Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491583
- Subject:
- XM_011241138.2
- Aligned Length:
- 2641
- Identities:
- 2132
- Gaps:
- 353
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCGGGTGACGCCGTTGCCGCGGCGACTCCTCGTCGTCTCCGCCCCCTCCCCCCCCCAAATCCCCTCAGGCTC 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGCTGCGCCGGGGCCGCCGGCGGGTTCCAGAGGTGGCCTCCGCCCCGGCCGCTCCGCCCACGCCCCCCGCGCCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 CCGCGCCCGCCTCCGCCCGCCCTGCGCCTCCCTTCCCCCTCCCCGCCCCGCGGCGGCCGCTCGGCCCGGCTCGC 222
Query 1 ---------ATGGCGGCGCTGA------------------------------------------------GCGG 17
||||||||||||| ||||
Sbjct 223 GCTTCGAAGATGGCGGCGCTGAGTGGCGGCGGTGGCAGCAGCAGCGGTGGCGGCGGCGGCGGTGGCGGCGGCGG 296
Query 18 TGGCGGT---------GGTGGCGGCGCGGAGCCGGGCCAGGCTCTGTTCAACGGGGACATGGAGCCCGAGGCCG 82
||||||| ||.||||||||.||||.||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||
Sbjct 297 TGGCGGTGGCGACGGCGGCGGCGGCGCCGAGCAGGGCCAGGCTCTGTTCAATGGCGACATGGAGCCGGAG---- 366
Query 83 GCGCCGGCGCCGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCTGCCATTCCGGAGGAGGTGTGGAATATCAAACAA 156
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 367 --GCCGGCGCTGGCGCCGCGGCCTCTTCGGCTGCGGACCCGGCCATTCCTGAAGAGGTATGGAATATCAAGCAA 438
Query 157 ATGATTAAGTTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGGGAGCATAATCCACCATCAAT 230
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 439 ATGATTAAGTTGACACAGGAACATATAGAGGCCCTATTGGACAAATTTGGTGGAGAGCATAACCCACCATCAAT 512
Query 231 ATATCTGGAGGCCTATGAAGAATACACCAGCAAGCTAGATGCACTCCAACAAAGAGAACAACAGTTATTGGAAT 304
|||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 513 ATACCTGGAGGCCTATGAAGAGTACACCAGCAAGCTAGATGCCCTTCAGCAAAGAGAACAGCAGCTTTTGGAAT 586
Query 305 CTCTGGGGAACGGAACTGATTTTTCTGTTTCTAGCTCTGCATCAATGGATACCGTTACATCTTCTTCCTCTTCT 378
|.|||||.||.|||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 587 CCCTGGGTAATGGAGCAGATTTTTCTGTTTCTAGCTCTGCATCAATGGACACCGTTACATCCTCCTCCTCTTCT 660
Query 379 AGCCTTTCAGTGCTACCTTCATCTCTTTCAGTTTTTCAAAATCCCACAGATGTGGCACGGAGCAACCCCAAGTC 452
|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||...||||||.||||||||||||
Sbjct 661 AGCCTTTCAGTGCTACCATCATCTCTTTCAGTTTTTCAAACTCCCACAGATGCATCACGGAACAACCCCAAGTC 734
Query 453 ACCACAAAAACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCTGCAAGGTGTGGAGTTA 526
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 735 ACCACAGAAACCTATCGTTAGAGTCTTCCTGCCCAACAAACAGAGGACAGTGGTACCCGCAAGATGTGGTGTTA 808
Query 527 CAGTCCGAGACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTAATCCCAGAGTGCTGTGCTGTTTACAGAATT 600
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 809 CAGTTCGAGACAGTCTAAAGAAAGCACTGATGATGAGAGGTCTCATCCCAGAATGCTGTGCTGTTTACAGAATT 882
Query 601 CAGGATGG---------AGAGAAGAAACCAATTGGTTGGGACACTGATATTTCCTGGCTTACTGGAGAAGAATT 665
|||||||| ||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 883 CAGGATGGGTATGGTTTAGAGAAGAAACCAATTGGCTGGGACACGGACATTTCCTGGCTTACTGGAGAGGAGTT 956
