAGGAAATGCATTCTACTGAGGATGAAAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCATGTCAGGGAGCCCAGC  1406
            ||||||||.|..||||||.|||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||...|||||||||||.||
Sbjct 1270  CCACAGGATACACATTCTGCTGAGGACGGTAATCAAGGAACAATCAAGAGATGTCCCTCATCAGGGAGCCCGGC  1343

Query 1407  AAAGCCATCCCAAGTTCCACCTAGACCACCACCTCCCAGATTACCCCCACACAAACCTGTTGCCTTAGGAAATG  1480
            ||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||||.||..||||||||||
Sbjct 1344  AAAGCCATCCCACGTTCCACCTAGACCACCTCCGCCCAGGTTACCGCCACAGAAGCCTGCTGTTTTAGGAAATG  1417

Query 1481  GAATGAGCTCCTTCCAGTTAAATGGTGAACGAGATGGCTCATTATGTCAACAACAGAATGAACATAGAGGCACA  1554
            ||.|||.||||||||||.||||||||||.|||||.||.|||||||.|||.||.||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 1418  GAGTGAACTCCTTCCAGCTAAATGGTGAGCGAGACGGATCATTATATCAGCAGCAGAGTGAGCAAAGAGGCACA  1491

Query 1555  AACCTTTCAAGAAAAGAAAAGAAAGATGTACCAAAGCCTATTAGTAATGGTCTTCCTCCAACACCTAAAGTGCA  1628
            ||||||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 1492  AACCTTTCAAGAAAGGAGAAGAAGGACGTCCCGAAACCAATTAGTAATGGTCTTCCCCCAACACCTAAAGTGCA  1565

Query 1629  TATGGGTGCATGTTTTTCAAAAGTTTTTAATGGGTGTCCCTTGAAAATTCACTGTGCATCATCATGGATAAACC  1702
            ||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||..||||.||||||||||
Sbjct 1566  TATGGGAGCGTGTTTTTCAAAGGTTTTTAATGGATGTCCCTTGAAAATCCACTGTGCCACATCCTGGATAAACC  1639

Query 1703  CAGATACAAGAGATCAGTACTTGATATTTGGTGCCGAAGAAGGGATTTATACCCTCAATCTTAATGAACTTCAT  1776
            ||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 1640  CAGACACGAGAGACCAGTACTTGATATTTGGCGCTGAAGAGGGCATTTATACCCTTAATCTCAATGAACTTCAT  1713

Query 1777  GAAACATCAATGGAACAGCTATTCCCTCGAAGGTGTACATGGTTGTATGTAATGAACAATTGCTTGCTATCAAT  1850
            ||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||.|||||||.||||||||||||.||||.|||.|
Sbjct 1714  GAAACATCAATGGAACAGCTGTTCCCCCGCAGGTGTACGTGGCTGTATGTGATGAACAATTGCCTGCTGTCAGT  1787

Query 1851  ATCTGGTAAAGCTTCTCAGCTTTATTCCCATAATTTACCAGGGCTTTTTGATTATGCAAGACAAATGCAAAAGT  1924
            .||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.|||.
Sbjct 1788  CTCGGGCAAAGCCTCTCAGCTTTACTCCCACAACTTACCGGGGCTTTTCGATTATGCAAGACAGATGCAGAAGC  1861

Query 1925  TACCTGTTGCTATTCCAGCACACAAACTCCCTGACAGAATACTGCCAAGGAAATTTTCTGTATCAGCAAAAATC  1998
            |.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||.
Sbjct 1862  TTCCAGTAGCCATCCCAGCACACAAGCTCCCCGACCGAATACTGCCCAGGAAATTTGCTGTATCAGCAAAGATT  1935

Query 1999  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGTTGTGTTGTAAGAAATCCTTACACGGGCCATAAATACCTATGTGGAGC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 1936  CCTGAAACCAAATGGTGCCAGAAGTGCTGCGTGGTGAGAAATCCTTACACGGGCCATAAGTACCTGTGCGGGGC  2009

Query 2073  ACTTCAGACTAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAACCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGATT  2146
            .||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 2010  GCTTCAGACCAGCATTGTTCTATTAGAATGGGTTGAGCCAATGCAGAAATTTATGTTAATTAAGCACATAGAGT  2083

Query 2147  TTCCTATACCATGTCCACTTAGAATGTTTGAAATGCTGGTAGTTCCTGAACAGGAGTACCCTTTAGTTTGTGTT  2220
            |||||||.||.||||||||..|.||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||.|.||.||||||
Sbjct 2084  TTCCTATGCCGTGTCCACTCCGGATGTTTGAGATGCTGGTGGTCCCTGAGCAGGAGTACCCTCTGGTCTGTGTT  2157

Query 2221  GGTGTCAGTAGAGGTAGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGATTTGAGACGGTCAATCCAAATTCTACCTCTTCATG  2294
            ||.|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.||
Sbjct 2158  GGCGTCAGCAGAGGGCGAGACTTCAACCAAGTGGTTCGGTTTGAGACGGTCAATCCCAATTCTACCTCGTCGTG  2231

Query 2295  GTTTACAGAATCAGATACCCCACAGACAAATGTTACTCATGTAACCCAACTGGAGAGAGATACCATCCTTGTAT  2368
            |||||||||.||||||.||||.|||||||..||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|
Sbjct 2232  GTTTACAGAGTCAGATGCCCCGCAGACAAGCGTCACTCATGTGACCCAGCTGGAGAGAGACACCATCCTTGTGT  2305

Query 2369  GCTTGGACTGTTGTATAAAAATAGTAAATCTCCAAGGAAGATTAAAATCTAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2442
            |||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2306  GCTTGGATTGTTGTATAAAAATAGTCAATCTCCAAGGAAGGTTGAAATCCAGCAGGAAATTGTCATCAGAACTC  2379

Query 2443  ACCTTTGATTTCCAGATTGAATCAATAGTGTGCCTACAAGACAGTGTGCTAGCTTTCTGGAAACATGGAATGCA  2516
            |||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||
Sbjct 2380  ACCTTCGATTTCCAGATAGAGTCCATAGTTTGTCTACAAGACAGTGTGCTAGCGTTCTGGAAACACGGGATGCA  2453

Query 2517  AGGTAGAAGTTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAGCACAAGAATTTTCAGGCTGCTTGGAT  2590
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||.||.|||||||
Sbjct 2454  AGGTAGAAGCTTTAGATCTAATGAGGTAACACAAGAAATTTCAGATAACACAAGAATCTTCAGACTCCTTGGAT  2527

Query 2591  CTGACAGGGTCGTGGTTTTGGAAAGTAGGCCAACTGATAACCCCACAGCAAATAGCAATTTGTACATCCTGGCG  2664
            ||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 2528  CTGACAGGGTTGTGGTTTTGGAAAGTCGGCCAACTGATAACCCAACAGCAAATAGCAATTTATACATCTTGGCG  2601

Query 2665  GGTCATGAAAACAGTTACG  2683
            |||||.||||||||.||| 
Sbjct 2602  GGTCACGAAAACAGCTAC-  2619