Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491585
- Subject:
- NM_001253884.1
- Aligned Length:
- 3732
- Identities:
- 3498
- Gaps:
- 234
Alignment
Query 1 ATGAATAATCAAAAAGTGGTAGCTGTGCTACTGCAAGAGTGCAAGCAAGTGCTGGATCAGCTCTTGTTGGAAGC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GCCAGATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGAGCTTTACTCCCCAGCGAGTTAAGGACCC 148
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 -----ATGTGTCGGAAGAGGACAAGAGCGAGGACCAGCGCTGCAGA---------------------------- 41
Query 149 TGATCCAGGAGGCAAAGGAAATGAAGTGGCCCTTCGTGCCTGAAAAGTGGCAGTACAAACAAGCCGTGGGCCCA 222
Sbjct 42 -------------------------------------------------------------------------- 41
Query 223 GAGGACAAAACAAACCTGAAGGATGTGATTGGCGCCGGGTTGCAGCAGTTACTGGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT 296
|||||||||||||||||||||
Sbjct 42 -----------------------------------------------------GGCGTCCCTGAGGGCCTCCAT 62
Query 297 CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 63 CCTCGCTCGGGACTGTGCGGCTGCGGCGGCTATTGTGTTCTTGGTGGACCGGTTCCTGTATGGGCTCGACGTCT 136
Query 371 CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 137 CTGGAAAACTTCTGCAGGTCGCCAAAGGTCTCCACAAGTTGCAGCCAGCCACGCCAATTGCCCCGCAGGTGGTT 210
Query 445 ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 211 ATTCGCCAAGCCCGAATCTCCGTGAACTCAGGAAAACTTTTAAAAGCAGAGTATATTCTGAGCAGTCTAATAAG 284
Query 519 CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 285 CAACAATGGAGCAACGGGTACCTGGCTGTACAGAAATGAAAGTGACAAGGTCCTGGTGCAGTCGGTCTGTATAC 358
Query 593 AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 359 AGATCAGAGGGCAGATTCTGCAAAAGCTGGGGATGTGGTACGAAGCAGCAGAGTTAATATGGGCCTCCATTGTA 432
Query 667 GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 433 GGATATTTGGCACTTCCTCAGCCGGATAAAAAGGGCCTCTCCACGTCGCTAGGTATACTGGCAGACATCTTTGT 506
Query 741 TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 507 TTCCATGAGCAAGAACGATTATGAAAAGTTTAAAAACAATCCACAAATTAATTTGAGCCTGCTGAAGGAGTTTG 580
Query 815 ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 581 ACCACCATTTGCTGTCCGCTGCAGAAGCCTGCAAGCTGGCAGCTGCCTTCAGTGCCTATACGCCGCTCTTCGTG 654
Query 889 CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 655 CTCACAGCTGTGAATATCCGTGGCACGTGTTTATTGTCCTACAGTAGTTCAAATGACTGTCCTCCAGAATTGAA 728
Query 963 AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 729 AAACTTACATCTGTGTGAAGCCAAAGAGGCCTTTGAGATTGGCCTCCTCACCAAGAGAGATGATGAGCCTGTTA 802
Query 1037 CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 803 CTGGAAAACAGGAGCTTCACAGCTTTGTCAAAGCTGCTTTCGGTCTCACCACAGTGCACAGAAGGCTCCATGGG 876
Query 1111 GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 877 GAGACAGGGACGGTCCATGCAGCAAGTCAGCTCTGTAAGGAAGCAATGGGGAAGCTGTACAATTTCAGCACTTC 950
Query 1185 CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 951 CTCCAGAAGTCAGGACAGAGAAGCTCTGTCTCAAGAAGTTATGTCTGTGATTGCCCAGGTGAAGGAACATTTAC 1024