Query 666 GCATGTGGAAGTGTTGGAGAATGTTCCACTTACAACACACAACTTTGTACGAAAAACGTTTTTCACCTTAGCAT 739
.|||||.|||||..||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct 957 ACATGTTGAAGTACTGGAGAATGTCCCACTTACAACACACAACTTTGTACGGAAAACTTTTTTCACCTTAGCAT 1030
Query 740 TTTGTGACTTTTGTCGAAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGCTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGT 813
|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1031 TTTGTGACTTTTGCCGAAAGCTGCTTTTCCAGGGTTTCCGTTGTCAAACATGTGGTTATAAATTTCACCAGCGT 1104
Query 814 TGTAGTACAGAAGTTCCACTGATGTGTGTTAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGA 887
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1105 TGTAGTACAGAGGTTCCACTGATGTGTGTAAATTATGACCAACTTGATTTGCTGTTTGTCTCCAAGTTCTTTGA 1178
Query 888 ACACCACCCAATACCACAGGAAGAGGCGTCCTTAGCAGAGACTGCCCTAACATCTGGATCATCCCCTTCCGCAC 961
.||.||||||.||||||||||.|||||.|||||..|||||||||||||..||||||| ||||.|||||||||
Sbjct 1179 GCATCACCCAGTACCACAGGAGGAGGCCTCCTTCCCAGAGACTGCCCTTCCATCTGG---ATCCTCTTCCGCAC 1249
Query 962 CCGCCTCGGACTCTATTGGGCCCCAAATTCTCACCAGTCCGTCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCC 1035
||.||||.|||||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1250 CCCCCTCAGACTCTACTGGGCCCCAAATCCTCACCAGTCCATCTCCTTCAAAATCCATTCCAATTCCACAGCCC 1323
Query 1036 TTCCGACCAGCAGATGAAGATCATCGAAATCAATTTGGGCAACGAGACCGATCCTCATCAGCTCCCAATGTGCA 1109
||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||
Sbjct 1324 TTCCGACCAGCAGATGAAGATCATCGCAATCAGTTTGGGCAACGAGACCGGTCCTCCTCAGCTCCCAATGTTCA 1397
Query 1110 TATAAACACAATAGAACCTGTCAATATTGAT------------------------------------GACTTGA 1147
||||||||||||.||.|||||.|||||.||| ||.||||
Sbjct 1398 TATAAACACAATTGAGCCTGTGAATATCGATGAAAAATTCCCAGAAGTGGAATTACAGGATCAAAGGGATTTGA 1471
Query 1148 TTAGAGACCAAGGATTTCGTGGTGATGGAGGATCAACCACAGGTTTGTCTGCTACCCCCCCTGCCTCATTACCT 1221
||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1472 TTAGAGACCAGGGGTTTCGTGGTGATGGAGGGTCAACCACAGGCTTGTCCGCCACCCCGCCTGCCTCATTACCT 1545
Query 1222 GGCTCACTAACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGACCTCAGCGAGAAAGGAAGTCATCT------TC 1289
||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||| ||
Sbjct 1546 GGCTCACTCACTAACGTGAAAGCCTTACAGAAATCTCCAGGTCCTCAGCGGGAAAGGAAGTCATCTTCTTCCTC 1619
Query 1290 ATCCTCAGAAGACAGGAATCGAATGAAAACACTTGGTAGACGGGACTCGAGTGATGATTGGGAGATTCCTGATG 1363
||||||.||.|||||.|.|||.||||||||||||||||||.|.||.||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1620 ATCCTCGGAGGACAGAAGTCGGATGAAAACACTTGGTAGAAGAGATTCAAGTGATGACTGGGAGATTCCTGATG 1693
Query 1364 GGCAGATTACAGTGGGACAAAGAATTGGATCTGGATCATTTGGAACAGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGAT 1437
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1694 GACAGATTACAGTGGGACAGAGAATTGGATCTGGGTCATTTGGAACTGTCTACAAGGGAAAGTGGCATGGTGAT 1767
Query 1438 GTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCTACACCTCAGCAGTTACAAGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGT 1511
