Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000491644
- Subject:
- XM_024449515.1
- Aligned Length:
- 2262
- Identities:
- 1886
- Gaps:
- 375
Alignment
Query 1 ---ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 71
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGC 74
Query 72 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 145
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GCTGCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGG 148
Query 146 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 219
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCGACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAA 222
Query 220 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 293
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCCAAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGCTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGT 296
Query 294 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 367
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AGAATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGC 370
Query 368 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 441
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCTGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAAT 444
Query 442 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 515
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CACTTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACA 518
Query 516 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 589
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GACACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGA 592
Query 590 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 663
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTTGCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCC 666
Query 664 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAA------------------------- 712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCATCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAATTCTCTCAGGCCAGGCACACCACAG 740
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 741 CCCTTTGAAACGATCTGTGTCCCTTACCCCACCCATGAATGTGCCAAACCAGCCTCTAGGACATGGATGGATGT 814
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 815 CTCATGAGGACTTACGAGCTAGAGGACCCCAGTGCCTCCCATCCGATCATGCCCCCCTGTCTCCACAAAGCAGT 888
Query 713 -------------------------------------------------------------------------- 712
Sbjct 889 GTAGCCTCTTCAGGAAGTGGTGGGAGTGAACACTTAGAAGATCAGACCACTGCTCGTAACACATTCCAAGAAGA 962
Query 713 -----------------ATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCC 769
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGTAGTGGGATGAAAGATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCC 1036
Query 770 AGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGA 843
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGA 1110
Query 844 CACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCAT 917
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACAAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCAT 1184
Query 918 CGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCT 991
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGAGGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCT 1258
Query 992 CCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAG 1065
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CCCCGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAG 1332
Query 1066 AGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGG 1139
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AGCCAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGG 1406
Query 1140 GGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCC 1213
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGGGCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCC 1480
Query 1214 CCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATA 1287
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCGGGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATA 1554
Query 1288 AGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTT 1361
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGTTCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTT 1628
Query 1362 GTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATC 1435
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GTCATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATC 1702
Query 1436 GACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGC 1509
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 GACAGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGC 1776
Query 1510 AGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAG 1583
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 AGACGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAG 1850
Query 1584 TGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGT 1657
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TGGATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGT 1924
Query 1658 GGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTG 1731
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 GGTTTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTG 1998
Query 1732 CCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCC------------------------------ 1775
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCCGTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGGTTCCCAAGTTCACAGTGGACTGTGTTT 2072
Query 1776 -------------------------------------------------------------------------- 1775
Sbjct 2073 AACAGACCTTAGAGGTTGGTTGAGCCTGAGTGGAGCCCCTTCCATGCCAGCGCTGACAGTCCCCAAGTCCTCCC 2146
Query 1776 ----AGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACC 1845
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 AGGGAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACC 2220
Query 1846 GAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 1887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 GAACACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC 2262