Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491644
- Subject:
- NM_001037221.2
- Aligned Length:
- 2157
- Identities:
- 1708
- Gaps:
- 294
Alignment
Query 1 ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 74
Query 72 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 145
.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ACTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTAAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTTCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 148
Query 146 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 219
|||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTGGAAGGAGAGGCCAACAGCCCGGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 222
Query 220 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 293
|||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 223 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTTCTGCTAACTCACCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGC 296
Query 294 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 367
|||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAGTATATGAAACTGCTGCCCAAGATCCTGGCACACTCTATCGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 370
Query 368 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 441
||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||..|||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATCCACCCAGCCACTTCCTTGGAAGACCGCAGCGCACTAGCCATGTGGCTGAAT 444
Query 442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 515
|||||||||||||||||.||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGGAGGACCGCACATCCACCAGCTTTGGTAGCCAGAACCGAGGCCGCTCGGACTCTGTGGATTATGGACA 518
Query 516 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 589
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACGCATTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGACGATAAGCTCAATGGCTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 592
Query 590 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 663
|||||||||.|||||||||||||||||||||.|||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 TTTGCATCAGTGCCTCCAACTGGCAGGACAAGAGCCTGGGCTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCTTCC 666
Query 664 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTAC--------------------------- 710
||.||||||||..||||||||||.||||||||||||.||.||||.||
Sbjct 667 TCGTCTGTCCCTGCCACAATCAACACGATTGGAACCGGCGCAAGCACGATTCTCTCAGGCCAGGCACACCACAG 740
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 741 CCCTTTGAAACGATCTGTGTCCCTTACCCCACCCATGAATGTGCCAAACCAGCCTCTAGGACATGGATGGATGT 814
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 815 CTCATGAGGACTTACGAGCTAGAGGACCTCAGTGCCTCCCATCCGATCATGCCCCCCTGTCTCCACAAAGCAGT 888
Query 711 -------------------------------------------------------------------------- 710
Sbjct 889 GTAGCCTCTTCAGGAAGTGGTGGGAGTGAACACTTAGAAGATCAGACCACTGCTCGTAACACATTCCAAGAAGA 962
Query 711 ---------------AAATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCC 769
|.||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.|
Sbjct 963 AGGTAGTGGTATGAAAGATGTTCCAGCTTGGTTAAAAAGCCTCCGCCTGCACAAGTACGCTGCGCTCTTCTCGC 1036
Query 770 AGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGA 843
|||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1037 AGATGACTTATGAGGAAATGATGGCCCTCACTGAGTGTCAACTGGAGGCTCAGAATGTTACCAAAGGCGCAAGA 1110
Query 844 CACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCAT 917
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACAAAATTGTAATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAGAACCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCAT 1184
Query 918 CGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCT 991
|||.||||||||||||||||.|||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGAAGGGGGCAGCCTGCGCACCCCCCTCCAGGAGCTACATCAGATGATCCTGACACCCATCAAGGCCTACAGCT 1258
Query 992 CCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAG 1065
|.||.||.||||||||.||||..|||.|||||| |||||||||||||| |||
Sbjct 1259 CTCCCAGTACCACCCCTGAGGTGCGCTGCCGGG------------------AGCCCTCACTGATG------GAG 1308
Query 1066 AGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGC---CACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAG 1136
||||..|||||.|||||||||||..|.||.||||| |||..|||||||.||||...||||.|||||.|||||
Sbjct 1309 AGCCCAAGCCCTGACTGCAAAGACAGCGCTGCAGCAGTCACCAGCGCCACAGCCAGTGCCTCAGCCGGTGCCAG 1382
Query 1137 CGGGGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACC 1210
|||.||.||.||.||.|.||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||
Sbjct 1383 CGGTGGACTGCAACCACCCCAGCTGAGCAGCTGCGACGGAGAGCTGGCTGTCGCCCCTCTGCCGGAGGGGGACC 1456
Query 1211 TCCCCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAAT 1284
||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1457 TCCCGGGGCAGTTCACCCGAGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCCGATGAAGAAAAT 1530
Query 1285 ATAAGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATT 1358
|||||.||||||.||||||||.|||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1531 ATAAGCTCCTATCTACAGCTCTTAGACAAGTGTCTTGTTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATT 1604
Query 1359 GTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGAT 1432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1605 GTTGTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGAT 1678
Query 1433 ATCGACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATG 1506
|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.||..|||||||||||.|.||||||
Sbjct 1679 ATCGACAGCAAAGAAATCGTGGCTTTGGGCAGTCCAACTCCCTCCCAACAGCCAGCTCTGTGGGCAGCGGCATG 1752
Query 1507 GGCAGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCAC 1580
||||||||||||||.||.||||||||||||.|.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||.|||||||
Sbjct 1753 GGCAGACGGAACCCACGACAGTACCAGATCGCATCTCGGAATGTCCCTTCCGCCCGCCTTGGTCTCCTGGGCAC 1826
Query 1581 CAGTGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACC 1654
|||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|.||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1827 CAGTGGATTTGTCAGCTCCAACCAGCGCCACACCGCTGCCAACCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACC 1900
Query 1655 TGTGGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCG 1728
|.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||.||||||||||
Sbjct 1901 TCTGGTTTGCCAACCCTGGGGGCAGCAACAGCATGCCCAGCCGCACCCACAGCTCCGTCCAGAAGACCCGCTCG 1974
Query 1729 CTGCCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACC 1802
|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1975 CTGCCCGTGCATACTTCCCCACAAAACATGCTGATGTTCCAGCAACCAGAATTTCAGCTTCCTGTGACTGAACC 2048
Query 1803 TGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGA 1876
||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2049 TGACATCAACAATAGGCTGGAGTCCTTGTGCCTCAGTATGACGGAGCATGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGA 2122
Query 1877 CCTCCACCATC 1887
|||||||.|||
Sbjct 2123 CCTCCACAATC 2133