Query 1259 AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1025 AAGTTCAAAGCTTCTCAAATGTAGATGACAGATCTTATGTTCCCGAGAGTTTCGAGTGCAGGTTGGATAAACTT 1098
Query 1333 ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1099 ATCTTGCATGGGCAAGGGGATTTCCAAAAAATCCTTGACACCTATTCACAGCACCATACTTCGGTGTGTGAAGT 1172
Query 1407 ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1173 ATTTGAAAGTGATTGTGGAAACAACAAAAATGAACAGAAAGATGCAAAAACAGGAGTCTGCATCACTGCTCTAA 1246
Query 1481 AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1247 AAACAGAAATAAAAAACATAGATACTGTGAGTACTACTCAAGAAAAGCCACATTGTCAAAGAGACACAGGAATA 1320
Query 1555 TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1321 TCTTCCTCCCTAATGGGTAAGAATGTTCAGAGGGAACTCAGAAGGGGAGGAAGGAGAAACTGGACCCATTCTGA 1394
Query 1629 TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1395 TGCATTTCGAGTCTCCTTGGATCAAGATGTGGAGACTGAGACTGAGCCATCGGACTACAGCAATGGTGAGGGAG 1468
Query 1703 CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1469 CTGTTTTCAACAAGTCTCTGAGTGGCAGCCAGACTTCCAGTGCTTGGAGCAACTTATCAGGGTTTAGTTCCTCT 1542
Query 1777 GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1543 GCAAGCTGGGAGGAAGTGAATTATCACGTTGACGACAGGTCAGCCAGAAAAGAGCCTGGCAAAGAACATCTGGT 1616
Query 1851 GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1617 GGACACTCAGTGTTCCACTGCCTTGTCTGAGGAGCTAGAGAATGACAGGGAAGGCAGAGCTATGCATTCATTGC 1690
Query 1925 ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1691 ATTCACAGCTTCATGATCTCTCTCTTCAGGAACCCAACAATGACAATTTGGAGCCTTCTCAAAATCAGCCACAG 1764
Query 1999 CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1765 CAACAGATGCCCTTGACACCCTTCTCGCCTCATAATACCCCAGGCATTTTCTTGGCCCCTGGTGCAGGGCTTCT 1838
Query 2073 AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1839 AGAAGGAGCTCCAGAAGGTATCCAGGAAGTCAGAAATATGGGACCCAGAAATACTTCTGCTCACTCCAGACCCT 1912
Query 2147 CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1913 CATATCGTTCTGCTTCTTGGTCTTCTGATTCTGGTAGGCCCAAGAATATGGGCACACATCCTTCAGTCCAAAAA 1986
Query 2221 GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1987 GAAGAAGCCTTTGAAATAATTGTTGAGTTTCCAGAAACCAACTGCGATGTCAAAGACAGGCAGGGGAAAGAGCA 2060
Query 2295 GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2061 GGGAGAAGAAATTAGTGAAAGAGGCGCAGGCCCTACATTTAAAGCTAGTCCCTCCTGGGTTGACCCAGAAGGAG 2134
Query 2369 AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2135 AAACAGCAGAAAGCACTGAAGATGCACCCTTAGACTTTCACAGGGTCCTGCACAATTCTCTGGGAAACATTTCC 2208
Query 2443 ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2209 ATGCTGCCATGTAGCTCCTTCACCCCTAATTGGCCTGTTCAAAATCCTGACTCCAGAAAAAGTGGTGGCCCAGT 2282
Query 2517 CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2283 CGCAGAGCAGGGCATCGACCCTGATGCCTCCACAGTGGATGAGGAGGGGCAACTGCTCGACAGCATGGATGTTC 2356
