Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000491644
• Subject: XM_024449518.1
• Aligned Length: 2259
• Identities: 1587
• Gaps: 672

Alignment

Query    1  ATGTTTCGCGACCAGGTCGGGGTGCTGGCGGGCTGGTTTAAGGGCTGGAACGAGTGCGAGCAGACTGTTGCGCT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GCTGTCGCTGCTCAAGCGCGTGAGCCAGACCCAGGCCCGCTTCCTCCAGCTCTGCCTGGAGCACTCGCTGGCCG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  ACTGCGCCGAGCTGCACGTCCTCGAACGCGAGGCCAACAGCCCCGGAATCATTAACCAATGGCAACAGGAATCC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  AAGGATAAAGTGATTTCCCTCCTGTTAACTCATCTGCCTTTGTTGAAGCCAGGAAACCTCGACGCGAAAGTAGA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  ATATATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC  370
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----ATGAAACTGCTGCCCAAAATCCTGGCTCACTCTATTGAACACAACCAGCACATTGAGGAGAGCAGGCAGC  70

Query  371  TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   71  TGCTGTCCTATGCTTTGATACATCCAGCCACTTCGTTAGAAGACCGTAGTGCTTTAGCCATGTGGCTGAATCAC  144

Query  445  TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  145  TTGGAGGACCGCACGTCGACCAGCTTTGGTGGCCAGAACCGAGGCCGCTCAGACTCTGTGGATTATGGACAGAC  218

Query  519  ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  219  ACACTACTATCACCAAAGACAGAACTCTGATGACAAGCTCAATGGGTGGCAGAACTCTCGGGATTCTGGGATTT  292

Query  593  GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  293  GCATCAATGCCTCCAACTGGCAGGACAAAAGCATGGGGTGTGAGAATGGCCATGTGCCCCTCTACTCCTCCTCA  366

Query  667  TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAA----------------------------  712
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                            
Sbjct  367  TCTGTCCCCACCACAATCAATACGATTGGAACCAGCACAAGTACAATTCTCTCAGGCCAGGCACACCACAGCCC  440

Query  713  --------------------------------------------------------------------------  712
                                                                                      
Sbjct  441  TTTGAAACGATCTGTGTCCCTTACCCCACCCATGAATGTGCCAAACCAGCCTCTAGGACATGGATGGATGTCTC  514

Query  713  --------------------------------------------------------------------------  712
                                                                                      
Sbjct  515  ATGAGGACTTACGAGCTAGAGGACCCCAGTGCCTCCCATCCGATCATGCCCCCCTGTCTCCACAAAGCAGTGTA  588

Query  713  --------------------------------------------------------------------------  712
                                                                                      
Sbjct  589  GCCTCTTCAGGAAGTGGTGGGAGTGAACACTTAGAAGATCAGACCACTGCTCGTAACACATTCCAAGAAGAAGG  662

Query  713  --------------ATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGA  772
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  663  TAGTGGGATGAAAGATGTTCCAGCCTGGCTGAAAAGCCTCCGCCTGCACAAATATGCCGCGCTTTTCTCCCAGA  736

Query  773  TGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACAC  846
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  737  TGACCTATGAGGAGATGATGGCCCTCACCGAGTGCCAGCTGGAGGCGCAGAATGTTACCAAAGGTGCAAGACAC  810

Query  847  AAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGA  920
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  811  AAAATTGTCATCAGTATTCAGAAGCTCAAAGAAAGACAAAATCTCCTGAAGTCTTTGGAAAGGGACATCATCGA  884

Query  921  GGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCC  994
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  885  GGGGGGCAGCCTGCGCATCCCGCTCCAGGAACTGCACCAGATGATCCTGACTCCGATCAAGGCCTACAGCTCCC  958

Query  995  CGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGC  1068
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  959  CGAGCACCACCCCCGAGGCTCGCCGCCGGGAGCCCCAGGCCCCGCGTCAGCCCTCACTGATGGGCCCCGAGAGC  1032

Query 1069  CAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGG  1142
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033  CAGAGCCCCGACTGCAAAGATGGGGCCGCAGCCACTGGCGCCACGGCCACCCCCTCGGCCGGGGCCAGCGGGGG  1106

Query 1143  GCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCG  1216
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107  GCTCCAGCCGCACCAGCTGAGCAGCTGCGATGGGGAGCTGGCCGTCGCCCCCCTGCCAGAGGGGGACCTCCCCG  1180

Query 1217  GGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGT  1290
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181  GGCAGTTCACACGCGTCATGGGGAAAGTGTGCACACAGCTCTTGGTCTCCAGACCTGATGAGGAAAATATAAGT  1254

Query 1291  TCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTC  1364
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255  TCCTATTTACAGCTCATAGACAAGTGTCTAATTCATGAGGCATTTACAGAGACACAGAAAAAAAGATTGTTGTC  1328

Query 1365  ATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGAC  1438
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329  ATGGAAACAGCAGGTGCAGAAGCTCTTTCGGTCTTTCCCTCGGAAAACCCTTCTAGACATATCAGGATATCGAC  1402

Query 1439  AGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGA  1512
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1403  AGCAAAGAAATCGAGGCTTTGGGCAATCCAACTCCCTCCCGACGGCTGGCTCTGTGGGCGGTGGCATGGGCAGA  1476

Query 1513  CGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGG  1586
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1477  CGGAACCCGCGCCAGTACCAGATCCCCTCTCGGAACGTCCCTTCCGCCCGCCTGGGCCTCTTGGGCACCAGTGG  1550

Query 1587  ATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGT  1660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1551  ATTCGTCAGCTCCAACCAGCGCAACACCACAGCTACCCCCACCATCATGAAACAAGGAAGACAGAACCTGTGGT  1624

Query 1661  TTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCC  1734
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1625  TTGCCAACCCCGGGGGCAGCAATAGCATGCCAAGCCGCACCCACAGCTCAGTCCAGAGGACCCGCTCGCTGCCC  1698

Query 1735  GTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCC---------------------------------  1775
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                                 
Sbjct 1699  GTGCACACTTCCCCACAGAACATGCTGATGTTCCAGCAGCCAGGTTCCCAAGTTCACAGTGGACTGTGTTTAAC  1772

Query 1776  --------------------------------------------------------------------------  1775
                                                                                      
Sbjct 1773  AGACCTTAGAGGTTGGTTGAGCCTGAGTGGAGCCCCTTCCATGCCAGCGCTGACAGTCCCCAAGTCCTCCCAGG  1846

Query 1776  -AGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAA  1848
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1847  GAGAATTCCAGCTTCCCGTGACCGAACCTGACATCAACAACAGGCTGGAGTCGTTGTGCCTCAGTATGACCGAA  1920

Query 1849  CACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1921  CACGCCCTGGGAGACGGGGTTGACCGGACCTCCACCATC  1959