||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1768 GTGGCAGTGAAAATGTTGAATGTGACAGCACCCACACCTCAACAGCTACAGGCCTTCAAAAATGAAGTAGGAGT 1841
Query 1512 ACTCAGGAAAACACGACATGTGAATATCCTACTCTTCATGGGCTATTCCACAAAGCCACAACTGGCTATTGTTA 1585
.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1842 GCTCAGGAAAACTCGACATGTGAATATCCTCCTTTTCATGGGCTATTCTACAAAGCCACAACTGGCAATTGTTA 1915
Query 1586 CCCAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTGTATCACCATCTCCATATCATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTT 1659
|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1916 CACAGTGGTGTGAGGGCTCCAGCTTATATCACCATCTCCACATCATTGAGACCAAATTTGAGATGATCAAACTT 1989
Query 1660 ATAGATATTGCACGACAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAA 1733
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1990 ATAGATATTGCTCGGCAGACTGCACAGGGCATGGATTACTTACACGCCAAGTCAATCATCCACAGAGACCTCAA 2063
Query 1734 GAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACAGTAAAAATAGGTGATTTTGGTCTAGCTACAGAGAAATCTC 1807
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||
Sbjct 2064 GAGTAATAATATATTTCTTCATGAAGACCTCACGGTAAAAATAGGTGACTTTGGTCTAGCCACAGTGAAATCTC 2137
Query 1808 GATGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCCATTTTGTGGATGGCACCAGAAGTCATCAGAATG 1881
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2138 GGTGGAGTGGGTCCCATCAGTTTGAACAGTTGTCTGGATCTATTTTGTGGATGGCACCAGAAGTAATCAGAATG 2211
Query 1882 CAAGATAAAAATCCATACAGCTTTCAGTCAGATGTATATGCATTTGGAATTGTTCTGTATGAATTGATGACTGG 1955
|||||||||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||||.||
Sbjct 2212 CAAGATAAAAACCCGTATAGCTTTCAGTCAGACGTGTATGCGTTTGGGATTGTTCTGTACGAACTGATGACCGG 2285
Query 1956 ACAGTTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGACCAGATAATTTTTATGGTGGGACGAGGATACCTGTCTCCAG 2029
.|||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 2286 CCAGCTACCTTATTCAAACATCAACAACAGGGATCAGATAATTTTTATGGTGGGACGAGGATACCTATCTCCAG 2359
Query 2030 ATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGA 2103
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2360 ATCTCAGTAAGGTACGGAGTAACTGTCCAAAAGCCATGAAGAGATTAATGGCAGAGTGCCTCAAAAAGAAAAGA 2433
Query 2104 GATGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCTATTGAGCTGCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCG 2177
||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2434 GACGAGAGACCACTCTTTCCCCAAATTCTCGCCTCCATTGAGCTGCTGGCCCGCTCATTGCCAAAAATTCACCG 2507
Query 2178 CAGTGCATCAGAACCCTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAGGATTTTAGTCTATATGCTTGTGCTTCTC 2251
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 2508 CAGTGCATCAGAACCTTCCTTGAATCGGGCTGGTTTCCAAACAGAAGATTTTAGTCTGTATGCTTGTGCTTCTC 2581
Query 2252 CAAAAACACCCATCCAGGCAGGGGGATATGGTGCGTTT----CCTGTCCAC 2298
|.||||||||||||||.||||||||||||||.|..||| ||| ||.|.
Sbjct 2582 CGAAAACACCCATCCAAGCAGGGGGATATGGAGAATTTGCAGCCT-TCAAG 2631