Query 2591 CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2357 CCTGCACAAATGGGCACGGCTCTCATAGACTGTGCATTCTGAGACAGCCGCCTGGTCAGAGGGCGGAGACCCCC 2430
Query 2665 AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2431 AATTCCTCTGTAAGCGGTAACATCCTCTTCCCTGTCCTCAGCGAGGACTGCACTACCACAGAGGAAGGAAATCA 2504
Query 2739 GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2505 GCCTGGAAACATGCTAAACTGCAGCCAGAACTCCAGCTCATCCTCAGTGTGGTGGCTGAAATCACCTGCATTTT 2578
Query 2813 CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2579 CCAGTGGTTCTTCTGAGGGGGACAGCCCTTGGTCCTATCTGAATTCCAGTGGGAGTTCTTGGGTTTCATTGCCG 2652
Query 2887 GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2653 GGAAAGATGAGGAAAGAGATCCTTGAGGCTCGCACCTTGCAACCTGATGACTTTGAAAAGCTGTTGGCAGGAGT 2726
Query 2961 GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2727 GAGGCATGATTGGCTGTTTCAGAGACTAGAGAATACGGGGGTTTTTAAGCCCAGTCAACTCCACCGAGCACATA 2800
Query 3035 GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2801 GTGCTCTTTTGTTAAAATATTCAAAAAAATCTGAACTGTGGACGGCCCAGGAAACTATTGTCTATTTGGGGGAC 2874
Query 3109 TACTTGACTGTGAAGAAAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2875 TACTTGACTGTGAAGAAAAAAGGCAGACAAAGAAATGCTTTTTGGGTTCATCATCTTCATCAAGAAGAAATTCT 2948
Query 3183 GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2949 GGGGAGGTATGTTGGGAAAGACTATAAGGAGCAGAAGGGGCTCTGGCACCACTTCACTGATGTGGAGCGACAGA 3022
Query 3257 TGACCGCACAGCACTATGTGACAGAATTTAACAAGAGACTCTATGAACAAAACATTCCCACCCAGATATTCTAC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3023 TGACCGCACAGCACTATGTGACAGAATTTAACAAGAGACTCTATGAACAAAACATTCCCACCCAGATATTCTAC 3096
Query 3331 ATCCCATCCACAATACTACTGATTTTAGAGGACAAGACAATAAAGGGATGTATCAGTGTGGAGCCTTACATACT 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3097 ATCCCATCCACAATACTACTGATTTTAGAGGACAAGACAATAAAGGGATGTATCAGTGTGGAGCCTTACATACT 3170
Query 3405 GGGAGAATTTGTAAAATTGTCAAATAACACGAAAGTGGTGAAAACAGAATACAAAGCCACAGAATATGGCTTGG 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3171 GGGAGAATTTGTAAAATTGTCAAATAACACGAAAGTGGTGAAAACAGAATACAAAGCCACAGAATATGGCTTGG 3244
Query 3479 CCTATGGCCATTTTTCTTATGAGTTTTCTAATCATAGAGATGTTGTGGTCGATTTACAAGGTTGGGTAACCGGT 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3245 CCTATGGCCATTTTTCTTATGAGTTTTCTAATCATAGAGATGTTGTGGTCGATTTACAAGGTTGGGTAACCGGT 3318
Query 3553 AATGGAAAAGGACTCATCTACCTCACAGATCCCCAGATTCACTCCGTTGATCAGAAAGTTTTCACTACCAATTT 3626
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3319 AATGGAAAAGGACTCATCTACCTCACAGATCCCCAGATTCACTCCGTTGATCAGAAAGTTTTCACTACCAATTT 3392
Query 3627 TGGAAAGAGAGGAATTTTTTACTTCTTTAATAACCAGCATGTGGAATGTAATGAAATCTGCCATCGTCTTTCTT 3700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3393 TGGAAAGAGAGGAATTTTTTACTTCTTTAATAACCAGCATGTGGAATGTAATGAAATCTGCCATCGTCTTTCTT 3466
Query 3701 TGACTAGACCTTCAATGGAGAAACCATGCACA 3732
||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3467 TGACTAGACCTTCAATGGAGAAACCATGCACA 3498